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桑树小分子热激蛋白基因的鉴定及在逆境胁迫下的表达
被引量:
4
1
作者
卢承琼
曾其伟
+1 位作者
向仲怀
何宁佳
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期965-973,共9页
小分子热激蛋白(s Hsp)在植物抵抗非生物胁迫过程中起重要作用。采用生物信息学方法,在川桑(Morus notabilis)基因组中鉴定了29个桑树s Hsp基因,基于进化关系及亚细胞定位将其分为13个亚家族和1个孤儿基因。13个桑树s Hsp基因亚家族中,...
小分子热激蛋白(s Hsp)在植物抵抗非生物胁迫过程中起重要作用。采用生物信息学方法,在川桑(Morus notabilis)基因组中鉴定了29个桑树s Hsp基因,基于进化关系及亚细胞定位将其分为13个亚家族和1个孤儿基因。13个桑树s Hsp基因亚家族中,CⅫ和CⅩⅢ属于植物s Hsp的2个新的亚家族;预测有4个桑树s Hsp基因的启动子中各具1个完整热激元件(HSE),在桑树s Hsp基因的启动子中可能还包含其他响应非生物胁迫的元件。采用定量PCR方法检测非生物胁迫下印度桑(Morus indica)品种K2的叶片中10个桑树s Hsp基因都能快速地响应高温胁迫,分别有5、9、7个桑树s Hsp基因响应低温、盐分和干旱胁迫,其中Mn15.7-CⅤ基因在4种逆境胁迫下的表达均被抑制,并在高温胁迫5 min后表达显著下调。研究结果提示s Hsp可能在桑树抵抗非生物逆境胁迫的过程中发挥重要作用。
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关键词
桑树
小分子热激蛋白
家族成员
基因表达
非生物胁迫
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职称材料
桑树SV分子标记的开发及在F_1群体的偏分离分析
被引量:
3
2
作者
帅琴
罗义维
+2 位作者
卢承琼
王裕鹏
何宁佳
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期374-381,共8页
SV(structure variation)标记是基于基因组结构变异的一种分子标记。为推动桑树遗传图谱的构建,以已完成全基因组测序的川桑(Morus notabilis)基因组为参考序列,利用桑品种伦教109和珍珠白的基因组重测序数据开发了110对桑树SV标记,其中...
SV(structure variation)标记是基于基因组结构变异的一种分子标记。为推动桑树遗传图谱的构建,以已完成全基因组测序的川桑(Morus notabilis)基因组为参考序列,利用桑品种伦教109和珍珠白的基因组重测序数据开发了110对桑树SV标记,其中100对SV标记能在伦教109×珍珠白的F1群体中检测到多态性,多态性位点为169个,75.1%(P<0.05)的SV标记在伦教109×珍珠白的F1群体中表现为偏分离。分析SV标记在F1群体中的分离模式,推测在亲本品种伦教109和珍珠白中,至少有一个不是异源四倍体。
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关键词
桑树
SV标记
多态性
偏分离
分离模式
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职称材料
桑树杂交组合亲本的SSR标记多态性及遗传背景分析
被引量:
5
3
作者
罗义维
亓希武
+5 位作者
帅琴
王裕鹏
卢承琼
向仲怀
唐翠明
何宁佳
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期576-581,共6页
在对PCR反应体系进行正交试验优化的基础上,采用2 878对SSR分子标记分析以桑树品种伦教109作为父本,珍珠白和粤武2号分别作为母本的2对杂交组合亲本间的多态性。结果表明,桑树杂交组合珍珠白×伦教109亲本间的多态性为69%,粤武2号...
在对PCR反应体系进行正交试验优化的基础上,采用2 878对SSR分子标记分析以桑树品种伦教109作为父本,珍珠白和粤武2号分别作为母本的2对杂交组合亲本间的多态性。结果表明,桑树杂交组合珍珠白×伦教109亲本间的多态性为69%,粤武2号×伦教109亲本间的多态性为54%。选用珍珠白×伦教109的F1群体进行SSR分子标记遗传连锁分析,对亲本的遗传背景分析发现:在母本珍珠白中,相引相分子标记数目为58对,相斥相分子标记数目为70对,符合1∶1分离比;而在父本伦教109中则没有检测到相斥相分子标记对。据此推测桑树品种珍珠白可能为异源四倍体,而伦教109可能为同源四倍体。
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关键词
桑树
简单重复序列标记
多态性
染色体组来源
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职称材料
题名
桑树小分子热激蛋白基因的鉴定及在逆境胁迫下的表达
被引量:
4
1
作者
卢承琼
曾其伟
向仲怀
何宁佳
机构
家蚕基因组生物学国家重点实验室
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期965-973,共9页
基金
国家高技术研究计划"863"项目(No.2013AA100605)
商务部市场运行司茧丝绸产业公共服务体系建设项目(No.3)
文摘
小分子热激蛋白(s Hsp)在植物抵抗非生物胁迫过程中起重要作用。采用生物信息学方法,在川桑(Morus notabilis)基因组中鉴定了29个桑树s Hsp基因,基于进化关系及亚细胞定位将其分为13个亚家族和1个孤儿基因。13个桑树s Hsp基因亚家族中,CⅫ和CⅩⅢ属于植物s Hsp的2个新的亚家族;预测有4个桑树s Hsp基因的启动子中各具1个完整热激元件(HSE),在桑树s Hsp基因的启动子中可能还包含其他响应非生物胁迫的元件。采用定量PCR方法检测非生物胁迫下印度桑(Morus indica)品种K2的叶片中10个桑树s Hsp基因都能快速地响应高温胁迫,分别有5、9、7个桑树s Hsp基因响应低温、盐分和干旱胁迫,其中Mn15.7-CⅤ基因在4种逆境胁迫下的表达均被抑制,并在高温胁迫5 min后表达显著下调。研究结果提示s Hsp可能在桑树抵抗非生物逆境胁迫的过程中发挥重要作用。
关键词
桑树
小分子热激蛋白
家族成员
基因表达
非生物胁迫
Keywords
Morus L.
Small heat shock protein
Family member
Gene expression
Abiotic stress
分类号
S888.2 [农业科学—特种经济动物饲养]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
桑树SV分子标记的开发及在F_1群体的偏分离分析
被引量:
3
2
作者
帅琴
罗义维
卢承琼
王裕鹏
何宁佳
机构
家蚕基因组生物学国家重点实验室
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期374-381,共8页
基金
国家高技术研究发展计划"863"项目(No.2013AA100605)
文摘
SV(structure variation)标记是基于基因组结构变异的一种分子标记。为推动桑树遗传图谱的构建,以已完成全基因组测序的川桑(Morus notabilis)基因组为参考序列,利用桑品种伦教109和珍珠白的基因组重测序数据开发了110对桑树SV标记,其中100对SV标记能在伦教109×珍珠白的F1群体中检测到多态性,多态性位点为169个,75.1%(P<0.05)的SV标记在伦教109×珍珠白的F1群体中表现为偏分离。分析SV标记在F1群体中的分离模式,推测在亲本品种伦教109和珍珠白中,至少有一个不是异源四倍体。
关键词
桑树
SV标记
多态性
偏分离
分离模式
Keywords
Morus L.
SV marker
Polymorphism
Segregation distortion
Segregation pattern
分类号
S888 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
桑树杂交组合亲本的SSR标记多态性及遗传背景分析
被引量:
5
3
作者
罗义维
亓希武
帅琴
王裕鹏
卢承琼
向仲怀
唐翠明
何宁佳
机构
家蚕基因组生物学国家重点实验室西南大学蚕学与系统生物学研究所
广东省农业科学院蚕业与农产品加工研究所
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期576-581,共6页
基金
国家高技术研究发展计划“863”项目(No.2013AA100605)
文摘
在对PCR反应体系进行正交试验优化的基础上,采用2 878对SSR分子标记分析以桑树品种伦教109作为父本,珍珠白和粤武2号分别作为母本的2对杂交组合亲本间的多态性。结果表明,桑树杂交组合珍珠白×伦教109亲本间的多态性为69%,粤武2号×伦教109亲本间的多态性为54%。选用珍珠白×伦教109的F1群体进行SSR分子标记遗传连锁分析,对亲本的遗传背景分析发现:在母本珍珠白中,相引相分子标记数目为58对,相斥相分子标记数目为70对,符合1∶1分离比;而在父本伦教109中则没有检测到相斥相分子标记对。据此推测桑树品种珍珠白可能为异源四倍体,而伦教109可能为同源四倍体。
关键词
桑树
简单重复序列标记
多态性
染色体组来源
Keywords
Morus L.
Simple sequence repeat
Polymorphism
Source of genomics
分类号
S888.2 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
桑树小分子热激蛋白基因的鉴定及在逆境胁迫下的表达
卢承琼
曾其伟
向仲怀
何宁佳
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
4
下载PDF
职称材料
2
桑树SV分子标记的开发及在F_1群体的偏分离分析
帅琴
罗义维
卢承琼
王裕鹏
何宁佳
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
下载PDF
职称材料
3
桑树杂交组合亲本的SSR标记多态性及遗传背景分析
罗义维
亓希武
帅琴
王裕鹏
卢承琼
向仲怀
唐翠明
何宁佳
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
5
下载PDF
职称材料
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