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基于TCGA数据库建立胆管癌自噬相关基因预后预测模型及其应用 被引量:4
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作者 史华帝 左瑜芳 +2 位作者 钟富兰 易小琼 徐祖敏 《山东医药》 CAS 2021年第2期6-11,共6页
目的利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库构建胆管癌自噬相关基因(ARGs)预后预测模型。方法通过人类自噬数据库和分子特征数据库获得531个胆管癌ARGs。从TCGA数据库中选择CHOL队列的转录组和临床数据进行下载,包含胆管癌组织36例、正常胆管... 目的利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库构建胆管癌自噬相关基因(ARGs)预后预测模型。方法通过人类自噬数据库和分子特征数据库获得531个胆管癌ARGs。从TCGA数据库中选择CHOL队列的转录组和临床数据进行下载,包含胆管癌组织36例、正常胆管组织9例。采用Perl软件将原始测序数据进行合并,提取所有ARGs的表达数据;利用R软件对胆管癌组织和正常胆管组织中的ARGs进行差异表达分析,筛选出胆管癌组织中表达失调的ARGs,并进行GO功能富集和KEGG信号通路分析。利用单因素Cox及Lasso回归模型筛选关键ARGs,多因素Cox回归模型建立预后预测模型,根据关键ARGs的mRNA表达水平和风险系数计算每个患者的风险评分,按其中位数将胆管癌患者分为高风险组和低风险组,绘制生存曲线,比较两组的生存期。绘制预后预测模型的ROC曲线,评价其预测预后的敏感度和特异性。最后利用R软件构建基于关键ARGs的列线图,绘制校准曲线评估实际生存和预测生存的一致性。结果与正常胆管组织比较,胆管癌组织中有324个表达失调的ARGs。这些ARGs主要涉及自噬、利用自噬机制的过程、大自噬、自噬的调节、凋亡等生物学过程和信号通路。经过单因素Cox和Lasso回归分析,筛选出5个关键ARGs,即VPS11、EVA1A、BNIP3、GABARAP、VPS4B。以这5个关键ARGs建立预测胆管癌患者预后的风险模型,风险评分=(-3.739×VPS11)+(1.691×EVA1A)+(1.734×BNIP3)+(5.776×GABARAP)+(-1.310×VPS4B)。生存分析显示,高风险组的总生存时间低于低风险组,预测1年、2年、3年生存率的ROC曲线下面积均大于0.9。构建了基于5个ARGs的列线图(C指数为0.822,95%CI为0.721~0.924),另外,绘制预测1年、2年、3年生存率的校准曲线几乎都落在了45°的对角线上,提示该模型的准确性和区分能力较好。结论成功构建了基于VPS11、EVA1A、BNIP3、GABARAP、VPS4B共5个关键ARGs表达的胆管癌预后风险预测模型,该模型可有效预测胆管癌患者的预后。 展开更多
关键词 胆管癌 预后风险模型 列线图 癌症基因组图谱数据库 自噬相关基因
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替吉奥联合三维适形放疗治疗中晚期食管胃结合部癌的疗效观察
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作者 林菜梅 罗泽民 +3 位作者 李勇 黄瑞文 史华帝 李乔巧 《医学理论与实践》 2014年第23期3128-3130,共3页
目的:探讨中晚期食管胃结合部癌患者接受替吉奥化疗与三维适形放疗联合治疗的临床效果。方法:选取2010年4月-2013年6月期间我院收治的60例食管胃结合部肿瘤患者为本文观察对象,随机将其均分为对照组与实验组各30例,其中对照组患者接受... 目的:探讨中晚期食管胃结合部癌患者接受替吉奥化疗与三维适形放疗联合治疗的临床效果。方法:选取2010年4月-2013年6月期间我院收治的60例食管胃结合部肿瘤患者为本文观察对象,随机将其均分为对照组与实验组各30例,其中对照组患者接受三维适形放疗,实验组在此基础上联用替吉奥化疗方案,观察两组治疗总有效率,并统计不良反应发生率。结果:与对照组相比,实验组患者治疗总有效率更高,组间差异具有统计学意义(P<0.05);两组不良反应发生率无显著差异,不具有统计学意义(P>0.05)。结论:对于中晚期食管胃结合部肿瘤患者而言,在三维适形放疗基础上联合替吉奥化疗方案进行治疗可收到满意治疗效果,临床应予以推广使用。 展开更多
关键词 食管胃结合部癌 中晚期 三维适形放疗 替吉奥化疗 疗效
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苦参碱对非小细胞肺癌的放射增敏作用 被引量:3
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作者 徐祖敏 杨俊 +3 位作者 邓于红 贺红桂 史华帝 左瑜芳 《广东医科大学学报》 2020年第5期547-552,共6页
目的探讨苦参碱对非小细胞肺癌(NSCLC)放射增敏作用机制。方法人NSCLC细胞株H1299、A549分为对照组、苦参碱组、放疗组、苦参碱+放疗组,分别用CCK-8、流式细胞术、平板克隆形成、蛋白印迹检测细胞增殖、凋亡、放射增敏、γ-H2AX表达。结... 目的探讨苦参碱对非小细胞肺癌(NSCLC)放射增敏作用机制。方法人NSCLC细胞株H1299、A549分为对照组、苦参碱组、放疗组、苦参碱+放疗组,分别用CCK-8、流式细胞术、平板克隆形成、蛋白印迹检测细胞增殖、凋亡、放射增敏、γ-H2AX表达。结果 0.25~8 g/L苦参碱处理明显抑制NSCLC细胞存活(P<0.01)。苦参碱+放疗组中细胞凋亡、γ-H2AX蛋白表达明显高于苦参碱组、放疗组,而细胞克隆数明显降低(P<0.01或0.05);H1299和A549细胞的放射增敏比分别为1.22和2.02。结论苦参碱联合放疗可能通过增加NSCLC细胞DNA损伤、诱导细胞凋亡,进而发挥放射增敏作用。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 苦参碱 放疗增敏 DNA损伤
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拓扑替康联合顺铂方案与足叶乙甙联合顺铂方案治疗小细胞肺癌临床疗效的比较研究 被引量:4
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作者 林菜梅 潘妙君 +5 位作者 罗泽民 李勇 池海波 陈洪毅 史华帝 李乔巧 《实用心脑肺血管病杂志》 2016年第3期63-65,共3页
目的比较拓扑替康联合顺铂方案与足叶乙甙联合顺铂方案治疗小细胞肺癌(SCLC)的临床疗效。方法选取2014年3月—2015年3月广东省农垦中心医院收治的SCLC患者38例,按照Rev Man 5.0软件生成的随机数字表将患者分为对照组与观察组,每组19... 目的比较拓扑替康联合顺铂方案与足叶乙甙联合顺铂方案治疗小细胞肺癌(SCLC)的临床疗效。方法选取2014年3月—2015年3月广东省农垦中心医院收治的SCLC患者38例,按照Rev Man 5.0软件生成的随机数字表将患者分为对照组与观察组,每组19例。两组患者化疗前均采取水化利尿治疗,观察组患者给予拓扑替康联合顺铂方案治疗,对照组患者给予足叶乙甙联合顺铂方案治疗;3周为1个化疗周期,2个化疗周期后观察临床疗效,病情无好转者则持续治疗4个化疗周期。比较两组患者的临床疗效、生存曲线及毒副作用发生率。结果两组患者临床疗效比较,差异无统计学意义(u=1.787,P〉0.05)。截至2015年9月,观察组中8例(42.1%)患者死亡,对照组中9例(47.4%)患者死亡,两组患者病死率比较,差异无统计学意义(P〉0.05)。两组患者生存曲线比较,差异有统计学意义(log-rankχ^2=8.319,P〈0.05)。观察组患者中位生存时间为12个月,对照组患者中位生存时间为7个月。对照组患者严重胃肠道反应、严重骨髓抑制发生率分别为15.8%、42.1%,观察组分别为21.1%、31.6%,差异无统计学意义(P〉0.05)。结论拓扑替康联合顺铂方案与足叶乙甙联合顺铂方案治疗SCLC患者的临床疗效相当,但拓扑替康联合顺铂方案能延长患者的生存期,且不增加毒副作用发生率。 展开更多
关键词 小细胞肺癌 拓扑替康 足叶乙甙 顺铂 疗效比较研究
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拓扑替康联合顺铂方案与足叶乙甙联合顺铂方案治疗小细胞肺癌的疗效分析 被引量:1
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作者 林菜梅 潘妙君 +5 位作者 罗泽民 李勇 池海波 陈洪毅 史华帝 李乔巧 《中国伤残医学》 2015年第12期53-54,共2页
目的:对比拓扑替康联合顺铂(TP)治疗方案与足叶乙甙联合顺铂(EP)方案治疗小细胞肺癌(SCLC)的临床效果。方法:取我院收治的35例小细胞肺癌患者为本次研究对象,随机将其分为对照组19例、实验组16例,其中对照组接受EP方案治疗,... 目的:对比拓扑替康联合顺铂(TP)治疗方案与足叶乙甙联合顺铂(EP)方案治疗小细胞肺癌(SCLC)的临床效果。方法:取我院收治的35例小细胞肺癌患者为本次研究对象,随机将其分为对照组19例、实验组16例,其中对照组接受EP方案治疗,实验组接受TP方案治疗,2疗程后观察2组治疗效果并作统计学分析。结果:与对照组相比,实验组患者中位生存期更长,远期生存率更高,组间差异具有统计学意义(P〈0.05);2组治疗有效率无显著差异,不具有统计学意义(P〉0.05)。结论:对于小细胞癌患者而言,拓扑替康联合顺铂方案有利于患者生存期的延长,并提高远期生存率,但应注意对骨髓抑制等毒副反应的防治。 展开更多
关键词 小细胞肺癌 顺铂 足叶乙甙 拓扑替康
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