基于外泌体exoRBase2.0数据库构建肝细胞癌相关的ceRNA网络并进行相关分析

目的基于生物大数据构建肝细胞癌(HCC)患者血液外泌体竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,并对HCC发病机制进行探究。方法从exoRBase 2.0数据库中下载HCC患者和正常人群血液外泌体基因测序数据,并应用R语言进行差异分析。通过TargetScan、miRanda、starBase和miRcode数据库预测与mRNA、lncRNA、circRNA结合的miRNA并对其进行差异表达分析,将结果导入Cytoscape软件,构建ceRNA网络,进一步对其进行GO和KEGG富集分析,并使用CytoHubba插件筛选核心基因。将核心基因导入UALCAN和Kaplan-Meier Plotter网站进行基因表达量和生存分析;并通过TIMER2.0网站进行免疫浸润分析。结果GO分析显示富集在骨髓细胞分化和横纹肌细胞分化等功能,KEGG分析显示富集在催产素信号通路和cGMP-PKG信号通路,生存分析显示CELF2高表达组HCC患者的生存率显著高于低表达组;免疫浸润分析显示CELF2的高表达与HCC患者的肿瘤纯度显著呈负相关,与多种免疫细胞显著呈正相关。结论本研究成功构建了HCC患者血液外泌体ceRNA调控网络,从分子层面阐述了HCC的发生、转移和侵袭机制,为HCC的临床诊疗提供理论支持。