应用网络药理学方法及分子对接技术探析逍遥散治疗肝郁脾虚型抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的作用机制,为中药"异病同治"科学内涵的诠释提供理论依据。利用中药数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology...应用网络药理学方法及分子对接技术探析逍遥散治疗肝郁脾虚型抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的作用机制,为中药"异病同治"科学内涵的诠释提供理论依据。利用中药数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)获取和筛选逍遥散的活性成分,并将其与现有的治疗上述3种疾病的药物进行主成分分析(principal component analysis, PCA)判断其生物活性;结合GeneCards数据库、TTD数据库、CTD数据库和DrugBank数据库获取疾病靶点同时得到逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的作用靶点。采用Cytoscape软件绘制逍遥散"异病同治"的"单味药-活性成分-共同靶点"网络图,寻找核心靶点,然后对共有靶点进行Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路分析和gene ontology(GO)富集分析。该研究收集得到逍遥散活性成分121个,逍遥散"异病同治"共有靶点38个,关键生物通路包括糖尿病并发症中的advanced glycation and products(AGEs)-receptor for advanced glycation and products(RAGE)信号通路、HIF-1信号通路以及癌症相关通路等。逍遥散"异病同治"抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的关键靶点为IL6、IL4和TNF等,关键活性成分有山柰酚、槲皮素和芦荟大黄素等。最后,分子对接结果表明,关键活性成分与靶点之间具有很强的亲和力,验证了实验结果。逍遥散可能是通过减少炎症反应治疗肝郁脾虚型疾病。研究结果为阐释中药复方"异病同治"科学内涵提供了新的思路与方法,也将为深入了解逍遥散效应机制、探索其新的临床应用提供了理论依据。展开更多
目的运用网络药理学技术探讨逍遥散与文拉法辛联用抗抑郁的作用机制。方法通过TCMSP、PubChem、OMIM、GeneCards以及UniProt等数据库获得逍遥散和文拉法辛治疗抑郁症的作用靶点;利用STRING网站得到蛋白互作网络;并通过Metascape网站对...目的运用网络药理学技术探讨逍遥散与文拉法辛联用抗抑郁的作用机制。方法通过TCMSP、PubChem、OMIM、GeneCards以及UniProt等数据库获得逍遥散和文拉法辛治疗抑郁症的作用靶点;利用STRING网站得到蛋白互作网络;并通过Metascape网站对潜在作用靶点进行富集分析;使用Cytoscape软件绘制"靶点-成分-通路"可视化网络图。结果逍遥散主要通过芍药苷、刺槐素、儿茶素、槲皮素等化学成分和文拉法辛联合作用发挥抗抑郁作用。逍遥散和文拉法辛治疗抑郁症的相关靶点共208个,主要为酪氨酸蛋白激酶(SRC)、信号转导和转录激活器3(STAT3)、转录因子AP-1(JUN)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)等。这些主要靶点作用于糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、癌症通路(pathways in cancer)等43条通路,调节对受损的应答(response to wounding)、对无机物的应答(response to inorganic substance)以及细胞成分运动的正向调节(positive regulation of cellular component movement)、血液循环(blood circulation)和有机羟基化合物代谢过程(organic hydroxy compound metabolic process)等生物学过程发挥抗抑郁作用。结论逍遥散与文拉法辛联用通过多靶点、多通路发挥抗抑郁作用,利用网络药理学预测中西药联合治疗疾病的作用机制值得深入探讨。展开更多
文摘应用网络药理学方法及分子对接技术探析逍遥散治疗肝郁脾虚型抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的作用机制,为中药"异病同治"科学内涵的诠释提供理论依据。利用中药数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)获取和筛选逍遥散的活性成分,并将其与现有的治疗上述3种疾病的药物进行主成分分析(principal component analysis, PCA)判断其生物活性;结合GeneCards数据库、TTD数据库、CTD数据库和DrugBank数据库获取疾病靶点同时得到逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的作用靶点。采用Cytoscape软件绘制逍遥散"异病同治"的"单味药-活性成分-共同靶点"网络图,寻找核心靶点,然后对共有靶点进行Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路分析和gene ontology(GO)富集分析。该研究收集得到逍遥散活性成分121个,逍遥散"异病同治"共有靶点38个,关键生物通路包括糖尿病并发症中的advanced glycation and products(AGEs)-receptor for advanced glycation and products(RAGE)信号通路、HIF-1信号通路以及癌症相关通路等。逍遥散"异病同治"抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的关键靶点为IL6、IL4和TNF等,关键活性成分有山柰酚、槲皮素和芦荟大黄素等。最后,分子对接结果表明,关键活性成分与靶点之间具有很强的亲和力,验证了实验结果。逍遥散可能是通过减少炎症反应治疗肝郁脾虚型疾病。研究结果为阐释中药复方"异病同治"科学内涵提供了新的思路与方法,也将为深入了解逍遥散效应机制、探索其新的临床应用提供了理论依据。
文摘目的运用网络药理学技术探讨逍遥散与文拉法辛联用抗抑郁的作用机制。方法通过TCMSP、PubChem、OMIM、GeneCards以及UniProt等数据库获得逍遥散和文拉法辛治疗抑郁症的作用靶点;利用STRING网站得到蛋白互作网络;并通过Metascape网站对潜在作用靶点进行富集分析;使用Cytoscape软件绘制"靶点-成分-通路"可视化网络图。结果逍遥散主要通过芍药苷、刺槐素、儿茶素、槲皮素等化学成分和文拉法辛联合作用发挥抗抑郁作用。逍遥散和文拉法辛治疗抑郁症的相关靶点共208个,主要为酪氨酸蛋白激酶(SRC)、信号转导和转录激活器3(STAT3)、转录因子AP-1(JUN)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)等。这些主要靶点作用于糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、癌症通路(pathways in cancer)等43条通路,调节对受损的应答(response to wounding)、对无机物的应答(response to inorganic substance)以及细胞成分运动的正向调节(positive regulation of cellular component movement)、血液循环(blood circulation)和有机羟基化合物代谢过程(organic hydroxy compound metabolic process)等生物学过程发挥抗抑郁作用。结论逍遥散与文拉法辛联用通过多靶点、多通路发挥抗抑郁作用,利用网络药理学预测中西药联合治疗疾病的作用机制值得深入探讨。