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基于两样本孟德尔随机化研究分析肠道菌群与再生障碍性贫血之间的因果关系
1
作者
卢传丹
《延安大学学报(医学科学版)》
2024年第3期24-30,共7页
目的本研究旨在利用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探索肠道菌群与再生障碍性贫血(aplastic anemia,AA)之间的因果关系。方法肠道菌群遗传数据全基因组关联统计学显著性意义水平设置为P<1×10^(-5)以及r^(2...
目的本研究旨在利用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探索肠道菌群与再生障碍性贫血(aplastic anemia,AA)之间的因果关系。方法肠道菌群遗传数据全基因组关联统计学显著性意义水平设置为P<1×10^(-5)以及r^(2)=0.001和clumping距离=10000 kb以消除连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)。剩余的强相关联且独立的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)作为遗传工具变量(instrumental variants,IV)用于MR分析。敏感性分析包括MR-PRESSO global检验、MR-Egger intercept检验、Cochran's Q检验和留一法。结果总共8种肠道微生物群包含109个SNP被纳入研究。结果显示包括Bacteroidetes门、Bacteroidia纲、Bacteroidales目、Anaerotruncus属、Eubacterium hallii group属、Family XIII UCG001属和Intestinibacter属均与AA发病风险呈正相关(OR_(IVW)=1.343,95%CI 1.030~1.752,PIVW=0.029;OR_(IVW)=1.386,95%CI 1.094~1.757,PIVW=0.007;OR_(IVW)=1.386,95%CI 1.094~1.757,PIVW=0.007;OR_(IVW)=1.365,95%CI 1.036~1.799,PIVW=0.027;OR_(IVW)=1.224,95%CI 1.008~1.488,PIVW=0.042;OR_(IVW)=1.399,95%CI 1.085~1.804,PIVW=0.010;OR_(IVW)=1.244,95%CI 1.034~1.497,PIVW=0.021)。相反,Parasutterella属与AA发病风险呈负相关(OR_(IVW)=0.835,95%CI 0.703-0.992,PIVW=0.041)。逆向MR没有观察到AA对肠道菌群存在因果效应。结论两样本MR方法证实肠道菌群对AA存在潜在的因果作用,两者之间的因果联系的具体机制有待进一步探索。
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关键词
肠道菌群
再生障碍性贫血
孟德尔随机化
单核苷酸多态性
遗传工具变量
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题名
基于两样本孟德尔随机化研究分析肠道菌群与再生障碍性贫血之间的因果关系
1
作者
卢传丹
机构
江南大学附属医院胸腹部放疗科
出处
《延安大学学报(医学科学版)》
2024年第3期24-30,共7页
文摘
目的本研究旨在利用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探索肠道菌群与再生障碍性贫血(aplastic anemia,AA)之间的因果关系。方法肠道菌群遗传数据全基因组关联统计学显著性意义水平设置为P<1×10^(-5)以及r^(2)=0.001和clumping距离=10000 kb以消除连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)。剩余的强相关联且独立的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)作为遗传工具变量(instrumental variants,IV)用于MR分析。敏感性分析包括MR-PRESSO global检验、MR-Egger intercept检验、Cochran's Q检验和留一法。结果总共8种肠道微生物群包含109个SNP被纳入研究。结果显示包括Bacteroidetes门、Bacteroidia纲、Bacteroidales目、Anaerotruncus属、Eubacterium hallii group属、Family XIII UCG001属和Intestinibacter属均与AA发病风险呈正相关(OR_(IVW)=1.343,95%CI 1.030~1.752,PIVW=0.029;OR_(IVW)=1.386,95%CI 1.094~1.757,PIVW=0.007;OR_(IVW)=1.386,95%CI 1.094~1.757,PIVW=0.007;OR_(IVW)=1.365,95%CI 1.036~1.799,PIVW=0.027;OR_(IVW)=1.224,95%CI 1.008~1.488,PIVW=0.042;OR_(IVW)=1.399,95%CI 1.085~1.804,PIVW=0.010;OR_(IVW)=1.244,95%CI 1.034~1.497,PIVW=0.021)。相反,Parasutterella属与AA发病风险呈负相关(OR_(IVW)=0.835,95%CI 0.703-0.992,PIVW=0.041)。逆向MR没有观察到AA对肠道菌群存在因果效应。结论两样本MR方法证实肠道菌群对AA存在潜在的因果作用,两者之间的因果联系的具体机制有待进一步探索。
关键词
肠道菌群
再生障碍性贫血
孟德尔随机化
单核苷酸多态性
遗传工具变量
Keywords
Gut microbiota
Aplastic anemia
Mendelian randomization
Single nucleotide polymorphisms
Genetic instrumental variants
分类号
R552 [医药卫生—血液循环系统疾病]
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作者
出处
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1
基于两样本孟德尔随机化研究分析肠道菌群与再生障碍性贫血之间的因果关系
卢传丹
《延安大学学报(医学科学版)》
2024
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