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猪Nramp1基因内含子6多态性与仔猪腹泻的相关性 被引量:4
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作者 古少波 杜倩 +3 位作者 舒丹 李志瑕 田晓静 刘丽霞 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期882-887,共6页
为了研究猪Nramp1基因内含子6的多态性与仔猪腹泻的相关性,采用PCR-RFLP法对八眉猪和烟台黑猪Nramp1基因内含子6的多态性进行研究。结果表明:两个猪种在该基因内含子6的多态性较低,共检测到两个等位基因(A、B)和两种基因型(AB、BB),八... 为了研究猪Nramp1基因内含子6的多态性与仔猪腹泻的相关性,采用PCR-RFLP法对八眉猪和烟台黑猪Nramp1基因内含子6的多态性进行研究。结果表明:两个猪种在该基因内含子6的多态性较低,共检测到两个等位基因(A、B)和两种基因型(AB、BB),八眉猪多态信息含量(PIC)为0.33,烟台黑猪为0.36。卡方适合性检验显示,两猪种的Nramp1基因内含子6极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。相关性分析结果表明,八眉猪对腹泻的抵抗能力显著高于烟台黑猪(P<0.05)。性别与Nramp1基因内含子6基因型对仔猪腹泻影响不显著(P>0.05),而性别与基因型的互作对仔猪腹泻有显著影响(P<0.05),在母猪群体中,AB基因型的腹泻评分极显著大于BB基因型(P<0.01);在公猪群体中,AB和BB基因型腹泻评分差异不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 八眉猪 烟台黑猪 Nramp1基因 腹泻 多态性
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一株纤维素分解菌的筛选、鉴定及产酶特性研究
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作者 古少波 李志瑕 +3 位作者 杜倩 杨春飞 关发旭 蔡勇 《畜牧兽医科学(电子版)》 2018年第4期6-9,共4页
从兰州大尾羊、小尾寒羊、藏羊瘤胃液中分离出具有较强纤维素分解能力的菌株,测定其产酶特性,为进一步开发绵羊纤维素酶饲料添加剂奠定基础。进而采集新鲜瘤胃液,接种于羧甲基纤维素钠平板,通过刚果红染色和液体复筛培养基发酵培养,筛... 从兰州大尾羊、小尾寒羊、藏羊瘤胃液中分离出具有较强纤维素分解能力的菌株,测定其产酶特性,为进一步开发绵羊纤维素酶饲料添加剂奠定基础。进而采集新鲜瘤胃液,接种于羧甲基纤维素钠平板,通过刚果红染色和液体复筛培养基发酵培养,筛选出纤维素分解能力较强的好氧细菌。形态学、生理生化试验与16SrDNA序列分析方法相结合对细菌进行鉴定,同时对纤维素分解能力最强的1株细菌进行不同条件下酶活力测定。发现分离得到一株纤维素分解能力最强的菌株命名为SD-1。经分子生物学方法鉴定,该菌属芽孢杆菌。对SD-1进行独立单因子试验,发现SD-1最适发酵温度为40℃,最适发酵pH为6.5,最佳发酵时间为12 h,最佳碳源及氮源分别为淀粉和酵母浸出物。 展开更多
关键词 SD-1 纤维素分解菌 酶活力
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甘蓝型油菜BnbHLH92基因的克隆与表达分析 被引量:5
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作者 王静 白九元 +2 位作者 古少波 赵云 王睿 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1169-1176,共8页
为研究甘蓝型油菜bHLH转录因子的功能,采用同源克隆技术从甘蓝型油菜中克隆了5个BnbHLH92基因全长cDNA序列,分别命名为BnbHLH92-1、BnbHLH92-2、BnbHLH92-3、BnbHLH92-4、BnbHLH92-5,其编码区长度分别为738,657,684,741,717bp.qRT-PCR... 为研究甘蓝型油菜bHLH转录因子的功能,采用同源克隆技术从甘蓝型油菜中克隆了5个BnbHLH92基因全长cDNA序列,分别命名为BnbHLH92-1、BnbHLH92-2、BnbHLH92-3、BnbHLH92-4、BnbHLH92-5,其编码区长度分别为738,657,684,741,717bp.qRT-PCR实验表明,除BnbHLH92-1外,其它的BnbHLH 92基因主要在抽薹期和花期的根中表达,BnbHLH92-1主要在抽薹期和花期的根以及二叶一心期的叶中表达.非生物胁迫显著影响BnbHLH92基因的表达,使其表达量升高.低温胁迫下,BnbHLH92基因分别在胁迫后4、6、6、6、6 h表达量达最高.高温胁迫下,5个BnbHLH92基因分别在胁迫后2、6、6、8、4 h表达量达最高.盐胁迫下,BnbHLH92基因分别在胁迫后6、6、24、24、24 h表达量达最高.在ABA诱导下BnbHLH92基因表达量也有不同程度的增加,分析发现BnbHLH92基因的启动子序列上存在ABA响应元件(ABRE). 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 bHLH转录因子 基因克隆 非生物胁迫
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少根紫萍对铜绿微囊藻胁迫的生化响应模式 被引量:1
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作者 冯婷 苏稚喆 +3 位作者 田若岑 熊艳丽 古少波 魏炜 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1157-1162,共6页
了解在藻类胁迫下浮萍的应激和抗胁迫机制,为提高浮萍水污染修复的应用效益提供参考.本研究设置了不同浓度梯度的铜绿微囊藻与少根紫萍共培养体系,并测生物量、叶绿素、抗氧化酶以及藻毒素等指标.实验结果如下:少根紫萍在低剂量铜绿微囊... 了解在藻类胁迫下浮萍的应激和抗胁迫机制,为提高浮萍水污染修复的应用效益提供参考.本研究设置了不同浓度梯度的铜绿微囊藻与少根紫萍共培养体系,并测生物量、叶绿素、抗氧化酶以及藻毒素等指标.实验结果如下:少根紫萍在低剂量铜绿微囊藻3×10^8 cells/L,6×10^8 cells/L共培条件下可持续富集藻毒素;各组少根紫萍的生长均受到抑制,3×10^8 cells/L低剂量组在共培养6 d后可以促进少根紫萍的增长;少根紫萍中不同抗氧化酶在铜绿微囊藻胁迫下的酶活变化不同,3×10^8 cells/L低剂量组在共培养6 d后过氧化物酶(POD)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)酶活显著提高,共培养12 d后超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)酶活有所提高.结果表明铜绿微囊藻胁迫下少根紫萍生长发育受到抑制,低浓度铜绿微囊藻胁迫下可以提高少根紫萍的抗氧化应激能力,过高浓度可能会导致抗氧化酶的异常表达并损害体细胞的正常代谢. 展开更多
关键词 少根紫萍 铜绿微囊藻 生物胁迫 生理生化指标
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猪Nramp1基因外显子2的SNP位点筛选及生物信息学分析 被引量:1
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作者 刘丽霞 张丽 +1 位作者 古少波 杜倩 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期3276-3281,共6页
本研究采用DNA混合池扩增并进行直接测序的方法,对3个引进猪种和3个地方猪种Nramp1基因外显子2的SNP位点进行筛选,并通过生物信息学软件对该基因的m RNA二级结构、蛋白质二级结构和功能进行预测。结果在2个引进猪种(大白猪,长白猪)和... 本研究采用DNA混合池扩增并进行直接测序的方法,对3个引进猪种和3个地方猪种Nramp1基因外显子2的SNP位点进行筛选,并通过生物信息学软件对该基因的m RNA二级结构、蛋白质二级结构和功能进行预测。结果在2个引进猪种(大白猪,长白猪)和3个地方猪种(八眉猪,蕨麻猪,烟台黑猪)中共检测到2个SNP位点,分别为T^(62)C和A^(92)G,而在杜洛克猪中未检测到SNP位点。生物信息学分析结果表明,T^(62)C和A^(92)G位点均降低了RNA二级结构的稳定性,Nramp1基因可能在转录和信号转导过程中发挥着重要作用。本研究结果丰富了猪Nramp1基因库,为进一步研究Nramp1基因功能和筛选抗病育种相关SNP位点提供理论参考。 展开更多
关键词 Nramp1基因 SNP位点 生物信息学
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