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k-gram方法识别microRNA前体
被引量:
4
1
作者
杨良怀
吕丕明
+1 位作者
陈立军
邓明华
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期154-161,共8页
MicroRNAs(miRNAs)是动植物中较短的参与调控基因表达的功能性非编码RNA序列.第一个miRNA是通过实验手段发现的,然而通过实验手段识别miRNA在技术上仍然具有很大的挑战性和不完整性.因此,miRNA基因识别需要寻求计算方法来弥补实验方法...
MicroRNAs(miRNAs)是动植物中较短的参与调控基因表达的功能性非编码RNA序列.第一个miRNA是通过实验手段发现的,然而通过实验手段识别miRNA在技术上仍然具有很大的挑战性和不完整性.因此,miRNA基因识别需要寻求计算方法来弥补实验方法的不足.提出了一个全新的miRNA前体的识别方法.在构造识别模型中,把初级序列和序列二级结构相结合,采用k-gram方法把序列信息映射到高维特征空间中,然后通过特征选取方法提取特征,并用这些特征为miRNA前体的识别构造了基于SVM的识别模型.同时,采用隐马尔可夫模型(HMM)的学习方法进行了比较.实验结果表明,该方法是有效的,可以达到较高的敏感性和特异性.
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关键词
MICRORNA
基因识别
支持向量机
隐马尔可夫模型
microRNA前体
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职称材料
德高情重铸医魂——记人民的好医生乔淑萍
2
作者
吕丕明
《新长征》
2007年第2期12-16,共5页
自去年9月吉林省委、省政府决定,授予乔淑萍同志"人民的好医生"称号,并在全省广泛开展向乔淑萍同志学习的活动以来,乔淑萍同志先进事迹赢得了全社会的广泛尊重和认同。2006年12月25日,中宣部、人事部、卫生部和吉林省委联合...
自去年9月吉林省委、省政府决定,授予乔淑萍同志"人民的好医生"称号,并在全省广泛开展向乔淑萍同志学习的活动以来,乔淑萍同志先进事迹赢得了全社会的广泛尊重和认同。2006年12月25日,中宣部、人事部、卫生部和吉林省委联合在京召开乔淑萍同志的先进事迹报告会。在报告会上,乔淑萍被授予"白求恩奖章"荣誉称号,享受省部级劳动模范和先进工作者待遇。人事部副部长尹蔚民宣读了表彰决定,卫生部部长高强为乔淑萍颁发了证书。为了进一步宣传乔淑萍同志新时期共产党员的良好形象和白衣战士的崇高风范,本刊特约记者吕丕明同志对乔淑萍同志的先进事迹做了进一步深入的采访,目的是把学习乔淑萍同志先进事迹的活动进一步引向深入。
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关键词
先进事迹报告会
医生
人民
荣誉称号
先进工作者
政府决定
劳动模范
良好形象
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职称材料
题名
k-gram方法识别microRNA前体
被引量:
4
1
作者
杨良怀
吕丕明
陈立军
邓明华
机构
浙江工业大学信息工程学院
中国科学院研究生院
北京大学信息科学与技术学院
北京大学数学科学学院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期154-161,共8页
基金
国家自然科学基金(30570425)
国家重点基础研究发展计划(2003CB715903)资助项目~~
文摘
MicroRNAs(miRNAs)是动植物中较短的参与调控基因表达的功能性非编码RNA序列.第一个miRNA是通过实验手段发现的,然而通过实验手段识别miRNA在技术上仍然具有很大的挑战性和不完整性.因此,miRNA基因识别需要寻求计算方法来弥补实验方法的不足.提出了一个全新的miRNA前体的识别方法.在构造识别模型中,把初级序列和序列二级结构相结合,采用k-gram方法把序列信息映射到高维特征空间中,然后通过特征选取方法提取特征,并用这些特征为miRNA前体的识别构造了基于SVM的识别模型.同时,采用隐马尔可夫模型(HMM)的学习方法进行了比较.实验结果表明,该方法是有效的,可以达到较高的敏感性和特异性.
关键词
MICRORNA
基因识别
支持向量机
隐马尔可夫模型
microRNA前体
Keywords
microRNA, gene identification, support vector machine, hidden Markov model, microRNA precursor
分类号
Q612 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
德高情重铸医魂——记人民的好医生乔淑萍
2
作者
吕丕明
出处
《新长征》
2007年第2期12-16,共5页
文摘
自去年9月吉林省委、省政府决定,授予乔淑萍同志"人民的好医生"称号,并在全省广泛开展向乔淑萍同志学习的活动以来,乔淑萍同志先进事迹赢得了全社会的广泛尊重和认同。2006年12月25日,中宣部、人事部、卫生部和吉林省委联合在京召开乔淑萍同志的先进事迹报告会。在报告会上,乔淑萍被授予"白求恩奖章"荣誉称号,享受省部级劳动模范和先进工作者待遇。人事部副部长尹蔚民宣读了表彰决定,卫生部部长高强为乔淑萍颁发了证书。为了进一步宣传乔淑萍同志新时期共产党员的良好形象和白衣战士的崇高风范,本刊特约记者吕丕明同志对乔淑萍同志的先进事迹做了进一步深入的采访,目的是把学习乔淑萍同志先进事迹的活动进一步引向深入。
关键词
先进事迹报告会
医生
人民
荣誉称号
先进工作者
政府决定
劳动模范
良好形象
分类号
D631 [政治法律—中外政治制度]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
k-gram方法识别microRNA前体
杨良怀
吕丕明
陈立军
邓明华
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2007
4
下载PDF
职称材料
2
德高情重铸医魂——记人民的好医生乔淑萍
吕丕明
《新长征》
2007
0
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职称材料
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