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散纹盛蛱蝶(鳞翅目:蛱蝶科)成虫肠道细菌群落结构与多样性分析
1
作者
石庆会
陈华莲
+2 位作者
郑雅婷
叶艺榕
孙刚
《三明学院学报》
2023年第3期17-25,共9页
利用PacBio三代测序平台测定散纹盛蛱蝶成虫肠道细菌的16S rRNA基因全序列,应用SMRTLINK(v9)和USEARCH(v10)软件获得一致性CCS序列和操作分类单元数量,初步分析其肠道细菌群落结构和Alpha多样性。结果表明,散纹盛蛱蝶的3个样本共获得48...
利用PacBio三代测序平台测定散纹盛蛱蝶成虫肠道细菌的16S rRNA基因全序列,应用SMRTLINK(v9)和USEARCH(v10)软件获得一致性CCS序列和操作分类单元数量,初步分析其肠道细菌群落结构和Alpha多样性。结果表明,散纹盛蛱蝶的3个样本共获得48458条CCS序列,总长度69573368 bp,经优化后获得35586条有效reads,在98.65%的相似度下被聚类为2547个OTUs,共注释到9个门,15个纲,25个目,48个科,71个属,217个种。在门分类阶元上,以变形菌门为优势门,平均相对丰度为55.89%;在属分类阶元上,以沉积物杆状菌属为优势属,平均相对丰度为21.24%。Alpha多样性分析结果显示,散纹盛蛱蝶成虫肠道细菌Chao指数、Ace指数、Shannon指数和Simpson指数分别为1737.1410~2095.6292、1943.0551~2321.3013、6.7782~7.3076和0.0246~0.0540,表明散纹盛蛱蝶成虫肠道细菌群落有较高的丰富度和多样性,为进一步研究昆虫肠道细菌的功能及其在生物防治中的应用提供理论参考依据。
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关键词
散纹盛蛱蝶
肠道细菌
多样性
16S
rRNA
PacBio三代测序平台
下载PDF
职称材料
题名
散纹盛蛱蝶(鳞翅目:蛱蝶科)成虫肠道细菌群落结构与多样性分析
1
作者
石庆会
陈华莲
郑雅婷
叶艺榕
孙刚
机构
福建省资源环境监测与可持续经营利用重点实验室
三明学院资源与化工学院
出处
《三明学院学报》
2023年第3期17-25,共9页
基金
福建省自然科学基金项目(面上(2021J0111212021J011113,2020J01373))
三明学院引进高层次人才科研启动经费项目(18YG01,18YG02)。
文摘
利用PacBio三代测序平台测定散纹盛蛱蝶成虫肠道细菌的16S rRNA基因全序列,应用SMRTLINK(v9)和USEARCH(v10)软件获得一致性CCS序列和操作分类单元数量,初步分析其肠道细菌群落结构和Alpha多样性。结果表明,散纹盛蛱蝶的3个样本共获得48458条CCS序列,总长度69573368 bp,经优化后获得35586条有效reads,在98.65%的相似度下被聚类为2547个OTUs,共注释到9个门,15个纲,25个目,48个科,71个属,217个种。在门分类阶元上,以变形菌门为优势门,平均相对丰度为55.89%;在属分类阶元上,以沉积物杆状菌属为优势属,平均相对丰度为21.24%。Alpha多样性分析结果显示,散纹盛蛱蝶成虫肠道细菌Chao指数、Ace指数、Shannon指数和Simpson指数分别为1737.1410~2095.6292、1943.0551~2321.3013、6.7782~7.3076和0.0246~0.0540,表明散纹盛蛱蝶成虫肠道细菌群落有较高的丰富度和多样性,为进一步研究昆虫肠道细菌的功能及其在生物防治中的应用提供理论参考依据。
关键词
散纹盛蛱蝶
肠道细菌
多样性
16S
rRNA
PacBio三代测序平台
Keywords
Symbrenthia lilaea
intestinal bacteria
diversity
16S rRNA
PacBio RSⅢ
分类号
S433.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
散纹盛蛱蝶(鳞翅目:蛱蝶科)成虫肠道细菌群落结构与多样性分析
石庆会
陈华莲
郑雅婷
叶艺榕
孙刚
《三明学院学报》
2023
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