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基因预测多囊卵巢综合征和肺癌之间的关系:一项两样本孟德尔随机化研究
1
作者
唐泽南
杨伊然
+3 位作者
张丹梅
吉玲存
朱晨
刘凌燕
《生殖医学杂志》
CAS
2023年第9期1407-1413,共7页
目的使用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法来探究在遗传水平上多囊卵巢综合征(PCOS)与肺癌之间的关联性。方法从IEU GWAS数据库中提取与PCOS相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP),利用GWAS总结结果...
目的使用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法来探究在遗传水平上多囊卵巢综合征(PCOS)与肺癌之间的关联性。方法从IEU GWAS数据库中提取与PCOS相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP),利用GWAS总结结果并进行质控,选择符合条件的SNP。从英国生物库(UK Biobank)获取肺癌(包括小细胞肺癌、鳞状细胞肺癌和肺腺癌)的GWAS数据集。为了防止种群分层偏倚,选取只包括欧洲血统个体的SNP和相应的总结统计数据,用于暴露和结局。采用两样本MR方法评估在遗传水平上PCOS与肺癌之间的关联性;考虑MR结果中的异质性和多效性可能引起的偏倚,使用Cochran’s Q统计量和MR Egger进行评估。结果在欧洲人群中,在遗传水平上PCOS与肺腺癌的患病风险之间存在关联性[IVW:OR=1.232,95%CI(1.049,1.447),P=0.011];在PCOS与鳞状细胞癌[IVW:OR=0.963,95%CI(0.695,1.334),P=0.821]以及小细胞肺癌[IVW:OR=0.858,95%CI(0.622,1.183),P=0.352]之间未观察到显著的关联。多效性分析结果显示,在肺腺癌的GWAS数据集中,我们选择作为工作变量(instrumental variable,IV)的5个与PCOS具有显著相关的SNP没有显著的水平多效性变异(P>0.05),提示研究结果具有稳健性。5个SNP的Cochran’s Q检验中也没有观察到显著的异质性(P>0.05)。结论我们的分析结果显示,在欧洲人群中基因水平上PCOS与肺腺癌的风险升高之间存在相关性。
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关键词
多囊卵巢综合征
肺癌
孟德尔随机化研究
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职称材料
题名
基因预测多囊卵巢综合征和肺癌之间的关系:一项两样本孟德尔随机化研究
1
作者
唐泽南
杨伊然
张丹梅
吉玲存
朱晨
刘凌燕
机构
首都医科大学药学院
首都医科大学附属复兴医院
中国农业大学经济管理学院
出处
《生殖医学杂志》
CAS
2023年第9期1407-1413,共7页
基金
国家自然科学基金(81901554)。
文摘
目的使用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法来探究在遗传水平上多囊卵巢综合征(PCOS)与肺癌之间的关联性。方法从IEU GWAS数据库中提取与PCOS相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP),利用GWAS总结结果并进行质控,选择符合条件的SNP。从英国生物库(UK Biobank)获取肺癌(包括小细胞肺癌、鳞状细胞肺癌和肺腺癌)的GWAS数据集。为了防止种群分层偏倚,选取只包括欧洲血统个体的SNP和相应的总结统计数据,用于暴露和结局。采用两样本MR方法评估在遗传水平上PCOS与肺癌之间的关联性;考虑MR结果中的异质性和多效性可能引起的偏倚,使用Cochran’s Q统计量和MR Egger进行评估。结果在欧洲人群中,在遗传水平上PCOS与肺腺癌的患病风险之间存在关联性[IVW:OR=1.232,95%CI(1.049,1.447),P=0.011];在PCOS与鳞状细胞癌[IVW:OR=0.963,95%CI(0.695,1.334),P=0.821]以及小细胞肺癌[IVW:OR=0.858,95%CI(0.622,1.183),P=0.352]之间未观察到显著的关联。多效性分析结果显示,在肺腺癌的GWAS数据集中,我们选择作为工作变量(instrumental variable,IV)的5个与PCOS具有显著相关的SNP没有显著的水平多效性变异(P>0.05),提示研究结果具有稳健性。5个SNP的Cochran’s Q检验中也没有观察到显著的异质性(P>0.05)。结论我们的分析结果显示,在欧洲人群中基因水平上PCOS与肺腺癌的风险升高之间存在相关性。
关键词
多囊卵巢综合征
肺癌
孟德尔随机化研究
Keywords
Polycystic ovary syndrome
Lung cancer
Mendelian randomization study
分类号
R711.75 [医药卫生—妇产科学]
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
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1
基因预测多囊卵巢综合征和肺癌之间的关系:一项两样本孟德尔随机化研究
唐泽南
杨伊然
张丹梅
吉玲存
朱晨
刘凌燕
《生殖医学杂志》
CAS
2023
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