基于网络药理学与分子对接方法的苓甘五味姜辛汤抗新冠肺炎(COVID-19)的作用机制与活性成分研究

目的:采用网络药理学与分子对接法研究苓甘五味姜辛汤抗新冠肺炎(COVID-19)的作用机制与活性成分。方法:借助TCMSP数据库检索苓甘五味姜辛汤的化学成分及成分作用靶点,通过Swiss Target Prediction数据库剔除可能性为0的靶点。以"coronavirus""pneumonia""cough""fever"为检索词在GeneCards及OMIM数据库中检索疾病相应靶点。通过Uniprot数据库校正药物和疾病靶点名称,取苓甘五味姜辛汤与疾病靶点交集,进而运用Cytoscape 3.7. 2软件构建中药-化合物-靶点网络进行可视化,用靶点交集通过STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,DAVID数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,预测交集靶点作用机制,并进行可视化。将中药-化合物-靶点网络中的化合物与新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 3CL水解酶和血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行对接,选取与SARS-CoV-2 3CL水解酶结合能最小的6个化合物作为核心活性成分,做进一步研究。结果:中药-化合物-靶点网络包含了5种中药,67个化合物和靶点141个。PPI网络的关键基因涉及AKT1、MAPK1、MAPK3等,GO功能富集分析得到条目104个,KEGG通路富集分析筛选得到99条信号通路。分子对接结果显示6个核心活性成分甘草异黄烷酮、卡里宾、甘草素L、夏姆比奥纳、光甘草宁、五味子素R,与SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2的结合能普遍较推荐化药小。结论:苓甘五味姜辛汤中的化合物能通过与SARS-CoV-2 3CL水解酶和ACE2结合作用于AKT1、MAPK1、MAPK3等靶点,调节朊病毒病信号通路、非洲淋巴细胞瘤病毒感染通路、小细胞肺癌信号通路和非小细胞肺癌信号通路等发挥抗COVID-19作用。

灵芝补气安神功效对动物焦虑行为影响的实验研究

目的:观察灵芝水煎液及其粗多糖对动物焦虑行为的抗焦虑作用及机制。方法:建立装置焦虑模型小鼠和心气虚焦虑装置大鼠模型,除正常对照组、焦虑模型对照组,大小鼠分别灌胃地西泮2.5 mg/kg、灵芝水煎液2、4、6 g/kg、灵芝粗多糖0.04、0.08、0.12 g/kg,末次给药后1 h,观察大、小鼠于高架十字迷宫(EPM)实验中开臂进入次数百分比(OE%)、开臂滞留时间百分比(OT%)及明暗箱(LDT)实验中穿梭次数;行为学实验结束后取大鼠血及大、小鼠脑组织,ELISA法测定小鼠脑组织中小鼠γ-氨基丁酸(GABA)、谷氨酸(GLU)、5-羟色胺(5-HT)的含量;试剂盒测定大鼠脑组织中GABA、GLU含量,γ-氨基丁酸转氨酶(GABA-T)、谷氨酸脱羧酶(GAD)、谷氨酰胺合成酶(GS)活力,血清超氧化物歧化酶(SOD)活力、丙二醛(MDA),血浆环磷酸腺苷(cAMP)、环磷酸鸟苷(cGMP)、心钠素(ANP)含量;免疫组化法观察海马γ-氨基丁酸受体α1(GABAARα1)阳性表达。结果:随心气虚造模时间延长,各组大鼠体质量明显降低,19 d起,各给药组大鼠体质量降幅逐渐减小,22 d起各给药组大鼠体质量均大于心气虚焦虑模型组;灵芝水煎液及粗多糖均可显著升高大、小鼠的OE%、OT%、穿梭次数和脑组织中GABA含量,降低GLU含量及GLU/GABA的比值;降低小鼠脑中5-HT含量;降低大鼠脑中GABA-T活性;升高大鼠脑中GAD、GS活力,血清SOD活力、血浆cAMP含量,降低血清MDA、血浆cGMP、ANP含量,增强海马GABAARα1受体阳性表达;等质量灵芝饮片的水提取物、多糖提取物,表现出相似的抗焦虑效果。结论:灵芝水煎液及其粗多糖对动物焦虑行为有明显抗焦虑作用,抗焦虑主要活性部位可能为灵芝多糖。作用机制与通过调节GLU/GABA-Gln代谢环路中相关酶的活力,升高GABA含量和上调下游GABA/GABAARα1信号通路的表达,纠正兴奋-抑制性神经递质的失衡有关。

基于网络药理学与分子对接方法的热毒宁注射液治疗COVID-19作用机制与活性成分研究

目的采用网络药理学与分子对接法探索热毒宁注射液治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在作用机制与活性成分。方法2020-04-18-2020-04-20借助中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)及中医药百科全书(ETCM)数据库检索热毒宁注射液组成青蒿、金银花和栀子的化学成分和作用靶点,通过Swiss Target Prediction数据库剔除可能性为0靶点。在GeneCards库及在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库中以"干咳""发热""冠状病毒""肺炎"对应词检索COVID-19相关靶点。Uniprot数据库校正靶点名称,取热毒宁注射液与COVID-19的交集靶点,运用Cytoscape制作热毒宁注射液中药-成分-交集靶点网络,使用DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集预测中药单体化合物治疗COVID-19的作用机制。将所有化合物与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶进行对接,选取结合能最小的6个化合物与血管紧张素转化酶2(ACE2)进行对接。结果热毒宁注射液的中药-成分-交集靶点网络包含3种中药、38个化合物和217个相应靶点,关键靶点涉及PTGS2、NCOA2、DPP4、AR和PTGS1等。GO功能富集分析得到条目P<0.05的341个,KEGG通路富集分析筛选得到135条信号通路。分子对接结果显示,牡荆素、苏丹Ⅲ、6,8-二-c-葡萄糖苷、茵陈黄酮、圣草酚和异鼠李素等6个核心化合物与SARS-CoV-23CL水解酶的结合能分别为-30.98、-30.98、-30.57、-29.31、-29.31和-29.31kJ/mol,与ACE2的结合能分别为-22.19、-21.35、-22.19、-20.52、-22.19和-21.77kJ/mol,均与推荐化学药相似。结论热毒宁注射液中的化合物能通过与SARS-CoV-23CL水解酶和ACE2结合作用于PTGS2、NCOA2、DPP4、AR和PTGS1等靶点调节Toll样受体信号通路、非洲淋巴细胞瘤病毒感染、甲型流感和朊病毒病等通路发挥治疗COVID-19作用。

基于网络药理学与分子对接方法的疏风解毒胶囊治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制与活性成分研究

目的采用网络药理学与分子对接法探索疏风解毒胶囊治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在作用机制与活性成分。方法借助TCMSP数据库检索疏风解毒胶囊组成药材板蓝根、虎杖、连翘、芦根、败酱草、马鞭草、柴胡、甘草的化学成分和作用靶点,通过SwissTargetPrediction数据库剔除可能性为0的靶点。以"冠状病毒(coronavirus)""肺炎(pneumonia)""咳嗽(cough)""发热(fever)"为检索词在GeneCards及OMIM数据库中检索疾病相应靶点。通过Uniprot数据库校正靶点名称,取疏风解毒胶囊与疾病靶点交集,进而运用Cytoscape 3.7.2软件构建中药-化合物-靶点网络进行可视化,通过DAVID数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,预测交集靶点作用机制,并绘制柱状图及气泡图进行可视化。然后将所有化合物与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶进行对接,选取结合能最小的前5个化合物与血管紧张素转化酶II(ACE2)进行对接。结果中药-化合物-靶点网络包含了8种中药,157个化合物和相应靶点260个,关键靶点涉及PTGS2、ESR1、AR等。GO功能富集分析得到条目393个(P<0.05),KEGG通路富集分析筛选得到139条信号通路。分子对接结果显示6-(3-氧吲哚-2-亚立德)吲哚[2,1-b]喹唑啉-12-酮、荷包牡丹碱、大黄素甲醚葡萄糖苷、双氢轮叶十齿草碱和甘草异黄烷酮5个核心化合物与SARS-CoV-23CL水解酶及ACE2的结合能较推荐化学药小。结论疏风解毒胶囊中的化合物能通过与SARS-CoV-23CL水解酶及ACE2结合作用于PTGS2、ESR1、AR等靶点调节人巨细胞病毒感染、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、IL-17信号通路等信号通路、小细胞肺癌等发挥治疗COVID-19作用。