中国汉族人近期基因组及表型进化特征

了解人类进化过程中经历的正选择,可以洞察塑造我们物种的事件,以及今天继续困扰我们的疾病.作为人口最多的民族,汉族在其特定的历史、地理和文化环境中一直在经历基因选择.本文通过对3946个中国汉族人高深度全基因组测序数据进行分析,鉴定了24个近期选择的基因组区域,包括免疫相关基因区(MHC cluster、IGH cluster、STING1、PSG)、酒精代谢相关基因区(ADH1B、ALDH2、ALDH3B2)和嗅觉感知基因OR4C16.其中MHC cluster、ADH1B和ALDH2也被TOPMed和西湖生物库WBBC鉴定.在这些信号中,IGH cluster值得关注,其中变异14105737776CT(rs117518546,IgG1-G396R)的优势等位基因可促进免疫反应,但也增加了自身免疫性疾病系统性红斑狼疮(SLE)的风险.另外,本研究新发现的ALDH3B2的进化方向对酒精代谢的影响与ALDH2的相反.除了单基因性状,本文发现多个复杂性状经历了多基因适应;特别是,多种方法一致表明,在自然选择中,较低的血压更受青睐.最后建立了一个名为RePoS的数据库(http://bigdata.ibp.ac.cn/RePoS/)以集成和显示多种群选择信号.综上,本研究扩展了我们对汉族和其他人群的自然进化和表型适应的理解.