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海水养殖沉积环境细菌多样性PCR-DGGE分析
被引量:
9
1
作者
原雅纬
傅莲英
+1 位作者
刘国生
郑天凌
《河南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期150-154,166,共6页
采用PCR结合变形梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,分析泉州东海海水养殖池基地新建虾池与一15年池龄虾池沉积物样品中细菌群落组成的变化.对DGGE图谱中的13条主要条带进行测序分析,结果表明,虾池环境中的主要微生物类群为γ-变形杆菌亚群...
采用PCR结合变形梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,分析泉州东海海水养殖池基地新建虾池与一15年池龄虾池沉积物样品中细菌群落组成的变化.对DGGE图谱中的13条主要条带进行测序分析,结果表明,虾池环境中的主要微生物类群为γ-变形杆菌亚群(γ-proteobacteria,30.77%)、厚壁菌群(Firmicutes,15.38%)、δ-变形杆菌亚群(δ-proteobacteria,7.6%)、拟杆菌群(Bacteroidetes,7.6%)、绿弯菌群(Chloroflexi,7.6%),放线菌群(Actinobacteria,7.6%),未知菌群(Unknown environmental samples)占23.08%.
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关键词
海水养殖环境
沉积物
PCR-DGGE
细菌多样性
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职称材料
塔玛亚历山大藻双向电泳蛋白的三种提取方法比较
被引量:
5
2
作者
原雅纬
郑伟
+2 位作者
李少菁
王桂忠
郑天凌
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第8期1113-1118,共6页
【目的】比较3种蛋白质提取方法,找到适用于塔玛亚历山大藻蛋白的最佳的提取方法,为后续用双向电泳(2-DE)技术研究不同条件下塔玛亚历山大藻蛋白的差异表达奠定基础。【方法】以塔玛亚历山大藻为研究对象,运用Tris-HCl提取法、TCA沉淀法...
【目的】比较3种蛋白质提取方法,找到适用于塔玛亚历山大藻蛋白的最佳的提取方法,为后续用双向电泳(2-DE)技术研究不同条件下塔玛亚历山大藻蛋白的差异表达奠定基础。【方法】以塔玛亚历山大藻为研究对象,运用Tris-HCl提取法、TCA沉淀法和lysis buffer提取法分别提取塔玛亚历山大藻蛋白,并通过双向电泳技术,对这3种方法进行了比较分析,筛选出最适于塔玛亚历山大藻的蛋白提取方法。并运用以上得出的方法,以不加杀藻物质的无菌塔玛亚历山大藻为对照,比较分析了塔玛亚历山大藻在加入杀藻物质后的蛋白差异表达状况。【结果】在这3种方法中,lysis buffer提取法得到的蛋白溶解性好,进行双向电泳时,可得到干净的背景、清晰的蛋白点,并且蛋白点的数目较多,酸性蛋白、碱性蛋白、大分子量和小分子量的蛋白均有提出来,蛋白点在胶面上分布均匀。用这种方法初步分析了加入杀藻物质后塔玛亚历山大藻蛋白的差异表达情况,并鉴定出14个与塔玛亚历山大藻生理活动密切相关的蛋白质。【结论】lysis buffer提取法获得了最多的蛋白点,双向电泳图谱清晰,适于用来提取塔玛亚历山大藻蛋白。
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关键词
塔玛亚历山大藻
甲藻
双向电泳
蛋白提取方法
蛋白质组学
原文传递
题名
海水养殖沉积环境细菌多样性PCR-DGGE分析
被引量:
9
1
作者
原雅纬
傅莲英
刘国生
郑天凌
机构
河南师范大学生命科学学院
厦门大学滨海湿地生态系统教育部重点实验室
厦门大学生命科学学院
出处
《河南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期150-154,166,共6页
基金
国家“863计划”(2008AA09Z408)
国家自然科学基金(40930847,30940002,40876061)
文摘
采用PCR结合变形梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,分析泉州东海海水养殖池基地新建虾池与一15年池龄虾池沉积物样品中细菌群落组成的变化.对DGGE图谱中的13条主要条带进行测序分析,结果表明,虾池环境中的主要微生物类群为γ-变形杆菌亚群(γ-proteobacteria,30.77%)、厚壁菌群(Firmicutes,15.38%)、δ-变形杆菌亚群(δ-proteobacteria,7.6%)、拟杆菌群(Bacteroidetes,7.6%)、绿弯菌群(Chloroflexi,7.6%),放线菌群(Actinobacteria,7.6%),未知菌群(Unknown environmental samples)占23.08%.
关键词
海水养殖环境
沉积物
PCR-DGGE
细菌多样性
Keywords
marine culture
sediments
PCR-DGGE
bacterial diversity
分类号
Q938.1 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
塔玛亚历山大藻双向电泳蛋白的三种提取方法比较
被引量:
5
2
作者
原雅纬
郑伟
李少菁
王桂忠
郑天凌
机构
厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室
厦门大学滨海湿地生态系统教育部重点实验室
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第8期1113-1118,共6页
基金
国家“863计划”(2008AA09Z408)
国家自然科学基金重点项目、主任基金项目和面上项目(40930847,30940002,31070442)
长江学者和创新团队发展计划项目(40821063)~~
文摘
【目的】比较3种蛋白质提取方法,找到适用于塔玛亚历山大藻蛋白的最佳的提取方法,为后续用双向电泳(2-DE)技术研究不同条件下塔玛亚历山大藻蛋白的差异表达奠定基础。【方法】以塔玛亚历山大藻为研究对象,运用Tris-HCl提取法、TCA沉淀法和lysis buffer提取法分别提取塔玛亚历山大藻蛋白,并通过双向电泳技术,对这3种方法进行了比较分析,筛选出最适于塔玛亚历山大藻的蛋白提取方法。并运用以上得出的方法,以不加杀藻物质的无菌塔玛亚历山大藻为对照,比较分析了塔玛亚历山大藻在加入杀藻物质后的蛋白差异表达状况。【结果】在这3种方法中,lysis buffer提取法得到的蛋白溶解性好,进行双向电泳时,可得到干净的背景、清晰的蛋白点,并且蛋白点的数目较多,酸性蛋白、碱性蛋白、大分子量和小分子量的蛋白均有提出来,蛋白点在胶面上分布均匀。用这种方法初步分析了加入杀藻物质后塔玛亚历山大藻蛋白的差异表达情况,并鉴定出14个与塔玛亚历山大藻生理活动密切相关的蛋白质。【结论】lysis buffer提取法获得了最多的蛋白点,双向电泳图谱清晰,适于用来提取塔玛亚历山大藻蛋白。
关键词
塔玛亚历山大藻
甲藻
双向电泳
蛋白提取方法
蛋白质组学
Keywords
Alexandrium tamarense
dinoflagellates
two-dimensional electrophoresis
protein extraction
分类号
Q946.1 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海水养殖沉积环境细菌多样性PCR-DGGE分析
原雅纬
傅莲英
刘国生
郑天凌
《河南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010
9
下载PDF
职称材料
2
塔玛亚历山大藻双向电泳蛋白的三种提取方法比较
原雅纬
郑伟
李少菁
王桂忠
郑天凌
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
5
原文传递
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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