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双壳贝类CK1基因家族的鉴定及表达分析
1
作者
孙凤芝
吕珍立
+4 位作者
刘福云
邢强
连姗姗
王师
包
立
随
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1401-1412,共12页
酪蛋白激酶1 (CK1)是一种重要的蛋白激酶家族,其在DNA损伤应答和修复、细胞增殖和凋亡、胚胎发育和稳态等重要的生物学过程中都具有复杂多样的调控作用。为了理解CK1基因家族在双壳贝类中的特征、进化及生物学功能,实验采用比较基因组...
酪蛋白激酶1 (CK1)是一种重要的蛋白激酶家族,其在DNA损伤应答和修复、细胞增殖和凋亡、胚胎发育和稳态等重要的生物学过程中都具有复杂多样的调控作用。为了理解CK1基因家族在双壳贝类中的特征、进化及生物学功能,实验采用比较基因组学及生物信息学的方法对双壳贝类CK1基因家族进行了鉴定分析,通过虾夷扇贝高温应激实验,研究了CK1基因家族在高温应激时的表达规律。结果显示,在虾夷扇贝、栉孔扇贝、长牡蛎与侏儒蛤中均存在CK1α,CK1αlike,CK1δ,CK1γ3,并发现CK1ε,CK1γ1,CK1γ2在双壳贝类中发生了丢失。时空表达分析发现,双壳贝类CK1基因均在胚胎发育早期集中表达,并以多细胞/囊胚期为界呈现出母源/合子特异性表达模式。CK1为关键基因的基因共表达模块显著富集在错配修复、核苷酸剪切修复等相关通路上,暗示了CK1基因在双壳贝类胚胎发育过程中参与调控DNA损伤修复过程,从而维持早期胚胎发育时的基因组稳定性。双壳贝类CK1基因在成体中呈现组织特异的表达模式,主要在鳃和雄性性腺中具有相对较高的表达量。虾夷扇贝受到高温应激后,其鳃中PyCK1α, PyCK1αlike和PyCK1δ在前3 h显著上调,但在12 h后趋于下调,而PyCK1γ3在高温应激不同时间点均表现出下降趋势,表明双壳贝类CK1基因参与响应高温应激反应。此项研究有助于理解双壳贝类CK1基因的功能和进化,为解析双壳贝类胚胎发育稳态维持和应激调节机制提供理论基础。
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关键词
双壳贝类
CK1基因家族
基因鉴定
表达分析
高温应激
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职称材料
多聚半乳糖醛酸酶在黑曲霉中的超量表达及其酶学性质研究
2
作者
石杨
吕珍立
+4 位作者
刘思琪
徐冰怡
李学静
李杰
张会
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2020年第4期80-85,共6页
运用基因工程手段,构建高效表达多聚半乳糖醛酸酶的黑曲霉重组菌株,并对重组酶活性及酶学性质进行研究,以期更好的实现多聚半乳糖醛酸酶在食品加工、饲料生产及废水处理中的重要作用。从果胶酶生产菌黑曲霉GJ-1中扩增得到多聚半乳糖醛...
运用基因工程手段,构建高效表达多聚半乳糖醛酸酶的黑曲霉重组菌株,并对重组酶活性及酶学性质进行研究,以期更好的实现多聚半乳糖醛酸酶在食品加工、饲料生产及废水处理中的重要作用。从果胶酶生产菌黑曲霉GJ-1中扩增得到多聚半乳糖醛酸酶基因pgaB的成熟肽编码序列(1232 bp),集成glaA多拷贝强启动子和信号肽,构建其黑曲霉表达载体pSZHG6RS-pgaB,通过农杆菌介导法转化黑曲霉,获得多聚半乳糖醛酸酶黑曲霉重组菌株。聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测结果表明,目的蛋白大小约为38 kDa;在发酵第10 d时酶活最高达到4617.8 U·m L^-1。酶学性质研究表明,最适温度为50℃,高温时热稳定性较差;最适pH为5.0,碱性耐受能力较强;Ca^2+、Fe^3+、Fe^2+均对重组酶有一定激活作用;重组酶对不同底物的催化能力不同,甲酯化程度越高酶对其降解能力越弱,其中对无甲酯化的多聚半乳糖醛酸催化能力最强,DE值为33.04%。重组菌株产酶活性较高,具有明确的产业化前景。
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关键词
黑曲霉
多聚半乳糖醛酸酶
超量表达
酶学性质
重组菌株
基因工程
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职称材料
题名
双壳贝类CK1基因家族的鉴定及表达分析
1
作者
孙凤芝
吕珍立
刘福云
邢强
连姗姗
王师
包
立
随
机构
中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室
崂山实验室海洋生物学与生物技术功能实验室
中国海洋大学热带海洋生物种质资源开发与种业工程中心
中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1401-1412,共12页
基金
国家重点研发计划项目,2022YFD2400301号
山东省重点研发计划项目,2021ZLGX03号。
文摘
酪蛋白激酶1 (CK1)是一种重要的蛋白激酶家族,其在DNA损伤应答和修复、细胞增殖和凋亡、胚胎发育和稳态等重要的生物学过程中都具有复杂多样的调控作用。为了理解CK1基因家族在双壳贝类中的特征、进化及生物学功能,实验采用比较基因组学及生物信息学的方法对双壳贝类CK1基因家族进行了鉴定分析,通过虾夷扇贝高温应激实验,研究了CK1基因家族在高温应激时的表达规律。结果显示,在虾夷扇贝、栉孔扇贝、长牡蛎与侏儒蛤中均存在CK1α,CK1αlike,CK1δ,CK1γ3,并发现CK1ε,CK1γ1,CK1γ2在双壳贝类中发生了丢失。时空表达分析发现,双壳贝类CK1基因均在胚胎发育早期集中表达,并以多细胞/囊胚期为界呈现出母源/合子特异性表达模式。CK1为关键基因的基因共表达模块显著富集在错配修复、核苷酸剪切修复等相关通路上,暗示了CK1基因在双壳贝类胚胎发育过程中参与调控DNA损伤修复过程,从而维持早期胚胎发育时的基因组稳定性。双壳贝类CK1基因在成体中呈现组织特异的表达模式,主要在鳃和雄性性腺中具有相对较高的表达量。虾夷扇贝受到高温应激后,其鳃中PyCK1α, PyCK1αlike和PyCK1δ在前3 h显著上调,但在12 h后趋于下调,而PyCK1γ3在高温应激不同时间点均表现出下降趋势,表明双壳贝类CK1基因参与响应高温应激反应。此项研究有助于理解双壳贝类CK1基因的功能和进化,为解析双壳贝类胚胎发育稳态维持和应激调节机制提供理论基础。
关键词
双壳贝类
CK1基因家族
基因鉴定
表达分析
高温应激
Keywords
bivalve
CK1 gene family
gene identification
expression analysis
heat stress
分类号
Q38 [生物学—遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
多聚半乳糖醛酸酶在黑曲霉中的超量表达及其酶学性质研究
2
作者
石杨
吕珍立
刘思琪
徐冰怡
李学静
李杰
张会
机构
东北农业大学生命科学学院
出处
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2020年第4期80-85,共6页
基金
黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划(uNPYSCT-2018161)
哈尔滨市科技局应用技术与开发项目(2017RAYXJ009)
文摘
运用基因工程手段,构建高效表达多聚半乳糖醛酸酶的黑曲霉重组菌株,并对重组酶活性及酶学性质进行研究,以期更好的实现多聚半乳糖醛酸酶在食品加工、饲料生产及废水处理中的重要作用。从果胶酶生产菌黑曲霉GJ-1中扩增得到多聚半乳糖醛酸酶基因pgaB的成熟肽编码序列(1232 bp),集成glaA多拷贝强启动子和信号肽,构建其黑曲霉表达载体pSZHG6RS-pgaB,通过农杆菌介导法转化黑曲霉,获得多聚半乳糖醛酸酶黑曲霉重组菌株。聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测结果表明,目的蛋白大小约为38 kDa;在发酵第10 d时酶活最高达到4617.8 U·m L^-1。酶学性质研究表明,最适温度为50℃,高温时热稳定性较差;最适pH为5.0,碱性耐受能力较强;Ca^2+、Fe^3+、Fe^2+均对重组酶有一定激活作用;重组酶对不同底物的催化能力不同,甲酯化程度越高酶对其降解能力越弱,其中对无甲酯化的多聚半乳糖醛酸催化能力最强,DE值为33.04%。重组菌株产酶活性较高,具有明确的产业化前景。
关键词
黑曲霉
多聚半乳糖醛酸酶
超量表达
酶学性质
重组菌株
基因工程
Keywords
Aspergillus niger
polygalacturonase
over expression
enzymology properties
recombinant strains
genetic engineering
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
双壳贝类CK1基因家族的鉴定及表达分析
孙凤芝
吕珍立
刘福云
邢强
连姗姗
王师
包
立
随
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
多聚半乳糖醛酸酶在黑曲霉中的超量表达及其酶学性质研究
石杨
吕珍立
刘思琪
徐冰怡
李学静
李杰
张会
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2020
0
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职称材料
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