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单环刺螠对六价铬暴露响应的转录组学分析
1
作者
刘顺
许星鸿
+5 位作者
史安心
薛寒璐
王思婕
李百玉
朱龙
徐国成
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期74-84,共11页
六价铬[hexavalent chromium,Cr(VI)]是海洋中常见的重金属污染元素之一。为探究Cr(VI)对海洋底栖动物的毒性作用,采用高通量测序技术(RNA-seq)对Cr(VI)暴露前后单环刺螠(Urechis unicinctus)体腔细胞进行转录组测序和比较分析。结果表...
六价铬[hexavalent chromium,Cr(VI)]是海洋中常见的重金属污染元素之一。为探究Cr(VI)对海洋底栖动物的毒性作用,采用高通量测序技术(RNA-seq)对Cr(VI)暴露前后单环刺螠(Urechis unicinctus)体腔细胞进行转录组测序和比较分析。结果表明:Cr(VI)暴露后,筛选到1 352个差异表达基因(DEGs),其中有729个基因表达上调,623个基因表达下调。GO功能注释显示,DEGs主要富集于催化活性、结合、转运体活性、信号转导和抗氧化活性等功能。451个DEGs被注释到172个KEGG信号通路中,主要富集于真核生物核糖体生物合成、醚脂代谢、高级糖基化终末产物-受体信号通路和谷胱甘肽代谢等通路。q PCR结果显示荧光定量结果与转录组测序结果一致,证实了转录组测序结果的可靠性。本研究推测Cr(VI)暴露可激活单环刺螠GSH代谢通路,与通路相关的GSH、GST、PRDX6、RRM1、γ-GT等基因在抵御Cr(VI)暴露过程中发挥重要作用,研究结果可为重金属对海洋底栖动物的毒性机制和水环境监测研究提供参考。
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关键词
CR(VI)
单环刺螠
转录组
差异表达基因
GSH通路
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职称材料
题名
单环刺螠对六价铬暴露响应的转录组学分析
1
作者
刘顺
许星鸿
史安心
薛寒璐
王思婕
李百玉
朱龙
徐国成
机构
江苏海洋大学海洋科学与水产学院
江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与环境重点实验室
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期74-84,共11页
基金
江苏省科技厅苏北科技专项(SZ-LYG202124,LYG-SZ201814)
连云港市花果山英才计划(KK20100)
连云港市科技局现代农业项目(CN1411)。
文摘
六价铬[hexavalent chromium,Cr(VI)]是海洋中常见的重金属污染元素之一。为探究Cr(VI)对海洋底栖动物的毒性作用,采用高通量测序技术(RNA-seq)对Cr(VI)暴露前后单环刺螠(Urechis unicinctus)体腔细胞进行转录组测序和比较分析。结果表明:Cr(VI)暴露后,筛选到1 352个差异表达基因(DEGs),其中有729个基因表达上调,623个基因表达下调。GO功能注释显示,DEGs主要富集于催化活性、结合、转运体活性、信号转导和抗氧化活性等功能。451个DEGs被注释到172个KEGG信号通路中,主要富集于真核生物核糖体生物合成、醚脂代谢、高级糖基化终末产物-受体信号通路和谷胱甘肽代谢等通路。q PCR结果显示荧光定量结果与转录组测序结果一致,证实了转录组测序结果的可靠性。本研究推测Cr(VI)暴露可激活单环刺螠GSH代谢通路,与通路相关的GSH、GST、PRDX6、RRM1、γ-GT等基因在抵御Cr(VI)暴露过程中发挥重要作用,研究结果可为重金属对海洋底栖动物的毒性机制和水环境监测研究提供参考。
关键词
CR(VI)
单环刺螠
转录组
差异表达基因
GSH通路
Keywords
Cr(Ⅵ)
Urechis unicinctus
transcriptome
differentially expressed genes
GSH pathway
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
P76 [天文地球—海洋科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
单环刺螠对六价铬暴露响应的转录组学分析
刘顺
许星鸿
史安心
薛寒璐
王思婕
李百玉
朱龙
徐国成
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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