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马铃薯Y病毒福建分离物P1基因的分子变异和结构特征
被引量:
9
1
作者
史凤阳
高芳銮
+2 位作者
沈建国
常飞
詹家绥
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期713-722,共10页
为揭示马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)P1基因的分子变异及结构特征,并查明福建分离物P1基因的变异来源。文章设计一对简并引物从感染PVY的马铃薯病叶扩增、克隆获得福建分离物P1基因的cDNA全长序列,分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特...
为揭示马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)P1基因的分子变异及结构特征,并查明福建分离物P1基因的变异来源。文章设计一对简并引物从感染PVY的马铃薯病叶扩增、克隆获得福建分离物P1基因的cDNA全长序列,分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征,并采用贝叶斯法重建P1基因的系统发育树。结果显示,12个福建分离物均成功扩增出预期大小(约915 bp)的特异性片段,P1基因的核苷酸序列与已报道的PVY不同株系的核苷酸序列一致性为73%~99%;QK44、XT02、XT08、LH05分离物的309 nt位置均检测到一个强烈的重组信号。12个PVY分离物中,P1蛋白有85个变异的氨基酸位点,表明其高度变异;P1蛋白的第41~275位是一个高度保守的结构功能域,含有3个保守的活性位点(H192、D201、V235);系统发育分析显示,福建分离物形聚为3种不同的簇,其对应的卷曲结构(Coiled-coil domain)和空间结构也不相同,表明不同株系型的P1基因在系统发育关系上分化较大。该研究结果表明PVY P1基因在核苷酸序列、氨基酸序列以及空间结构具有高度变异性,但行使P1蛋白功能的活性位点所在的氨基酸(H192、D201和V235)均高度保守;福建分离物P1基因的变异源主要来自碱基突变和基因重组。
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关键词
马铃薯Y病毒
P1基因
变异
重组
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职称材料
中国马铃薯Y病毒的检测鉴定及CP基因的分子变异
被引量:
29
2
作者
高芳銮
沈建国
+3 位作者
史凤阳
方治国
谢联辉
詹家绥
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第15期3125-3133,共9页
【目的】查明马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)病在中国的发生情况,及时、准确地鉴定出PVY并对其分子变异进行分析。【方法】采用ELISA方法对采自中国14个省(直辖市)马铃薯种植区疑似受PVY感染的样品进行了检测,并对其中的部分材料镜检...
【目的】查明马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)病在中国的发生情况,及时、准确地鉴定出PVY并对其分子变异进行分析。【方法】采用ELISA方法对采自中国14个省(直辖市)马铃薯种植区疑似受PVY感染的样品进行了检测,并对其中的部分材料镜检验证,然后根据CP基因序列设计1对简并引物针对随机选择感染PVY的14个省(直辖市)代表样品进行CP基因扩增克隆,将测序得到的序列进行分子变异分析,并使用贝叶斯法(Bayesian inference,BI)重建系统发育关系。【结果】ELISA检测结果表明,691份样品中220个样品与PVY抗体呈阳性反应,其余呈阴性反应;ELISA检测的阳性材料在透射电镜下均可观察到明显的风轮状内含体,14个PVY分离物均成功扩增出预期大小(约800 bp)的特异性片段,CP基因的核苷酸序列与已报道PVY不同株系的核苷酸序列一致性均在88%以上;在14个PVY分离物CP基因中共发现有29个多态性位点,其中6个简约信息位点,23个单一变异位点。系统发育分析结果显示,14个PVY分离物与PVYN:O株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上,与PVYN:O株系的亲缘关系最近。【结论】PVY CP基因高度保守,但不同地区分离物也存在一定的分子变异,本研究可为今后了解PVY病毒病流行、变异趋势及其防治提供依据。
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关键词
马铃薯Y病毒
ELISA
外壳蛋白基因
分子变异
贝叶斯法
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职称材料
马铃薯Y病毒pipo基因的分子变异及结构特征分析
被引量:
11
3
作者
高芳銮
沈建国
+3 位作者
史凤阳
常飞
谢联辉
詹家绥
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期1125-1134,共10页
为揭示马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)pipo基因的分子变异和结构特征,文章根据文献报道的马铃薯Y病毒属(Potyvirus)pipo基因保守区序列设计一对简并引物,从感染PVY的马铃薯病叶中克隆获得pipo基因的cDNA全长序列,分析其核苷酸序...
为揭示马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)pipo基因的分子变异和结构特征,文章根据文献报道的马铃薯Y病毒属(Potyvirus)pipo基因保守区序列设计一对简并引物,从感染PVY的马铃薯病叶中克隆获得pipo基因的cDNA全长序列,分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征,并基于氨基酸序列使用贝叶斯法重建了Potyvirus的系统发育树。结果显示:20个PVY分离物成功扩增出预期大小(约235bp)的特异性片段,其核苷酸序列与已报道的其它PVY株系的pipo基因核苷酸序列一致性均在92%以上;5′端均含有典型的G1-2A6-7基序(motif),无碱基插入/缺失,所有的核苷酸变异都是碱基置换,共发现13个多态性位点,其中4个简约信息位点,9个单一变异位点,表明该基因高度保守,但不同分离物也存在一定的分子变异;PIPO蛋白理论等电点11.26~11.62,无信号肽和跨膜区,是可溶的亲水性蛋白;整个蛋白含有3个保守区,其中位于10~59aa的基序最为保守。该蛋白主要定位于线粒体中,可能是线粒体导肽。系统发育分析结果显示,源于PVY不同株系优先相聚成簇,而向日葵褪绿斑驳病毒(Sunflower chlorotic mottle virus,SuCMoV)与辣椒重花叶病毒(Pepper severe mosaic virus,PepSMV)的亲缘关系较PVY相比更近,与前人的结果相一致,表明PIPO蛋白可以作为研究Potyvirus系统发育关系的新的分子标记。
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关键词
马铃薯Y病毒
pipo基因
病毒进化
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职称材料
试论经济危机背景下民营企业发展动力机制
被引量:
2
4
作者
朱德琳
史凤阳
《中国商界》
2009年第1期212-213,共2页
金融危机对中国的影响还算是小的,但随之而来的经济危机对中国的影响向确实很大,特别是对中国的民营企业影响尤为明显.在这个背景下,民营企业如何保持持续发展动力,对于企业本身,乃至中国经济发展都有着重要的意义本文正是从这个角度出...
金融危机对中国的影响还算是小的,但随之而来的经济危机对中国的影响向确实很大,特别是对中国的民营企业影响尤为明显.在这个背景下,民营企业如何保持持续发展动力,对于企业本身,乃至中国经济发展都有着重要的意义本文正是从这个角度出发,对经济危机背景下民营企业发展动力机制这一课题进行探讨.创新是民营企业持续发展的永久动力和最终决定力量,而这种创新具体对于我国民营企业来说,主要体现在技术创新和管理创新两个方面.
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关键词
经济危机
民营企业
对中国的影响
发展动力机制
技术创新
中国经济发展
企业持续发展
企业影响
决定力量
金融危机
管理创新
课题
角度
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职称材料
浅议职高数学教学低效的原因及对策
5
作者
史凤阳
《好家长》
2018年第25期98-98,共1页
数学学科是职高教育阶段的一门基础的、重要的课程,其教学有效性的高低对学生学习专业课及其他学科效果的优劣产生直接影响。但是,当前很多职高数学教学普及存在低效的问题,阻碍了学生数学能力与素养的提升,不利于学生就业能力的增强。...
数学学科是职高教育阶段的一门基础的、重要的课程,其教学有效性的高低对学生学习专业课及其他学科效果的优劣产生直接影响。但是,当前很多职高数学教学普及存在低效的问题,阻碍了学生数学能力与素养的提升,不利于学生就业能力的增强。本文救职高数学教学低效的原因及对策,进行了细致的研究。
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关键词
职高数学
低效
原因
对策
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职称材料
题名
马铃薯Y病毒福建分离物P1基因的分子变异和结构特征
被引量:
9
1
作者
史凤阳
高芳銮
沈建国
常飞
詹家绥
机构
福建农林大学植物病毒研究所
福建出入境检验检疫局检验检疫技术中心
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期713-722,共10页
基金
国家现代农业马铃薯产业技术体系(编号:CARS-10)
福建省自然科学基金项目(编号:2013J01088)
+2 种基金
福建省教育厅科技项目(编号:JA12119)
国家质检总局科技计划项目(编号:2013IK299,2013IK094)
福建出入境检验检疫局科技项目(编号:FK2011-07,FK2007-07)资助
文摘
为揭示马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)P1基因的分子变异及结构特征,并查明福建分离物P1基因的变异来源。文章设计一对简并引物从感染PVY的马铃薯病叶扩增、克隆获得福建分离物P1基因的cDNA全长序列,分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征,并采用贝叶斯法重建P1基因的系统发育树。结果显示,12个福建分离物均成功扩增出预期大小(约915 bp)的特异性片段,P1基因的核苷酸序列与已报道的PVY不同株系的核苷酸序列一致性为73%~99%;QK44、XT02、XT08、LH05分离物的309 nt位置均检测到一个强烈的重组信号。12个PVY分离物中,P1蛋白有85个变异的氨基酸位点,表明其高度变异;P1蛋白的第41~275位是一个高度保守的结构功能域,含有3个保守的活性位点(H192、D201、V235);系统发育分析显示,福建分离物形聚为3种不同的簇,其对应的卷曲结构(Coiled-coil domain)和空间结构也不相同,表明不同株系型的P1基因在系统发育关系上分化较大。该研究结果表明PVY P1基因在核苷酸序列、氨基酸序列以及空间结构具有高度变异性,但行使P1蛋白功能的活性位点所在的氨基酸(H192、D201和V235)均高度保守;福建分离物P1基因的变异源主要来自碱基突变和基因重组。
关键词
马铃薯Y病毒
P1基因
变异
重组
Keywords
Potato virus Y
P1 gene
variation
recombination
分类号
S435.32 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
中国马铃薯Y病毒的检测鉴定及CP基因的分子变异
被引量:
29
2
作者
高芳銮
沈建国
史凤阳
方治国
谢联辉
詹家绥
机构
福建省植物病毒学重点实验室
福建出入境检验检疫局检验检疫技术中心
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第15期3125-3133,共9页
基金
国家现代农业马铃薯产业技术体系(CARS-10)
福建省自然科学基金项目(2013J01088)
+1 种基金
福建省教育厅科技项目(JA12119)
福建出入境检验检疫局科技项目(FK2011-07)
文摘
【目的】查明马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)病在中国的发生情况,及时、准确地鉴定出PVY并对其分子变异进行分析。【方法】采用ELISA方法对采自中国14个省(直辖市)马铃薯种植区疑似受PVY感染的样品进行了检测,并对其中的部分材料镜检验证,然后根据CP基因序列设计1对简并引物针对随机选择感染PVY的14个省(直辖市)代表样品进行CP基因扩增克隆,将测序得到的序列进行分子变异分析,并使用贝叶斯法(Bayesian inference,BI)重建系统发育关系。【结果】ELISA检测结果表明,691份样品中220个样品与PVY抗体呈阳性反应,其余呈阴性反应;ELISA检测的阳性材料在透射电镜下均可观察到明显的风轮状内含体,14个PVY分离物均成功扩增出预期大小(约800 bp)的特异性片段,CP基因的核苷酸序列与已报道PVY不同株系的核苷酸序列一致性均在88%以上;在14个PVY分离物CP基因中共发现有29个多态性位点,其中6个简约信息位点,23个单一变异位点。系统发育分析结果显示,14个PVY分离物与PVYN:O株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上,与PVYN:O株系的亲缘关系最近。【结论】PVY CP基因高度保守,但不同地区分离物也存在一定的分子变异,本研究可为今后了解PVY病毒病流行、变异趋势及其防治提供依据。
关键词
马铃薯Y病毒
ELISA
外壳蛋白基因
分子变异
贝叶斯法
Keywords
Potato virus Y
ELISA
coat protein gene(CP gene)
molecular variation
Bayesian inference method
分类号
S435.32 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
马铃薯Y病毒pipo基因的分子变异及结构特征分析
被引量:
11
3
作者
高芳銮
沈建国
史凤阳
常飞
谢联辉
詹家绥
机构
福建农林大学植物病毒研究所
福建出入境检验检疫局检验检疫技术中心
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期1125-1134,共10页
基金
国家现代农业马铃薯产业技术体系(编号:CARS-10)
福建省自然科学基金项目(编号:2013J01088)
+1 种基金
福建省教育厅科技项目(编号:JA12119)
福建出入境检验检疫局科技项目(编号:FK2011-07)资助
文摘
为揭示马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)pipo基因的分子变异和结构特征,文章根据文献报道的马铃薯Y病毒属(Potyvirus)pipo基因保守区序列设计一对简并引物,从感染PVY的马铃薯病叶中克隆获得pipo基因的cDNA全长序列,分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征,并基于氨基酸序列使用贝叶斯法重建了Potyvirus的系统发育树。结果显示:20个PVY分离物成功扩增出预期大小(约235bp)的特异性片段,其核苷酸序列与已报道的其它PVY株系的pipo基因核苷酸序列一致性均在92%以上;5′端均含有典型的G1-2A6-7基序(motif),无碱基插入/缺失,所有的核苷酸变异都是碱基置换,共发现13个多态性位点,其中4个简约信息位点,9个单一变异位点,表明该基因高度保守,但不同分离物也存在一定的分子变异;PIPO蛋白理论等电点11.26~11.62,无信号肽和跨膜区,是可溶的亲水性蛋白;整个蛋白含有3个保守区,其中位于10~59aa的基序最为保守。该蛋白主要定位于线粒体中,可能是线粒体导肽。系统发育分析结果显示,源于PVY不同株系优先相聚成簇,而向日葵褪绿斑驳病毒(Sunflower chlorotic mottle virus,SuCMoV)与辣椒重花叶病毒(Pepper severe mosaic virus,PepSMV)的亲缘关系较PVY相比更近,与前人的结果相一致,表明PIPO蛋白可以作为研究Potyvirus系统发育关系的新的分子标记。
关键词
马铃薯Y病毒
pipo基因
病毒进化
Keywords
Potato virus Y
pipo gene
evolution of virus
分类号
S435.32 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
试论经济危机背景下民营企业发展动力机制
被引量:
2
4
作者
朱德琳
史凤阳
机构
辽宁爱母医疗科技有限公司
出处
《中国商界》
2009年第1期212-213,共2页
文摘
金融危机对中国的影响还算是小的,但随之而来的经济危机对中国的影响向确实很大,特别是对中国的民营企业影响尤为明显.在这个背景下,民营企业如何保持持续发展动力,对于企业本身,乃至中国经济发展都有着重要的意义本文正是从这个角度出发,对经济危机背景下民营企业发展动力机制这一课题进行探讨.创新是民营企业持续发展的永久动力和最终决定力量,而这种创新具体对于我国民营企业来说,主要体现在技术创新和管理创新两个方面.
关键词
经济危机
民营企业
对中国的影响
发展动力机制
技术创新
中国经济发展
企业持续发展
企业影响
决定力量
金融危机
管理创新
课题
角度
分类号
F72 [经济管理—产业经济]
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职称材料
题名
浅议职高数学教学低效的原因及对策
5
作者
史凤阳
机构
安徽省铜陵市安庆浮山科技工程学校
出处
《好家长》
2018年第25期98-98,共1页
文摘
数学学科是职高教育阶段的一门基础的、重要的课程,其教学有效性的高低对学生学习专业课及其他学科效果的优劣产生直接影响。但是,当前很多职高数学教学普及存在低效的问题,阻碍了学生数学能力与素养的提升,不利于学生就业能力的增强。本文救职高数学教学低效的原因及对策,进行了细致的研究。
关键词
职高数学
低效
原因
对策
分类号
G633.6 [文化科学—教育学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马铃薯Y病毒福建分离物P1基因的分子变异和结构特征
史凤阳
高芳銮
沈建国
常飞
詹家绥
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2014
9
下载PDF
职称材料
2
中国马铃薯Y病毒的检测鉴定及CP基因的分子变异
高芳銮
沈建国
史凤阳
方治国
谢联辉
詹家绥
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013
29
下载PDF
职称材料
3
马铃薯Y病毒pipo基因的分子变异及结构特征分析
高芳銮
沈建国
史凤阳
常飞
谢联辉
詹家绥
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2013
11
下载PDF
职称材料
4
试论经济危机背景下民营企业发展动力机制
朱德琳
史凤阳
《中国商界》
2009
2
下载PDF
职称材料
5
浅议职高数学教学低效的原因及对策
史凤阳
《好家长》
2018
0
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职称材料
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