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基于转录组测序的斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)干旱胁迫应答基因表达分析
1
作者
王玮
王悦
+2 位作者
厉万荣
王浩澎
杨宁
《中国沙漠》
CSCD
北大核心
2022年第6期204-210,共7页
荒漠植物斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)主要分布在中国西北地区的固定或半固定沙漠,具有较高的干旱环境适应能力,但对它的干旱胁迫耐受分子机制研究较少。本研究利用Illumina测序技术筛选斧翅沙芥干旱应答基因,通过转录组的从头组装,...
荒漠植物斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)主要分布在中国西北地区的固定或半固定沙漠,具有较高的干旱环境适应能力,但对它的干旱胁迫耐受分子机制研究较少。本研究利用Illumina测序技术筛选斧翅沙芥干旱应答基因,通过转录组的从头组装,共获得154875个unigenes,平均长度为1437个碱基。干旱胁迫后,共有13855个基因表达发生显著变化,其中7182个基因上调表达,6673个基因下调表达。GO功能富集分析表明差异表达基因显著富集到物质代谢、氧化还原和催化活性等功能;KEGG通路富集分析表明差异表达基因显著富集到氨基酸代谢、淀粉和糖代谢以及植物激素信号转导等途径。此外,鉴定到47个干旱诱导转录因子家族,主要包括HSF、ERF、WRKY、MYB、bHLH等。与沙芥相比,淀粉和糖代谢途径以及大量热胁迫转录因子在干旱胁迫后上调表达有可能是斧翅沙芥提高干旱胁迫耐受能力的特殊途径。本研究的结果初步揭示了斧翅沙芥对抗干旱胁迫的调控特征,为进一步理解斧翅沙芥干旱环境适应的分子机制提供线索。
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关键词
斧翅沙芥(Pugionium
dolabratum)
干旱胁迫
转录组
转录因子
原文传递
题名
基于转录组测序的斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)干旱胁迫应答基因表达分析
1
作者
王玮
王悦
厉万荣
王浩澎
杨宁
机构
西北师范大学生命科学学院
出处
《中国沙漠》
CSCD
北大核心
2022年第6期204-210,共7页
基金
国家自然科学基金项目(32060168)
甘肃省高等学校创新能力提升项目(2019B-040)
西北师范大学青年教师科研能力提升计划项目(NWNU-LKQN-17-4)。
文摘
荒漠植物斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)主要分布在中国西北地区的固定或半固定沙漠,具有较高的干旱环境适应能力,但对它的干旱胁迫耐受分子机制研究较少。本研究利用Illumina测序技术筛选斧翅沙芥干旱应答基因,通过转录组的从头组装,共获得154875个unigenes,平均长度为1437个碱基。干旱胁迫后,共有13855个基因表达发生显著变化,其中7182个基因上调表达,6673个基因下调表达。GO功能富集分析表明差异表达基因显著富集到物质代谢、氧化还原和催化活性等功能;KEGG通路富集分析表明差异表达基因显著富集到氨基酸代谢、淀粉和糖代谢以及植物激素信号转导等途径。此外,鉴定到47个干旱诱导转录因子家族,主要包括HSF、ERF、WRKY、MYB、bHLH等。与沙芥相比,淀粉和糖代谢途径以及大量热胁迫转录因子在干旱胁迫后上调表达有可能是斧翅沙芥提高干旱胁迫耐受能力的特殊途径。本研究的结果初步揭示了斧翅沙芥对抗干旱胁迫的调控特征,为进一步理解斧翅沙芥干旱环境适应的分子机制提供线索。
关键词
斧翅沙芥(Pugionium
dolabratum)
干旱胁迫
转录组
转录因子
Keywords
Pugionium dolabratum
drought stress
transcriptome
transcription factor
分类号
Q948.11 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序的斧翅沙芥(Pugionium dolabratum)干旱胁迫应答基因表达分析
王玮
王悦
厉万荣
王浩澎
杨宁
《中国沙漠》
CSCD
北大核心
2022
0
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参考文献
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