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羟基多溴二苯醚生物活性的QSAR研究
被引量:
3
1
作者
易忠胜
李连臣
+2 位作者
叶廷文
刘红艳
莫凌云
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2011年第3期430-438,共9页
采用VSMP方法从大量的分子结构描述符中筛选最优子集,用多元线性回归方法分别构建了羟基多溴二苯醚(hydroxylated polybrominated diphenyl ethers,OH-PBDEs)对细胞色素CYP19介导类固醇生成的抑制活性,甲状腺受体-β(thyroid receptors,...
采用VSMP方法从大量的分子结构描述符中筛选最优子集,用多元线性回归方法分别构建了羟基多溴二苯醚(hydroxylated polybrominated diphenyl ethers,OH-PBDEs)对细胞色素CYP19介导类固醇生成的抑制活性,甲状腺受体-β(thyroid receptors,TR-β)的激素活性以及与甲状腺素结合球蛋白(thyrox-ine-binding globulin,TBG)和甲状腺转运蛋白(transthyretin,TTR)之间结合能力的定量构效关系(quantita-tive structure-activity relationship,QSAR)模型。模型的留一法交叉验证(leave-one-out cross validation,LOO-CV)相关系数Q2和拟合相关系数R2均高于0.95和0.97,表明模型具有良好的稳健性、拟合能力和预测能力。QSAR模型表明OH-PBDEs的分子三维结构和芳香性是其活性的重要影响因素。另外,分子中溴原子数量和取代位置对OH-PBDE生物活性具有重要影响。
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关键词
羟基多溴二苯醚(OH-PBDEs)
细胞色素CYP19
甲状腺受体-β(TR-β)
甲状腺素结合球蛋白(TBG)
甲状腺转运蛋白(TTR)
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职称材料
基于密度泛函理论的细胞色素P450 1A2抑制剂的定量构效关系
2
作者
易忠胜
叶廷文
+1 位作者
刘红艳
莫凌云
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2013年第1期99-106,共8页
在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(Vm)与萘、内酯衍生物及其他化合物对细胞色素氧化酶P4...
在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(Vm)与萘、内酯衍生物及其他化合物对细胞色素氧化酶P450 1A2抑制剂的两变量线性QSAR模型,结果表明:所选的2个分子结构描述符与50个抑制剂的活性之间具有很强的线性关系(相关系数r2=0.907 0)和内部预测能力(留多法交叉验证相关系数q2=0.751 7)。同时,将50个化合物分成奇数集和偶数集各自进行筛选建模,并彼此进行外部预测,对全部样本集、奇数集和偶数集样本模型进行了y-Randomization检验,结果表明描述符EHOMO和Vm建立的模型均非常稳定并具有很高的预测能力。
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关键词
细胞色素P450
1A2
抑制剂
定量结构-活性相关
密度泛函理论(DFT)
VSMP
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职称材料
题名
羟基多溴二苯醚生物活性的QSAR研究
被引量:
3
1
作者
易忠胜
李连臣
叶廷文
刘红艳
莫凌云
机构
桂林理工大学化学与生物工程学院
广西师范大学珍稀濒危动植物生态与环境保护省部共建教育部重点实验室
出处
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2011年第3期430-438,共9页
基金
广西自然科学基金项目(2011GXNSFA018061)
广西教育厅科研项目(200708LX265)
珍稀濒危动植物生态与环境保护省部共建教育部重点实验室研究基金(桂科能1002K001)
文摘
采用VSMP方法从大量的分子结构描述符中筛选最优子集,用多元线性回归方法分别构建了羟基多溴二苯醚(hydroxylated polybrominated diphenyl ethers,OH-PBDEs)对细胞色素CYP19介导类固醇生成的抑制活性,甲状腺受体-β(thyroid receptors,TR-β)的激素活性以及与甲状腺素结合球蛋白(thyrox-ine-binding globulin,TBG)和甲状腺转运蛋白(transthyretin,TTR)之间结合能力的定量构效关系(quantita-tive structure-activity relationship,QSAR)模型。模型的留一法交叉验证(leave-one-out cross validation,LOO-CV)相关系数Q2和拟合相关系数R2均高于0.95和0.97,表明模型具有良好的稳健性、拟合能力和预测能力。QSAR模型表明OH-PBDEs的分子三维结构和芳香性是其活性的重要影响因素。另外,分子中溴原子数量和取代位置对OH-PBDE生物活性具有重要影响。
关键词
羟基多溴二苯醚(OH-PBDEs)
细胞色素CYP19
甲状腺受体-β(TR-β)
甲状腺素结合球蛋白(TBG)
甲状腺转运蛋白(TTR)
Keywords
hydroxylated polybrominated diphenyl ethers(OH-PBDEs)
cytochrome CYP19
thyroid receptor-β(TR-β)
thyroxine-binding globulin(TBG)
transthyretin(TTR)
分类号
X132 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
基于密度泛函理论的细胞色素P450 1A2抑制剂的定量构效关系
2
作者
易忠胜
叶廷文
刘红艳
莫凌云
机构
桂林理工大学化学与生物工程学院
出处
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2013年第1期99-106,共8页
基金
国家自然科学基金项目(21167006)
广西科学基金项目(2011GXNSFA018061
+1 种基金
2011GXNSFA018059)
环境化学与生态毒理学国家重点实验室开放基金项目(KF2011-21)
文摘
在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(Vm)与萘、内酯衍生物及其他化合物对细胞色素氧化酶P450 1A2抑制剂的两变量线性QSAR模型,结果表明:所选的2个分子结构描述符与50个抑制剂的活性之间具有很强的线性关系(相关系数r2=0.907 0)和内部预测能力(留多法交叉验证相关系数q2=0.751 7)。同时,将50个化合物分成奇数集和偶数集各自进行筛选建模,并彼此进行外部预测,对全部样本集、奇数集和偶数集样本模型进行了y-Randomization检验,结果表明描述符EHOMO和Vm建立的模型均非常稳定并具有很高的预测能力。
关键词
细胞色素P450
1A2
抑制剂
定量结构-活性相关
密度泛函理论(DFT)
VSMP
Keywords
cytochrome P450 1A2
inhibitor
quantitative structure-activity relationship(QSAR)
density functional theory(DFT)
variable selection and modeling based on prediction(VSMP)
分类号
R91 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
羟基多溴二苯醚生物活性的QSAR研究
易忠胜
李连臣
叶廷文
刘红艳
莫凌云
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2011
3
下载PDF
职称材料
2
基于密度泛函理论的细胞色素P450 1A2抑制剂的定量构效关系
易忠胜
叶廷文
刘红艳
莫凌云
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2013
0
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职称材料
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