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基于BSA-seq技术的马铃薯块茎蛋白含量基因定位与分子标记开发
1
作者
史可昕
石瑛
张朝澍
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第3期505-514,共10页
【目的】开发与四倍体马铃薯蛋白含量相关的分子标记,加快选育高蛋白的马铃薯品种,提高马铃薯品种竞争力。【方法】以高蛋白马铃薯品种‘大西洋’为母本、低蛋白品种‘定薯1号’为父本构建分离群体,利用混池和高通量简化基因组测序技术...
【目的】开发与四倍体马铃薯蛋白含量相关的分子标记,加快选育高蛋白的马铃薯品种,提高马铃薯品种竞争力。【方法】以高蛋白马铃薯品种‘大西洋’为母本、低蛋白品种‘定薯1号’为父本构建分离群体,利用混池和高通量简化基因组测序技术相结合的方法(BSA-seq)对马铃薯块茎蛋白含量进行QTL定位,在定位区间开发与马铃薯块茎蛋白含量紧密连锁的SSR标记,并使用分离群体及四倍体马铃薯品种进行筛选验证。【结果】在2号、4号染色体共定位到3个控制马铃薯块茎蛋白含量的主效位点,分别位于2号染色体18.88~21.59 Mb,区间大小为2.71 Mb;4号染色体8.3~12.84 Mb,区间大小为4.54 Mb;4号染色体65.12~66.39 Mb,区间大小为1.27 Mb。根据定位区域、基因位置及参考基因组信息,使用NR、 Tr EMBL、 KEGG、 GO、 KOG、 swissprot、 PFAM共7个功能数据库对候选基因进行功能注释,共注释到719个候选基因,注释基因显著富集在玉米素合成代谢通路,该代谢通路可阻止蛋白质降解。在2号染色体18.88~21.59 Mb区间内开发分子标记pChr2-4。用分离群体、四倍体马铃薯品种结合田间表型对pChr2-4的准确性进行鉴定,结果显示,pChr2-4在离群体、四倍体马铃薯品种中的准确性分别为73.17%和81.82%,准确度较高。【结论】通过BSA混池测序,检测到3个与马铃薯块茎蛋白含量相关的区间。在2号染色体开发与马铃薯块茎蛋白含量紧密连锁的标记pChr2-4,该标记有助于马铃薯块茎蛋白含量分子标记辅助育种。
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关键词
马铃薯蛋白含量
BSA-seq
SSR标记
分子标记辅助选择
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职称材料
郑州市屋顶绿化发展研究
2
作者
史可昕
李海英
+2 位作者
张杰
李航
王婧雯
《现代园艺》
2019年第21期51-54,共4页
屋顶绿化作为一种新型的绿化手段,以其新颖的设计理念及对环境的保护作用,逐渐受到各国的重视.采用现场调研的手法,调查了郑州市5个市辖区共20个屋顶绿化场所,并分析其发展现状,将现存问题作为研究内容,进一步提出解决措施,推动屋顶绿...
屋顶绿化作为一种新型的绿化手段,以其新颖的设计理念及对环境的保护作用,逐渐受到各国的重视.采用现场调研的手法,调查了郑州市5个市辖区共20个屋顶绿化场所,并分析其发展现状,将现存问题作为研究内容,进一步提出解决措施,推动屋顶绿化在郑州市的发展.
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关键词
屋顶绿化
现存问题
对策
郑州市
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职称材料
题名
基于BSA-seq技术的马铃薯块茎蛋白含量基因定位与分子标记开发
1
作者
史可昕
石瑛
张朝澍
机构
东北农业大学农学院
寒地粮食作物品种改良与生理生态教育部重点实验室
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第3期505-514,共10页
基金
黑龙江省自然科学基金联合引导项目(LH2021C027)
东北农业大学东农学者计划(18QC04)。
文摘
【目的】开发与四倍体马铃薯蛋白含量相关的分子标记,加快选育高蛋白的马铃薯品种,提高马铃薯品种竞争力。【方法】以高蛋白马铃薯品种‘大西洋’为母本、低蛋白品种‘定薯1号’为父本构建分离群体,利用混池和高通量简化基因组测序技术相结合的方法(BSA-seq)对马铃薯块茎蛋白含量进行QTL定位,在定位区间开发与马铃薯块茎蛋白含量紧密连锁的SSR标记,并使用分离群体及四倍体马铃薯品种进行筛选验证。【结果】在2号、4号染色体共定位到3个控制马铃薯块茎蛋白含量的主效位点,分别位于2号染色体18.88~21.59 Mb,区间大小为2.71 Mb;4号染色体8.3~12.84 Mb,区间大小为4.54 Mb;4号染色体65.12~66.39 Mb,区间大小为1.27 Mb。根据定位区域、基因位置及参考基因组信息,使用NR、 Tr EMBL、 KEGG、 GO、 KOG、 swissprot、 PFAM共7个功能数据库对候选基因进行功能注释,共注释到719个候选基因,注释基因显著富集在玉米素合成代谢通路,该代谢通路可阻止蛋白质降解。在2号染色体18.88~21.59 Mb区间内开发分子标记pChr2-4。用分离群体、四倍体马铃薯品种结合田间表型对pChr2-4的准确性进行鉴定,结果显示,pChr2-4在离群体、四倍体马铃薯品种中的准确性分别为73.17%和81.82%,准确度较高。【结论】通过BSA混池测序,检测到3个与马铃薯块茎蛋白含量相关的区间。在2号染色体开发与马铃薯块茎蛋白含量紧密连锁的标记pChr2-4,该标记有助于马铃薯块茎蛋白含量分子标记辅助育种。
关键词
马铃薯蛋白含量
BSA-seq
SSR标记
分子标记辅助选择
Keywords
Potato protein content
BSA⁃seq
Simple Sequence Repeats
Marker⁃assisted selection
分类号
S532 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
郑州市屋顶绿化发展研究
2
作者
史可昕
李海英
张杰
李航
王婧雯
机构
华北水利水电大学艺术与设计学院
河南工程学院艺术设计学院
出处
《现代园艺》
2019年第21期51-54,共4页
文摘
屋顶绿化作为一种新型的绿化手段,以其新颖的设计理念及对环境的保护作用,逐渐受到各国的重视.采用现场调研的手法,调查了郑州市5个市辖区共20个屋顶绿化场所,并分析其发展现状,将现存问题作为研究内容,进一步提出解决措施,推动屋顶绿化在郑州市的发展.
关键词
屋顶绿化
现存问题
对策
郑州市
分类号
TU9 [建筑科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于BSA-seq技术的马铃薯块茎蛋白含量基因定位与分子标记开发
史可昕
石瑛
张朝澍
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
郑州市屋顶绿化发展研究
史可昕
李海英
张杰
李航
王婧雯
《现代园艺》
2019
0
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职称材料
已选择
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