基于生物学信息分析染色体分离1样基因在预测胃癌预后中的价值

目的 基于生物学信息分析染色体分离1样基因(CSE1L)在预测胃癌预后中的价值。方法 使用GEPLA数据平台分析CSE1L在肿瘤组织与癌旁正常组织中的表达情况,以及CSE1L的表达与胃癌患者病理分期之间的关系;利用在线数据平台Kaplan-Meier plotter分析CSE1L表达水平与胃癌患者总生存时间(OS)和首次进展生存期(FP)之间的关系;绘制CSE1L蛋白互作网络图,并进行功能富集分析,分析其作用机制。结果 GEPLA数据平台基因检测结果显示,CSE1L基因在胃癌组织中的表达水平显著升高(P<0.05),CSE1L的表达与胃癌患者的病理分期没有显著差异(P>0.05);Kaplan-Meier plotter在线数据平台分析结果显示,CSE1L表达高的胃癌患者OS、FP较低表达患者更短(P<0.05);功能富集分析显示,CSE1L及互作蛋白参与核转运,影响肿瘤的进展。结论 CSE1L可能是胃癌新的预后和潜在治疗标志物,其可通过影响核转运促进肿瘤的进展。

多房棘球蚴病患者肝病灶组织差异表达基因的研究

目的探讨多房棘球蚴感染小鼠肝差异基因在多房棘球蚴病患者肝病灶组织中的表达情况及意义。方法选取高通量基因表达数据库中编号为GSE24376的小鼠感染多房棘球蚴基因芯片数据集,分析感染小鼠和未感染小鼠之间的差异表达基因,对差异表达基因进行基因本体(GO)分析。取6例多房棘球蚴病患者肝病灶组织和距离病灶组织2 cm的周围肝组织,采用荧光定量PCR检测2个高表达差异基因mRNA相对转录水平。取45份多房棘球蚴病患者石蜡包埋肝组织样品(炎性反应和肝纤维化改变严重的病灶29份,较少炎性细胞浸润和肝纤维化病变的肝组织16份),采用免疫组化法分析2个高表达差异基因的表达情况。用SPSS 21.0统计学软件对数据进行统计分析。结果生物信息学分析结果显示,共筛选出21个差异表达基因,其中9个基因表达上调,12个基因表达下调。GO分析结果显示,差异基因主要位于细胞内囊泡及细胞外基质等细胞成分中,参与了中性粒细胞的脱颗粒及活化等生物过程,并且具有CC趋化因子受体结合活性及趋化因子活性。高表达差异基因CHI3L3 (在人体中为CHI3L1)和CCL8荧光定量PCR结果显示,6例多房棘球蚴病患者肝病灶组织中CHI3L1和CCL8 mRNA相对转录水平均高于病灶周围肝组织(P <0.01),最高倍数分别达7倍和9倍。免疫组化分析结果显示:29份多房棘球蚴病患者肝组织炎性反应和肝纤维化改变严重的病灶样品中,有20份(占69%)呈CHI3L1蛋白高表达,其主要着色部位位于细胞浆;有22份(占76%)呈CCL8蛋白高表达。16份多房棘球蚴病患者肝组织轻微炎症样品中,2份(占13%)呈CHI3L1蛋白阳性;4份(占33%)呈CCL8蛋白阳性。炎性反应和肝纤维化改变严重的病灶组织中,CHI3L1和CCL8蛋白的阳性表达率分别达96%和97%,均高于轻微炎症肝组织的3%和8%(P <0.01)。结论 CHI3L1和CCL8蛋白在多房棘球蚴病患者肝组织中表达增高,提示二者在机体对虫体的免疫应答过程中发挥了一定作用。