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利用python/RGB色彩数据分析平台快速测定还原糖浓度
被引量:
4
1
作者
陈慧
郝锦亨
+8 位作者
袁志涛
罗佳伟
陈胤熹
郑少鹏
黎佩瑜
吕咏锶
梁世濠
赖林浩
曹诗林
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2021年第7期315-320,共6页
本文探讨了运用python处理食品生物化学实验中还原糖浓度测定的新方法。分别将稀释成不同浓度的还原糖检测样品放在96孔酶标板上,利用扫描仪对其扫描,得到tiff格式的颜色位图,以利用本课题组自行开发的在线分析平台上的RGB分析模块读取...
本文探讨了运用python处理食品生物化学实验中还原糖浓度测定的新方法。分别将稀释成不同浓度的还原糖检测样品放在96孔酶标板上,利用扫描仪对其扫描,得到tiff格式的颜色位图,以利用本课题组自行开发的在线分析平台上的RGB分析模块读取样品溶液的RGB颜色数据。通过考察样品取样量、最适图片分辨率等条件,建立一种基于RGB色彩体系的食品中还原糖快速检测方法。检测葡萄糖的结果,在葡萄糖浓度相同,样品取样量为100μL,图片分辨率为1200 dpi的条件下,拟合系数大于0.98;RGB颜色数据与葡萄糖浓度之间的关系准确度更高,该结果与分光光度法结果相近,但本方法更方便、快速、可多通道处理。与此同时,通过测定实际样品中还原糖的含量,并与分光光度法测定结果比对,验证了利用python/RGB色彩数据分析平台快速测定食品中还原糖浓度的可靠性和可行性。
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关键词
RGB
还原糖
扫描仪
成像
脚本
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职称材料
分子动力学模拟研究壳寡糖与脂肪酶相互作用机制
被引量:
2
2
作者
杨宝燕
郑敦锦
+10 位作者
何康平
江文豪
沈锐锋
吕咏锶
罗幸林
罗佳伟
陈胤熹
郑少鹏
郝锦亨
陈梓诗
曹诗林
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2021年第6期72-81,共10页
壳聚糖及其衍生物在酶固定化领域有着广泛的应用。了解酶与壳聚糖衍生物在分子水平上的相互作用机制,对相关生物催化剂的设计和应用具有重要意义。本研究采用分子动力学模拟方法研究南极假丝酵母脂肪酶B(CaLB)与壳寡糖(OCTS)的相互作用...
壳聚糖及其衍生物在酶固定化领域有着广泛的应用。了解酶与壳聚糖衍生物在分子水平上的相互作用机制,对相关生物催化剂的设计和应用具有重要意义。本研究采用分子动力学模拟方法研究南极假丝酵母脂肪酶B(CaLB)与壳寡糖(OCTS)的相互作用,并对脂肪酶与催化底物进行分子对接研究脂肪酶催化活性中心和底物结合构象和结合亲和力。结果表明,脂肪酶与OCTS之间的静电和L-J相互作用在自组装过程的初始阶段起着重要的作用。模拟过程结束后,CaLB-OCTS组装体共包含14个OCTS分子和1个CaLB分子。CaLB与OCTS之间存在静电相互作用和氢键相互作用,在模拟过程中,L-J势能和库仑势能分别降低了约1480 kJ/mol和2324.0 kJ/mol,两者间的平均氢键数从0增加到约17,CaLB与OCTS的可及面积均因为相互作用而降低了20 nm2。二级结构表明,与游离酶对照相比,CaLB-OCTS的β折叠含量从9.78%增加至12.62%,无规卷曲loop从49.21%下降至46.50%,CaLB-OCTS的β折叠的含量更高,而无规卷曲含量更低。此外,CaLB-OCTS保留了其原有的蛋白骨架结构以及活性位点口袋的构象。
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关键词
南极假丝酵母脂肪酶
壳寡糖
分子动力学模拟
分子对接
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职称材料
题名
利用python/RGB色彩数据分析平台快速测定还原糖浓度
被引量:
4
1
作者
陈慧
郝锦亨
袁志涛
罗佳伟
陈胤熹
郑少鹏
黎佩瑜
吕咏锶
梁世濠
赖林浩
曹诗林
机构
佛山科学技术学院食品科学与工程学院
可持续生物化学与合成生物工程中心
华南理工大学食品科学与工程学院
出处
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2021年第7期315-320,共6页
基金
广东省基础与应用基础研究基金佛山市联合基金(粤佛联合基金)青年基金项目(2019A1515110621)
广东普通高校青年创新人才项目(自然科学类
+4 种基金
2017KQNCX217)
佛山科学技术学院高层次人才启动项目(GG07016)
大学生创新创业训练计划项目(201911847023,S201911847097,S201911847091,XJ2019213,S202011847068,S202011847086,XJ2020219,XJ2020220)
广东省科技创新战略专项资金项目(pdjh2020b0627)
广州无远生物科技有限公司-企业科研基金(012319705010)。
文摘
本文探讨了运用python处理食品生物化学实验中还原糖浓度测定的新方法。分别将稀释成不同浓度的还原糖检测样品放在96孔酶标板上,利用扫描仪对其扫描,得到tiff格式的颜色位图,以利用本课题组自行开发的在线分析平台上的RGB分析模块读取样品溶液的RGB颜色数据。通过考察样品取样量、最适图片分辨率等条件,建立一种基于RGB色彩体系的食品中还原糖快速检测方法。检测葡萄糖的结果,在葡萄糖浓度相同,样品取样量为100μL,图片分辨率为1200 dpi的条件下,拟合系数大于0.98;RGB颜色数据与葡萄糖浓度之间的关系准确度更高,该结果与分光光度法结果相近,但本方法更方便、快速、可多通道处理。与此同时,通过测定实际样品中还原糖的含量,并与分光光度法测定结果比对,验证了利用python/RGB色彩数据分析平台快速测定食品中还原糖浓度的可靠性和可行性。
关键词
RGB
还原糖
扫描仪
成像
脚本
Keywords
RGB
reducing sugar
scanner
imaging
script
分类号
TS207.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
分子动力学模拟研究壳寡糖与脂肪酶相互作用机制
被引量:
2
2
作者
杨宝燕
郑敦锦
何康平
江文豪
沈锐锋
吕咏锶
罗幸林
罗佳伟
陈胤熹
郑少鹏
郝锦亨
陈梓诗
曹诗林
机构
佛山科学技术学院食品科学与工程学院
暨南大学理工学院
华南理工大学食品科学与工程学院
可持续生物化学与合成生物工程中心
出处
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2021年第6期72-81,共10页
基金
广东省基础与应用基础研究基金佛山市联合基金(粤佛联合基金)青年基金项目(2019A1515110621)
广东普通高校青年创新人才项目(自然科学类)(2017KQNCX217)
+2 种基金
佛山科学技术学院高层次人才启动项目(GG07016)
大学生创新创业训练计划项目(201911847023,S201911847097,S201911847091,XJ2019213,S202011847068,S202011847086,XJ2020219,XJ2020220)
广东省科技创新战略专项资金(大学生科技创新培育)项目(pdjh2020b0627)。
文摘
壳聚糖及其衍生物在酶固定化领域有着广泛的应用。了解酶与壳聚糖衍生物在分子水平上的相互作用机制,对相关生物催化剂的设计和应用具有重要意义。本研究采用分子动力学模拟方法研究南极假丝酵母脂肪酶B(CaLB)与壳寡糖(OCTS)的相互作用,并对脂肪酶与催化底物进行分子对接研究脂肪酶催化活性中心和底物结合构象和结合亲和力。结果表明,脂肪酶与OCTS之间的静电和L-J相互作用在自组装过程的初始阶段起着重要的作用。模拟过程结束后,CaLB-OCTS组装体共包含14个OCTS分子和1个CaLB分子。CaLB与OCTS之间存在静电相互作用和氢键相互作用,在模拟过程中,L-J势能和库仑势能分别降低了约1480 kJ/mol和2324.0 kJ/mol,两者间的平均氢键数从0增加到约17,CaLB与OCTS的可及面积均因为相互作用而降低了20 nm2。二级结构表明,与游离酶对照相比,CaLB-OCTS的β折叠含量从9.78%增加至12.62%,无规卷曲loop从49.21%下降至46.50%,CaLB-OCTS的β折叠的含量更高,而无规卷曲含量更低。此外,CaLB-OCTS保留了其原有的蛋白骨架结构以及活性位点口袋的构象。
关键词
南极假丝酵母脂肪酶
壳寡糖
分子动力学模拟
分子对接
Keywords
Candida antarctica lipase
oligo-chitosan
molecular dynamics simulation
molecular docking
分类号
Q814.2 [生物学—生物工程]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用python/RGB色彩数据分析平台快速测定还原糖浓度
陈慧
郝锦亨
袁志涛
罗佳伟
陈胤熹
郑少鹏
黎佩瑜
吕咏锶
梁世濠
赖林浩
曹诗林
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2021
4
下载PDF
职称材料
2
分子动力学模拟研究壳寡糖与脂肪酶相互作用机制
杨宝燕
郑敦锦
何康平
江文豪
沈锐锋
吕咏锶
罗幸林
罗佳伟
陈胤熹
郑少鹏
郝锦亨
陈梓诗
曹诗林
《现代食品科技》
CAS
北大核心
2021
2
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职称材料
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