对人类谷氨酰胺酰基环化酶与老年痴呆症的关系进行的技术路线的拟设计

目的:介绍谷氨酰胺酰基环化酶的发现、结构、分布、功能以及与阿尔茨海默病的关系,为防治阿尔茨海默病提供新的药物作用靶点。通过抑制人类谷氨酰胺酰基环化酶(hQC)来治疗老年性痴呆(Alzheimer's Disease)已成为一个新的有效方法并且被日益关注。其中Aβ3,11(pE)40,42有较高的神经毒性,而且还可以作为种子结构导致Aβ多聚体及纤维化的形成。通过抑制hQC的活性来阻止Aβ3,11(pE)40,42的形成可以有效预防和治疗AD。方法:根据近年的相关文献综述。采用基于结构的药物设计方法设计出hQC的小分子非多肽抑制剂。先构建QC的合适三维构型,借助于eHiTS等对接软件对CNPD,Maybridge,Specs小分子数据库进行虚拟筛选,得到母核较为新颖的QC小分子非多肽抑制剂,合成或购买这些化合物,对化合物进行体外酶学活性测试,然后对有潜在活性的化合物再进行优化,最终得到一系列全新有效的化合物。结果与结论:谷氨酰胺酰基环化酶与阿尔茨海默病的发生发展密切相关,有望成为治疗阿尔茨海默病的新靶点。因近年来计算机辅助药物设计兴起,通过对QC的分析,利用计算机技术,模拟科研路线,拟定有效药物的研究路线和设计路线。

微生物基因组尺度代谢网络模型构建方法的比较分析

随着后基因时代的到来,微生物的定向菌种改造在生产中发挥着越来越重要的作用.基因组尺度代谢网络模型是微生物定向改造中一种不可缺少的指导性工具,可降低菌种改造的盲目性,增加目的性和成功率.随着研究的深入,基因组尺度代谢网络模型的构建方法也越来越多.究竟选择什么样的方法才能构建出全面准确的基因组尺度代谢网络模型,对于初学者来说是一个大难题.论文结合本课题组的研究,将近年文献报导中出现过的模型构建方法进行了分类和分析,并评述了各种方法的优、缺点,以期为初学者提供参考.具体介绍的方法有:基于基因组注释构建代谢网络模型,基于蛋白组构建代谢网络模型,基于文献挖掘构建代谢网络模型,通过软件和网络平台构建代谢网络模型,基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)构建代谢网络模型.五种构建代谢网络模型方法都有其优点,但也有不可避免的缺点,要构建较为准确全面的基因组尺度代谢网络模型,需要将各种方法结合,弥补彼此的不足.