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无乳链球菌感染卵形鲳鲹脾脏转录组学分析
被引量:
1
1
作者
卞泽昌
陈健安
+5 位作者
王亚丹
黄壮
杜春民
蔡小辉
胥鹏
关杰耀
《生物化工》
CAS
2023年第3期17-21,25,共6页
无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)是卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)的主要病原之一,可造成严重的经济损失。为探索卵形鲳鲹感染无乳链球菌后的分子机制,本研究通过转录组测序(RNA-seq)术获得卵形鲳鲹脾脏转录组图谱进行分析。结果显...
无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)是卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)的主要病原之一,可造成严重的经济损失。为探索卵形鲳鲹感染无乳链球菌后的分子机制,本研究通过转录组测序(RNA-seq)术获得卵形鲳鲹脾脏转录组图谱进行分析。结果显示,感染6 h和24 h脾脏中分别鉴定出4749个和8651个差异表达基因(DEGs)。GO分析表明,DEGs主要分布在不同的GO条目中。KEGG富集分析发现,38条信号通路分别在两个时间点显著富集。趋势分析结果发现,DEGs具有时间特异性,并形成4种与感染时间密切相关的不同表达谱。针对趋势分析的KEGG富集分析表明,DEGs在产生IgA的肠道免疫网络、Th1和Th2细胞分化、白细胞经内皮迁移、造血细胞谱系、Th17细胞分化、T细胞受体信号通路和胞质DNA传感途径等免疫途径上富集,其中6条通路显著下调,1条通路显著上调,说明大多数免疫相关基因受到抑制,只有少数免疫相关基因受到上调。表明无乳链球菌可能抑制大多数免疫相关基因和免疫相关通路,只有上调的免疫相关基因和通路才可能在宿主抵抗外来细菌入侵的免疫防御中发挥作用。这些研究结果为卵形鲳鲹无乳链球菌感染的免疫防御机制提供了新的见解。
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关键词
卵形鲳鲹
无乳链球菌
免疫基因
信号通路
趋势分析
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题名
无乳链球菌感染卵形鲳鲹脾脏转录组学分析
被引量:
1
1
作者
卞泽昌
陈健安
王亚丹
黄壮
杜春民
蔡小辉
胥鹏
关杰耀
机构
广西大学动物科学技术学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室
北部湾大学海洋学院广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室
出处
《生物化工》
CAS
2023年第3期17-21,25,共6页
基金
广西科技基地和人才专项(桂科AD19245059)
广西自然科学基金项目(2019GXNSFBA245062)
+1 种基金
北部湾大学高层次人才科研启动项目(2019KYQD15)
广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2019KY0464)。
文摘
无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)是卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)的主要病原之一,可造成严重的经济损失。为探索卵形鲳鲹感染无乳链球菌后的分子机制,本研究通过转录组测序(RNA-seq)术获得卵形鲳鲹脾脏转录组图谱进行分析。结果显示,感染6 h和24 h脾脏中分别鉴定出4749个和8651个差异表达基因(DEGs)。GO分析表明,DEGs主要分布在不同的GO条目中。KEGG富集分析发现,38条信号通路分别在两个时间点显著富集。趋势分析结果发现,DEGs具有时间特异性,并形成4种与感染时间密切相关的不同表达谱。针对趋势分析的KEGG富集分析表明,DEGs在产生IgA的肠道免疫网络、Th1和Th2细胞分化、白细胞经内皮迁移、造血细胞谱系、Th17细胞分化、T细胞受体信号通路和胞质DNA传感途径等免疫途径上富集,其中6条通路显著下调,1条通路显著上调,说明大多数免疫相关基因受到抑制,只有少数免疫相关基因受到上调。表明无乳链球菌可能抑制大多数免疫相关基因和免疫相关通路,只有上调的免疫相关基因和通路才可能在宿主抵抗外来细菌入侵的免疫防御中发挥作用。这些研究结果为卵形鲳鲹无乳链球菌感染的免疫防御机制提供了新的见解。
关键词
卵形鲳鲹
无乳链球菌
免疫基因
信号通路
趋势分析
Keywords
Trachinotus ovatus
Streptococcus agalactiae
immune gene
signaling pathway
trend analysis
分类号
S941.42 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
无乳链球菌感染卵形鲳鲹脾脏转录组学分析
卞泽昌
陈健安
王亚丹
黄壮
杜春民
蔡小辉
胥鹏
关杰耀
《生物化工》
CAS
2023
1
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