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植物叶绿素合成、分解代谢及信号调控
被引量:
91
1
作者
史典义
刘忠香
金危危
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期698-704,共7页
叶绿素(Chlorophyll,Chl)合成是决定植物光合效率的重要性状,是决定作物产量的重要因素。参与植物Chl合成、分解代谢及信号调控的基因数目众多,其中任何一个基因发生突变都有可能引起Chl含量的变化,从而表现为各种叶色异常甚至导致植株...
叶绿素(Chlorophyll,Chl)合成是决定植物光合效率的重要性状,是决定作物产量的重要因素。参与植物Chl合成、分解代谢及信号调控的基因数目众多,其中任何一个基因发生突变都有可能引起Chl含量的变化,从而表现为各种叶色异常甚至导致植株死亡。自然或人工创造突变体,对于Chl相关基因的功能分析非常必要。目前,Chl突变体己广泛应用于基础研究和生产实践。文章就该研究领域内的最新研究进展进行了概述。
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关键词
叶绿素合成
叶绿素降解
信号调控
光合作用
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职称材料
现代生物技术及其应用
被引量:
3
2
作者
史典义
刘英
《生物学教学》
北大核心
2008年第1期4-6,共3页
本文概述了现代生物技术的四大领域,并介绍了各领域的研究应用。
关键词
生物技术
基因工程细胞工程
酶工程
发酵工程
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职称材料
高校实验教学改革模式的探讨
被引量:
14
3
作者
史典义
汪洋
刘英
《职业圈》
2007年第07S期69-70,共2页
文章从教学观念、教学内容、教师队伍建设、职业技能鉴定、实验室开放制度和实践教学等六个方面对当前的实验教学改革进行了深入的探讨,并结合当前社会对人才培养的要求提出了一些新的见解。
关键词
高校
教育改革
实验教学
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职称材料
植物细胞核雄性不育的分子机制
4
作者
史典义
赵晓菊
+1 位作者
周正富
涂金星
《植物生理学通讯》
CSCD
北大核心
2007年第3期556-562,共7页
植物细胞核雄性不育是育性基因时空调控表达异常的结果。目前已克隆到一些绒毡层特异表达的基因,如EMS1/ EXS、UDT1及RTS等。鉴定了一些减数分裂相关的基因,如AtRAD51、AtMND1及PAIR1、PAIR2等。此外,MMD1、MS1及TDR等还与细胞程序性死...
植物细胞核雄性不育是育性基因时空调控表达异常的结果。目前已克隆到一些绒毡层特异表达的基因,如EMS1/ EXS、UDT1及RTS等。鉴定了一些减数分裂相关的基因,如AtRAD51、AtMND1及PAIR1、PAIR2等。此外,MMD1、MS1及TDR等还与细胞程序性死亡有关。
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关键词
细胞核雄性不育
绒毡层
减数分裂
细胞程序性死亡
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职称材料
联会复合体的组成、功能及遗传控制
被引量:
5
5
作者
谢文军
史典义
+2 位作者
蔡泽熙
陈晓阳
金危危
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期167-176,共10页
在多数有性生殖生物中,减数分裂第一次分裂前期同源染色体间会形成一种复杂的超级蛋白结构——联会复合体(Synaptonemal complex,SC)。该结构与同源染色体间的配对、联会、交换、分离等过程密切相关。若其出现异常,将可导致性母细胞大...
在多数有性生殖生物中,减数分裂第一次分裂前期同源染色体间会形成一种复杂的超级蛋白结构——联会复合体(Synaptonemal complex,SC)。该结构与同源染色体间的配对、联会、交换、分离等过程密切相关。若其出现异常,将可导致性母细胞大量凋亡,宏观上即表现为生物个体不育。近年来,该结构已成为减数分裂研究领域的一个热点,但其控制机理至今所知还十分有限。文章对联会复合体的组成、功能及其遗传控制等情况进行概述,并对其未来的研究进行探讨和展望。
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关键词
联会复合体
同源匹配
配对
重组
减数分裂
不育
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职称材料
石油污染土壤的微生物修复技术
被引量:
13
6
作者
汪洋
史典义
+1 位作者
聂春雨
张楠楠
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期94-96,共3页
该文介绍了微生物修复技术的最新研究内容和方法、重点对石油污染土壤的微生物原位修复、异位修复研究进展及各自的优点、局限性进行了综述,并就石油对微生物修复的影响因素进行探讨,最后讨论了该技术在我国的研究趋势和前景。
关键词
微生物修复技术
原位微生物修复
异位微生物修复
影响因素
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职称材料
聚驱采出水对蚕豆根尖细胞的遗传毒性分析
被引量:
1
7
作者
徐长君
张国发
+3 位作者
袁红梅
史典义
张丽霞
袁改霞
《安全与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期6-8,共3页
为探索聚合物驱采出水对生物体的遗传毒性,从而对油田聚合物驱采出水的污染程度进行判定,从2007年2月到2009年12月,采集油田聚合物区块联合站的来水、一沉水、二沉水、外输水、杀菌水的水样,用双蒸水稀释至100%(母液)、75%、50%、25%,以...
为探索聚合物驱采出水对生物体的遗传毒性,从而对油田聚合物驱采出水的污染程度进行判定,从2007年2月到2009年12月,采集油田聚合物区块联合站的来水、一沉水、二沉水、外输水、杀菌水的水样,用双蒸水稀释至100%(母液)、75%、50%、25%,以0.5%的甲基磺酸乙酯(Ethyl Methane Sulfonate,EMS)溶液为阳性对照,双蒸水为阴性对照,利用蚕豆根尖细胞微核技术,对聚合物驱油采出水的遗传毒性进行跟踪分析。结果表明,大庆油田某聚驱采油区块的采出水,100%(母液)污染指数为3.9~5.1,75%的稀释液污染指数为3.6~5.4,50%稀释液污染指数为2.5~4.7,25%稀释液污染指数为2.2~3.9。聚驱采出水普遍具有中度到重度的遗传毒性效应,对油田周边环境构成较严重威胁。
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关键词
环境学
聚驱采出水
蚕豆根尖
细胞微核
遗传毒性
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职称材料
大庆市区常见实验无脊椎动物的种类调查
被引量:
5
8
作者
袁改霞
徐长君
+1 位作者
张国发
史典义
《大庆师范学院学报》
2008年第2期134-137,共4页
对大庆市区野生与市售的主要实验无脊椎动物进行了全面的调查,结果显示:大庆共有野生无脊椎实验动物7大门、16大纲、38目,多数动物集中在4~10月份大量出现;市售4门、9纲、18目,大部分常年可见。
关键词
大庆地区
实验无脊椎动物
种类调查
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职称材料
内源激素含量的变化与长春花成花关系的研究
被引量:
5
9
作者
赵晓菊
史典义
+1 位作者
杨蕾
唐中华
《大庆师范学院学报》
2008年第5期118-120,共3页
采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定长春花从幼苗到开花阶段的3种内源激素脱落酸(ABA)、生长素(IAA)、赤霉素(GA3)含量的动态变化,研究其与长春花成花的关系。研究结果表明,在长春花成花芽发育过程中,高含量的ABA和GA3含量降低及IAA含量逐...
采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定长春花从幼苗到开花阶段的3种内源激素脱落酸(ABA)、生长素(IAA)、赤霉素(GA3)含量的动态变化,研究其与长春花成花的关系。研究结果表明,在长春花成花芽发育过程中,高含量的ABA和GA3含量降低及IAA含量逐渐升高利于长春花成花。
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关键词
长春花
内源激素
成花过程
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职称材料
大庆地区湿地现状及生态建设
被引量:
10
10
作者
张国发
崔玉波
+1 位作者
史典义
徐长君
《黑龙江农业科学》
2009年第4期63-66,共4页
湿地在大庆地区经济发展和生态建设中起着重要作用。在阐述大庆地区湿地现状及存在问题的基础上,从加大湿地保护的法律法规建设和政策执行度、控制湿地污染,治理污染湿地、引入清洁水源,保障湿地生态用水、增设湿地保护区和综合治理示...
湿地在大庆地区经济发展和生态建设中起着重要作用。在阐述大庆地区湿地现状及存在问题的基础上,从加大湿地保护的法律法规建设和政策执行度、控制湿地污染,治理污染湿地、引入清洁水源,保障湿地生态用水、增设湿地保护区和综合治理示范区、建立可持续发展的湿地管理体制、加强湿地的研究工作、加强湿地保护宣传教育和提高公众环保意识七个方面提出了大庆地区湿地的生态建设对策。
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关键词
大庆
湿地
现状
生态问题
生态建设
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职称材料
石油采出水诱发蚕豆根尖细胞染色体畸变的研究
11
作者
徐长君
周雪
+2 位作者
张国发
袁改霞
史典义
《黑龙江农业科学》
2010年第1期5-7,共3页
应用蚕豆根尖细胞微核技术,对大庆市4个采油厂聚驱的石油采出水遗传毒性进行分析研究。结果表明:经聚合物驱油的石油采出水处理过的蚕豆根尖细胞,其染色体均发生异常,出现断片、桥以及滞后染色体等现象,有明显的微核效应和遗传毒性,加...
应用蚕豆根尖细胞微核技术,对大庆市4个采油厂聚驱的石油采出水遗传毒性进行分析研究。结果表明:经聚合物驱油的石油采出水处理过的蚕豆根尖细胞,其染色体均发生异常,出现断片、桥以及滞后染色体等现象,有明显的微核效应和遗传毒性,加水稀释对于减轻其毒性的作用甚小,如果不加处理地排放将会给生态环境造成危害。
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关键词
石油采出水
聚合物驱油
蚕豆根尖
微核技术
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职称材料
鸡[土从]菌基因组测序和比较基因组分析
12
作者
黎勇
孙明伟
+3 位作者
杜婉婷
邓佳
陈慧
史典义
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2022年第6期1-13,共13页
对采集自四川省内江市东兴区高桥村灌木林的鸡[土从]菌(Termitomyces albuminosus)进行基因组测序、组装、基因功能注释、碳水化合物酶(carbohydrate-active enzyme,CAZy)预测、进化树构建、同源序列比对及简单重复序列(simple sequence...
对采集自四川省内江市东兴区高桥村灌木林的鸡[土从]菌(Termitomyces albuminosus)进行基因组测序、组装、基因功能注释、碳水化合物酶(carbohydrate-active enzyme,CAZy)预测、进化树构建、同源序列比对及简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记开发和PCR扩增验证的研究工作。结果表明:鸡[土从]菌全基因组共存在1.71×10^(3)个蛋白质编码基因,平均长度为1.65×10^(3) bp;CAZy功能注释聚类分析表明,黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、内华达古白蚁(Zootermopsis nevadensis)、面包酵母(Saccharomyces cerevisiae)和裂体吸虫(Schistosoma mansoni)聚类到同一大组,鸡[土从]菌与其他物种聚类到另一大组,且与刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)和糙皮侧耳(P.ostreatus)聚类到更小分组;进化树分析表明,蚁巢伞属真菌与常见的栽培食用菌之间存在一定的进化距离,与金针菇(Flammulina velutipes)、猴头菌(Hericium erinaceus)和香菇(Lentinula edodes)的进化距离较近;采用SSR标记对收集的鸡[土从]菌进行分析,发现一地域分布的鸡[土从]菌在遗传上存在较高的相似性。
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关键词
鸡[土从]菌
白蚁
基因组组装
比较基因组
简单重复序列
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职称材料
玉米全基因组批量化SSR多态性标记开发及PCR扩增验证
13
作者
史典义
邓佳
+2 位作者
孙明伟
文轩涛
汪洋
《玉米科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期39-47,共9页
简单序列重复在真核生物的基因组中含量非常丰富,且常常随机、均匀分布于整个基因组中。SSR标记广泛应用于动、植物基因定位、群体遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建、指纹图谱构建、种质鉴定、分子标记辅助选择等方向。随着大量全基因...
简单序列重复在真核生物的基因组中含量非常丰富,且常常随机、均匀分布于整个基因组中。SSR标记广泛应用于动、植物基因定位、群体遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建、指纹图谱构建、种质鉴定、分子标记辅助选择等方向。随着大量全基因组序列的公布,NCBI等数据库中可利用的序列信息量激增。但在常规分子生物学研究中,仍然延续传统的小规模SSR标记开发模式,开发标记数量非常有限、效率较低。结合MISA脚本指令、Primer3引物设计软件、e-PCR特异性扩增分析软件,对玉米全基因组水平SSR位点进行搜索、引物设计、特异性扩增分析以及扩增长度差异分析,开发高密度的SSR标记。通过引物合成、PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳,从常规分子生物学水平验证所开发标记的可靠性。
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关键词
玉米
基因组
批量化
SSR
多态性
分子标记
原文传递
基于转录组测序数据的甘薯SSR标记开发及群体聚类分析
被引量:
4
14
作者
杨育峰
史典义
+6 位作者
王雁楠
杨国红
徐心志
翟红
何绍贞
刘庆昌
苏文瑾
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期3569-3579,共11页
利用转录组数据开发SSR标记,是目前较为经济高效的DNA分子标记开发方法。为了开发更多适用于甘薯的SSR标记,本研究在前期对甘薯体细胞杂种KT1及其两个亲本4个干旱胁迫处理的24个样本转录组de novo测序的基础上,对获得的105 959条Unigen...
利用转录组数据开发SSR标记,是目前较为经济高效的DNA分子标记开发方法。为了开发更多适用于甘薯的SSR标记,本研究在前期对甘薯体细胞杂种KT1及其两个亲本4个干旱胁迫处理的24个样本转录组de novo测序的基础上,对获得的105 959条Unigene中大于等于1 000 bp的FASTA序列进行搜索,共找到12 105个SSR位点。从中筛选设计了200对SSR引物在KT1及其亲本中筛选验证,最终选择了20对多态性较好的引物,对来自不同地区的94份甘薯种质资源进行了群体聚类分析。聚类分析把94份实验材料分为3个亚群,较清晰地区分了不同材料之间的遗传相似性。这些基于甘薯转录组测序开发的SSR标记为甘薯的遗传多样性分析、辅助育种和遗传图谱构建等研究的开展提供了更加丰富的候选标记。
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关键词
甘薯
转录组
SSR标记
聚类分析
原文传递
题名
植物叶绿素合成、分解代谢及信号调控
被引量:
91
1
作者
史典义
刘忠香
金危危
机构
中国农业大学国家玉米改良中心
大庆师范学院生命科学学院
北京林业大学继续教育学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期698-704,共7页
基金
国家自然科学基金项目(编号:39870423)资助
文摘
叶绿素(Chlorophyll,Chl)合成是决定植物光合效率的重要性状,是决定作物产量的重要因素。参与植物Chl合成、分解代谢及信号调控的基因数目众多,其中任何一个基因发生突变都有可能引起Chl含量的变化,从而表现为各种叶色异常甚至导致植株死亡。自然或人工创造突变体,对于Chl相关基因的功能分析非常必要。目前,Chl突变体己广泛应用于基础研究和生产实践。文章就该研究领域内的最新研究进展进行了概述。
关键词
叶绿素合成
叶绿素降解
信号调控
光合作用
Keywords
chlorophyll biosynthesis
chlorophyll catabolism
signal regulation
photosynthesis
分类号
Q946 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
现代生物技术及其应用
被引量:
3
2
作者
史典义
刘英
机构
黑龙江省大庆师范学院生命科学系
东北林业大学森林植物生态学教育部重点实验室
出处
《生物学教学》
北大核心
2008年第1期4-6,共3页
文摘
本文概述了现代生物技术的四大领域,并介绍了各领域的研究应用。
关键词
生物技术
基因工程细胞工程
酶工程
发酵工程
分类号
Q81 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
高校实验教学改革模式的探讨
被引量:
14
3
作者
史典义
汪洋
刘英
机构
大庆师范学院生命科学系
东北林业大学森林植物生态教育部重点实验室
出处
《职业圈》
2007年第07S期69-70,共2页
文摘
文章从教学观念、教学内容、教师队伍建设、职业技能鉴定、实验室开放制度和实践教学等六个方面对当前的实验教学改革进行了深入的探讨,并结合当前社会对人才培养的要求提出了一些新的见解。
关键词
高校
教育改革
实验教学
分类号
G642 [文化科学—高等教育学]
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职称材料
题名
植物细胞核雄性不育的分子机制
4
作者
史典义
赵晓菊
周正富
涂金星
机构
大庆师范学院生命科学系
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
出处
《植物生理学通讯》
CSCD
北大核心
2007年第3期556-562,共7页
文摘
植物细胞核雄性不育是育性基因时空调控表达异常的结果。目前已克隆到一些绒毡层特异表达的基因,如EMS1/ EXS、UDT1及RTS等。鉴定了一些减数分裂相关的基因,如AtRAD51、AtMND1及PAIR1、PAIR2等。此外,MMD1、MS1及TDR等还与细胞程序性死亡有关。
关键词
细胞核雄性不育
绒毡层
减数分裂
细胞程序性死亡
分类号
Q943 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
联会复合体的组成、功能及遗传控制
被引量:
5
5
作者
谢文军
史典义
蔡泽熙
陈晓阳
金危危
机构
中国农业大学国家玉米改良中心
湖南农业大学农学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期167-176,共10页
基金
国家重点基础研究发展规划项目(“973计划”)(编号:2011CB944600)资助
文摘
在多数有性生殖生物中,减数分裂第一次分裂前期同源染色体间会形成一种复杂的超级蛋白结构——联会复合体(Synaptonemal complex,SC)。该结构与同源染色体间的配对、联会、交换、分离等过程密切相关。若其出现异常,将可导致性母细胞大量凋亡,宏观上即表现为生物个体不育。近年来,该结构已成为减数分裂研究领域的一个热点,但其控制机理至今所知还十分有限。文章对联会复合体的组成、功能及其遗传控制等情况进行概述,并对其未来的研究进行探讨和展望。
关键词
联会复合体
同源匹配
配对
重组
减数分裂
不育
Keywords
synaptonemal complex
alignment
pairing
recombination
meiosis
sterility
分类号
Q343 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
石油污染土壤的微生物修复技术
被引量:
13
6
作者
汪洋
史典义
聂春雨
张楠楠
机构
大庆师范学院生命科学系
大庆
出处
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期94-96,共3页
文摘
该文介绍了微生物修复技术的最新研究内容和方法、重点对石油污染土壤的微生物原位修复、异位修复研究进展及各自的优点、局限性进行了综述,并就石油对微生物修复的影响因素进行探讨,最后讨论了该技术在我国的研究趋势和前景。
关键词
微生物修复技术
原位微生物修复
异位微生物修复
影响因素
Keywords
microorganism repair technology
microorganisms in situ repair
microorganisms ex situ repair
influencing factor
分类号
Q938.13 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
聚驱采出水对蚕豆根尖细胞的遗传毒性分析
被引量:
1
7
作者
徐长君
张国发
袁红梅
史典义
张丽霞
袁改霞
机构
大庆师范学院生命科学学院
出处
《安全与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期6-8,共3页
基金
黑龙江省教育厅科技括导项目(11523002)
大庆师范学院自然科学基金项目(YZ002)
文摘
为探索聚合物驱采出水对生物体的遗传毒性,从而对油田聚合物驱采出水的污染程度进行判定,从2007年2月到2009年12月,采集油田聚合物区块联合站的来水、一沉水、二沉水、外输水、杀菌水的水样,用双蒸水稀释至100%(母液)、75%、50%、25%,以0.5%的甲基磺酸乙酯(Ethyl Methane Sulfonate,EMS)溶液为阳性对照,双蒸水为阴性对照,利用蚕豆根尖细胞微核技术,对聚合物驱油采出水的遗传毒性进行跟踪分析。结果表明,大庆油田某聚驱采油区块的采出水,100%(母液)污染指数为3.9~5.1,75%的稀释液污染指数为3.6~5.4,50%稀释液污染指数为2.5~4.7,25%稀释液污染指数为2.2~3.9。聚驱采出水普遍具有中度到重度的遗传毒性效应,对油田周边环境构成较严重威胁。
关键词
环境学
聚驱采出水
蚕豆根尖
细胞微核
遗传毒性
Keywords
environmentalology
the produced water in oilfield by the use of polymer flooding
fata root tips
cell micronucleus test technology
genetic toxicity
分类号
X835 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
大庆市区常见实验无脊椎动物的种类调查
被引量:
5
8
作者
袁改霞
徐长君
张国发
史典义
机构
大庆师范学院生命科学系
出处
《大庆师范学院学报》
2008年第2期134-137,共4页
文摘
对大庆市区野生与市售的主要实验无脊椎动物进行了全面的调查,结果显示:大庆共有野生无脊椎实验动物7大门、16大纲、38目,多数动物集中在4~10月份大量出现;市售4门、9纲、18目,大部分常年可见。
关键词
大庆地区
实验无脊椎动物
种类调查
Keywords
Daqing
practice base
teaching reform
分类号
Q915.81 [天文地球—古生物学与地层学]
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职称材料
题名
内源激素含量的变化与长春花成花关系的研究
被引量:
5
9
作者
赵晓菊
史典义
杨蕾
唐中华
机构
大庆师范学院生命科学系
东北林业大学森林植物生态学教育部重点实验室
出处
《大庆师范学院学报》
2008年第5期118-120,共3页
文摘
采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定长春花从幼苗到开花阶段的3种内源激素脱落酸(ABA)、生长素(IAA)、赤霉素(GA3)含量的动态变化,研究其与长春花成花的关系。研究结果表明,在长春花成花芽发育过程中,高含量的ABA和GA3含量降低及IAA含量逐渐升高利于长春花成花。
关键词
长春花
内源激素
成花过程
分类号
Q945.6 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
大庆地区湿地现状及生态建设
被引量:
10
10
作者
张国发
崔玉波
史典义
徐长君
机构
大庆师范学院生命科学系
大庆师范学院教务处
出处
《黑龙江农业科学》
2009年第4期63-66,共4页
基金
大庆师范学院自然科学基金(YZQ001)
文摘
湿地在大庆地区经济发展和生态建设中起着重要作用。在阐述大庆地区湿地现状及存在问题的基础上,从加大湿地保护的法律法规建设和政策执行度、控制湿地污染,治理污染湿地、引入清洁水源,保障湿地生态用水、增设湿地保护区和综合治理示范区、建立可持续发展的湿地管理体制、加强湿地的研究工作、加强湿地保护宣传教育和提高公众环保意识七个方面提出了大庆地区湿地的生态建设对策。
关键词
大庆
湿地
现状
生态问题
生态建设
Keywords
Daqing
wetlands
existing situation
ecological problems
ecological construction
分类号
X321 [环境科学与工程—环境工程]
下载PDF
职称材料
题名
石油采出水诱发蚕豆根尖细胞染色体畸变的研究
11
作者
徐长君
周雪
张国发
袁改霞
史典义
机构
大庆师范学院生命科学学院
黑龙江八一农垦大学生命科学学院
出处
《黑龙江农业科学》
2010年第1期5-7,共3页
基金
黑龙江省教育厅科技指导资助项目(11523002)
文摘
应用蚕豆根尖细胞微核技术,对大庆市4个采油厂聚驱的石油采出水遗传毒性进行分析研究。结果表明:经聚合物驱油的石油采出水处理过的蚕豆根尖细胞,其染色体均发生异常,出现断片、桥以及滞后染色体等现象,有明显的微核效应和遗传毒性,加水稀释对于减轻其毒性的作用甚小,如果不加处理地排放将会给生态环境造成危害。
关键词
石油采出水
聚合物驱油
蚕豆根尖
微核技术
Keywords
oil produced waste water
polymer flooding
root tip cell
micromuclear technology
分类号
X173 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
鸡[土从]菌基因组测序和比较基因组分析
12
作者
黎勇
孙明伟
杜婉婷
邓佳
陈慧
史典义
机构
内江师范学院生命科学学院
沱江流域特色农业资源四川省科技资源共享服务平台
出处
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2022年第6期1-13,共13页
基金
内江师范学院大学生创新创业训练计划(X2021089)。
文摘
对采集自四川省内江市东兴区高桥村灌木林的鸡[土从]菌(Termitomyces albuminosus)进行基因组测序、组装、基因功能注释、碳水化合物酶(carbohydrate-active enzyme,CAZy)预测、进化树构建、同源序列比对及简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记开发和PCR扩增验证的研究工作。结果表明:鸡[土从]菌全基因组共存在1.71×10^(3)个蛋白质编码基因,平均长度为1.65×10^(3) bp;CAZy功能注释聚类分析表明,黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、内华达古白蚁(Zootermopsis nevadensis)、面包酵母(Saccharomyces cerevisiae)和裂体吸虫(Schistosoma mansoni)聚类到同一大组,鸡[土从]菌与其他物种聚类到另一大组,且与刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)和糙皮侧耳(P.ostreatus)聚类到更小分组;进化树分析表明,蚁巢伞属真菌与常见的栽培食用菌之间存在一定的进化距离,与金针菇(Flammulina velutipes)、猴头菌(Hericium erinaceus)和香菇(Lentinula edodes)的进化距离较近;采用SSR标记对收集的鸡[土从]菌进行分析,发现一地域分布的鸡[土从]菌在遗传上存在较高的相似性。
关键词
鸡[土从]菌
白蚁
基因组组装
比较基因组
简单重复序列
Keywords
Termitomyces albuminosus
Zootermopsis nevadensis
genome assembly
comparative genomics
simple sequence repeats
分类号
S646 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
玉米全基因组批量化SSR多态性标记开发及PCR扩增验证
13
作者
史典义
邓佳
孙明伟
文轩涛
汪洋
机构
内江师范学院生命科学学院
沱江流域特色农业资源四川省科技资源共享服务平台
出处
《玉米科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期39-47,共9页
基金
内江师范学院2020年大学生创新创业训练项目“全基因组fasta序列批量化SSR引物设计流程开发”(X2020047)
内江师范学院线上线下混合式一流课程建设专项“生物信息学”(JK202021)。
文摘
简单序列重复在真核生物的基因组中含量非常丰富,且常常随机、均匀分布于整个基因组中。SSR标记广泛应用于动、植物基因定位、群体遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建、指纹图谱构建、种质鉴定、分子标记辅助选择等方向。随着大量全基因组序列的公布,NCBI等数据库中可利用的序列信息量激增。但在常规分子生物学研究中,仍然延续传统的小规模SSR标记开发模式,开发标记数量非常有限、效率较低。结合MISA脚本指令、Primer3引物设计软件、e-PCR特异性扩增分析软件,对玉米全基因组水平SSR位点进行搜索、引物设计、特异性扩增分析以及扩增长度差异分析,开发高密度的SSR标记。通过引物合成、PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳,从常规分子生物学水平验证所开发标记的可靠性。
关键词
玉米
基因组
批量化
SSR
多态性
分子标记
Keywords
Maize
Genome
Batch
SSR
Polymorphism
Molecular marker
分类号
S513.035.3 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
基于转录组测序数据的甘薯SSR标记开发及群体聚类分析
被引量:
4
14
作者
杨育峰
史典义
王雁楠
杨国红
徐心志
翟红
何绍贞
刘庆昌
苏文瑾
机构
河南省农业科学院粮食作物研究所
中国农业大学农业部甘薯生物学与生物技术重点实验室
湖北省农业科学院粮食作物研究所
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期3569-3579,共11页
基金
国家自然科学基金项目(U1404316)
国家甘薯产业技术体系项目(CARS-10)
河南省农业科学院自主创新专项基金项目(2017ZC13)共同资助
文摘
利用转录组数据开发SSR标记,是目前较为经济高效的DNA分子标记开发方法。为了开发更多适用于甘薯的SSR标记,本研究在前期对甘薯体细胞杂种KT1及其两个亲本4个干旱胁迫处理的24个样本转录组de novo测序的基础上,对获得的105 959条Unigene中大于等于1 000 bp的FASTA序列进行搜索,共找到12 105个SSR位点。从中筛选设计了200对SSR引物在KT1及其亲本中筛选验证,最终选择了20对多态性较好的引物,对来自不同地区的94份甘薯种质资源进行了群体聚类分析。聚类分析把94份实验材料分为3个亚群,较清晰地区分了不同材料之间的遗传相似性。这些基于甘薯转录组测序开发的SSR标记为甘薯的遗传多样性分析、辅助育种和遗传图谱构建等研究的开展提供了更加丰富的候选标记。
关键词
甘薯
转录组
SSR标记
聚类分析
Keywords
Sweetpotato
Transcriptome
SSR markers
Clustering analysis
分类号
S531 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
植物叶绿素合成、分解代谢及信号调控
史典义
刘忠香
金危危
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009
91
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职称材料
2
现代生物技术及其应用
史典义
刘英
《生物学教学》
北大核心
2008
3
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职称材料
3
高校实验教学改革模式的探讨
史典义
汪洋
刘英
《职业圈》
2007
14
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职称材料
4
植物细胞核雄性不育的分子机制
史典义
赵晓菊
周正富
涂金星
《植物生理学通讯》
CSCD
北大核心
2007
0
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职称材料
5
联会复合体的组成、功能及遗传控制
谢文军
史典义
蔡泽熙
陈晓阳
金危危
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012
5
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职称材料
6
石油污染土壤的微生物修复技术
汪洋
史典义
聂春雨
张楠楠
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2009
13
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职称材料
7
聚驱采出水对蚕豆根尖细胞的遗传毒性分析
徐长君
张国发
袁红梅
史典义
张丽霞
袁改霞
《安全与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
1
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职称材料
8
大庆市区常见实验无脊椎动物的种类调查
袁改霞
徐长君
张国发
史典义
《大庆师范学院学报》
2008
5
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职称材料
9
内源激素含量的变化与长春花成花关系的研究
赵晓菊
史典义
杨蕾
唐中华
《大庆师范学院学报》
2008
5
下载PDF
职称材料
10
大庆地区湿地现状及生态建设
张国发
崔玉波
史典义
徐长君
《黑龙江农业科学》
2009
10
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职称材料
11
石油采出水诱发蚕豆根尖细胞染色体畸变的研究
徐长君
周雪
张国发
袁改霞
史典义
《黑龙江农业科学》
2010
0
下载PDF
职称材料
12
鸡[土从]菌基因组测序和比较基因组分析
黎勇
孙明伟
杜婉婷
邓佳
陈慧
史典义
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2022
0
下载PDF
职称材料
13
玉米全基因组批量化SSR多态性标记开发及PCR扩增验证
史典义
邓佳
孙明伟
文轩涛
汪洋
《玉米科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
14
基于转录组测序数据的甘薯SSR标记开发及群体聚类分析
杨育峰
史典义
王雁楠
杨国红
徐心志
翟红
何绍贞
刘庆昌
苏文瑾
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
原文传递
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