苹果壳囊孢Cytospora mali分泌蛋白组学分析

野苹果腐烂病是一种严重的苹果病害,主要由苹果壳囊孢Cytospora mali(EGI-1)引起。本研究在全基因组水平进行预测并且与胞外分泌蛋白组分析相结合,对Cytosporamali分泌蛋白进行定量和定性分析。信号肽预测结果显示,共有956个蛋白具有分泌信号肽,信号肽平均长度为26 bp。LC-MS质谱组学分析结果显示在苹果枝条、叶片以及PDA培养基中分别检测到1789、2199和439个蛋白,其中141个分泌蛋白在所有样品中均有分布。GO分析结果显示,枝条、叶片以及PDA培养基中代谢过程和细胞过程相关的蛋白富集数量最多。此外,共同存在的141个分泌蛋白中24个具有信号肽,其中12个蛋白具有碳水化合物酶类(carbohydrate active-enzymes,CAZymes)功能区域。通过酵母分泌性实验,我们验证了5个候选分泌蛋白均可外泌。本研究利用生物信息学、LC-MS质谱以及酵母分泌性实验,初步建立了从新疆野苹果中分离鉴定的Cytosporamali(EGI-1)分泌蛋白数据库,为解析新疆野苹果树腐烂病菌致病分子机理提供基础。

白桦BBX转录因子家族鉴定、表达分析及BpBBX24抗逆功能初探

BBX转录因子家族在植物种子萌发、幼苗光形态建成、庇荫性反应、开花的光周期调节等一系列光介导的生长发育过程以及植物对多种非生物和生物胁迫的响应过程中都发挥重要作用。本研究利用生物信息学方法从白桦(Betula platyphylla)基因组中鉴定出19个BBX蛋白,分布于6个亚家族中,其中一个非典型BBX蛋白在其他物种中还未发现,将其单列为一个亚家族,分析该家族蛋白生物信息特征及干旱、高盐胁迫下表达模式。结果显示BpBBX转录因子家族中有14个酸性蛋白质, 18个亲水性蛋白质,同时有11个Bp BBX蛋白质定位于细胞核。该家族基因分布在9条染色体上,启动子中包含光响应元件、胁迫响应元件等43种顺式作用元件。转录组分析数据显示, BpBBX3、BpBBX5、BpBBX6、BpBBX15、BpBBX24、BpBBX29、BpBBX30受到高盐或干旱胁迫信号调控。进一步对BpBBX24抗逆功能深入研究发现,在干旱及高盐胁迫下, BpBBX24可以增强白桦幼苗活性氧物质的清除能力,减少细胞膜过氧化损伤。该研究结果不仅为研究白桦BBX转录因子家族的功能研究奠定了基础,同时为白桦抗性育种提供了候选基因和科学依据。