万寿菊属物种叶绿体基因组特征及系统发育分析

万寿菊属(Tagetes)为菊科一年生草本植物,具有重要的药用和经济价值,对其开展叶绿体基因组研究,可为该属物种的种质资源鉴定及种间遗传分析提供参考.从NCBI数据库下载万寿菊属物种的7条叶绿体基因组序列,借助生物信息学软件对叶绿体基因组的特征、密码子使用性及系统发育进行分析.结果表明,万寿菊属物种叶绿体基因组具有典型的四分体结构,叶绿体基因组介于151893~153689 bp,编码130个基因.叶绿体基因组以正向重复和回文重复为主,SSR位点数平均61个,多为A/T碱基重复.叶绿体基因组结构保守,高频密码子有29个,以A或T结尾的分别有12个和16个,偏好使用A/T结尾的密码子.系统发育分析表明,万寿菊属物种构成单系群,万寿菊与印加孔雀草亲缘关系较近,芳香万寿菊位于分支基部,属于较古老的物种.