小果野蕉microRNAs及其靶基因的生物信息学预测

通过基于表达序列标签(EST)、基因组勘测序列(GSS)和高通量测序基因组序列(HTGS)的同源序列比对搜索,以及一系列的标准筛选,最终预测到属于8个家族的10条小果野蕉miRNAs。在线软件psRNATarget预测到24对miRNAs与靶基因的互作,这些靶基因主要参与小果野蕉的新陈代谢、生长发育以及胁迫响应等过程。

木薯中miR393的RT-PCR鉴定及前体的克隆与结构分析

研究木薯中表达的miRNA对深入探明木薯生长发育的调控机制具有十分重要的意义。通过RT-PCR证实木薯中有miR393的表达。采用比较基因组学的方法,从木薯基因组DNA中克隆到miR393的前体,对该miRNA前体的二级结构及与其它物种序列的同源性进行分析,结果表明,miR393前体序列在不同物种间保守性不高,但成熟的miR393序列在不同物种间保守性较高。