目的以宏基因组学为技术手段,了解温州口岸在进口南非盐湿牛皮上检疫发现的无色扇头蜱体内微生物群落结构特征,及抗生素抗性基因(ARGs)、毒力因子携带情况。方法将截获的蜱随机分成5份,经HiPure Bacterial DNA Kits提取DNA后,采用高通...目的以宏基因组学为技术手段,了解温州口岸在进口南非盐湿牛皮上检疫发现的无色扇头蜱体内微生物群落结构特征,及抗生素抗性基因(ARGs)、毒力因子携带情况。方法将截获的蜱随机分成5份,经HiPure Bacterial DNA Kits提取DNA后,采用高通量测序的方法,分析其微生物群落结构、致病菌、抗生素抗性基因及毒力因子。结果5份样本微生物组成相似。在门水平上,均以厚壁菌门、变形菌门为主要菌门。其中厚壁菌门丰度最高,占全部门的66.00%以上。在属水平上,均以链球菌属(>55.30%)、芽孢杆菌属(>11.20%)为优势菌属。在全部蜱样本中均检测到变形链球菌、蜡样芽孢杆菌、肠沙门菌、肺炎链球菌等常见条件致病菌,占注释总水平的71.00%以上。抗性基因分析发现蜱样本含有Acr,bacA,mdtK,arnA,mdtH等16种抗性基因,其中Acr丰度最高(30.19%),其次是bacA(20.75%)。这些抗性基因分别介导对大环内酯类、氨基糖苷类、β-内酰胺酶、甘氨酰环素、吖啶黄素等多种抗菌药物的耐药。细菌毒力因子数据库(VFDB)注释分析发现蜱样本共有3923个毒力基因,主要与黏附(22.66%)、分泌系统(13.97%)、侵袭(13.56%)等毒力因子相关。结论无色扇头蜱体内病原体种类较多,检出肠沙门菌等危害较大的致病菌,同时携带大量抗生素抗性基因及毒力因子,因此相关部门及一线从业人员应注意防控跨境蜱传疾病传入,防止对我国公共卫生造成影响。展开更多
文摘目的以宏基因组学为技术手段,了解温州口岸在进口南非盐湿牛皮上检疫发现的无色扇头蜱体内微生物群落结构特征,及抗生素抗性基因(ARGs)、毒力因子携带情况。方法将截获的蜱随机分成5份,经HiPure Bacterial DNA Kits提取DNA后,采用高通量测序的方法,分析其微生物群落结构、致病菌、抗生素抗性基因及毒力因子。结果5份样本微生物组成相似。在门水平上,均以厚壁菌门、变形菌门为主要菌门。其中厚壁菌门丰度最高,占全部门的66.00%以上。在属水平上,均以链球菌属(>55.30%)、芽孢杆菌属(>11.20%)为优势菌属。在全部蜱样本中均检测到变形链球菌、蜡样芽孢杆菌、肠沙门菌、肺炎链球菌等常见条件致病菌,占注释总水平的71.00%以上。抗性基因分析发现蜱样本含有Acr,bacA,mdtK,arnA,mdtH等16种抗性基因,其中Acr丰度最高(30.19%),其次是bacA(20.75%)。这些抗性基因分别介导对大环内酯类、氨基糖苷类、β-内酰胺酶、甘氨酰环素、吖啶黄素等多种抗菌药物的耐药。细菌毒力因子数据库(VFDB)注释分析发现蜱样本共有3923个毒力基因,主要与黏附(22.66%)、分泌系统(13.97%)、侵袭(13.56%)等毒力因子相关。结论无色扇头蜱体内病原体种类较多,检出肠沙门菌等危害较大的致病菌,同时携带大量抗生素抗性基因及毒力因子,因此相关部门及一线从业人员应注意防控跨境蜱传疾病传入,防止对我国公共卫生造成影响。