猴痘病毒(monkeypox virus,MPXV)是基因组全长约197000 bp的双链DNA病毒,属痘病毒科正痘病毒属,是正痘病毒中对人类致病的4种病毒之一,另外3种为天花病毒、痘苗病毒和牛痘病毒。自1977年全球消灭天花以来,猴痘作为一种类似天花的疾病和...猴痘病毒(monkeypox virus,MPXV)是基因组全长约197000 bp的双链DNA病毒,属痘病毒科正痘病毒属,是正痘病毒中对人类致病的4种病毒之一,另外3种为天花病毒、痘苗病毒和牛痘病毒。自1977年全球消灭天花以来,猴痘作为一种类似天花的疾病和可能的生物恐怖主义媒介一直受到广泛关注。2022年5月以来,一些非MPXV流行地区的国家先后发现大量猴痘病例,且出现人际间传播,引起高度关注。2022年7月23日,世界卫生组织(World Health Organization,WHO)宣布猴痘疫情构成“国际关注的突发公共卫生事件(Public Health Emergency of International Concern,PHEIC)”,这是WHO的最高级别预警。猴痘病例数量以及发生猴痘疫情的国家数量正在迅速上升,对全球健康提出了新的挑战。为应对猴痘疫情的扩散,加快对MPXV的研究,研发出安全有效的猴痘疫苗迫在眉睫。本文对MPXV及其疫苗的研究现状作一综述。展开更多
目的描述一株新鉴定的流行重组型HIV-1 CRF103_01B在北京的检出情况,并分析其近全长基因组(near full-length genome,NFLG)遗传特征。方法对2017—2020年北京新诊断或初始抗病毒治疗病例进行HIV-1基因型耐药监测,发现5例疑似感染CRF103_...目的描述一株新鉴定的流行重组型HIV-1 CRF103_01B在北京的检出情况,并分析其近全长基因组(near full-length genome,NFLG)遗传特征。方法对2017—2020年北京新诊断或初始抗病毒治疗病例进行HIV-1基因型耐药监测,发现5例疑似感染CRF103_01B毒株。通过逆转录、近末端稀释法,分两段巢式PCR扩增HIV-1 NFLG。获得的序列与分型参考序列进行基因比对,使用MEGA11软件构建邻接法(neighbor-joining,NJ)系统进化树。用SimPlot 3.5软件分析确定基因重组断点,绘制基因组结构图。基于亲本毒株同源NFLG序列比对,挑选较长的重组片段构建NJ进化树,判断可能的亲本毒株来源。用斯坦福大学HIV耐药数据库解析基因型耐药特征。结果共获得5条CRF103_01B NFLG序列,其中4例经男男性行为(men who have sex with men,MSM)感染,1例为女性。与从河北检出的4条CRF103_01B NFLG序列合并分析其重组特征:在CRF01_AE骨架上,gag、pol和nef-3'-LTR基因片段被B亚型重组替换[HXB2 nt 1111±19-1539±16,2531-4478±16(片段Ⅴ),9008±23-9615]。亲本来源分析显示,CRF103_01B的片段Ⅳ与Ⅴ分别与北京B亚型(BJMP3294B)和g5簇CRF01_AE序列(JX112804)聚集成大单系进化簇(bootstrap值分别为97%和100%)。9个CRF103_01B病例均携带非核苷类逆转录酶抑制剂类V106I突变。结论CRF103_01B毒株最可能起源于北京MSM人群,并在北京和河北等地的MSM人群中低水平持续流行,并经异性性途径向一般人群播散。需加强该毒株分子流行病学和耐药监测,关注疾病进展。展开更多
文摘猴痘病毒(monkeypox virus,MPXV)是基因组全长约197000 bp的双链DNA病毒,属痘病毒科正痘病毒属,是正痘病毒中对人类致病的4种病毒之一,另外3种为天花病毒、痘苗病毒和牛痘病毒。自1977年全球消灭天花以来,猴痘作为一种类似天花的疾病和可能的生物恐怖主义媒介一直受到广泛关注。2022年5月以来,一些非MPXV流行地区的国家先后发现大量猴痘病例,且出现人际间传播,引起高度关注。2022年7月23日,世界卫生组织(World Health Organization,WHO)宣布猴痘疫情构成“国际关注的突发公共卫生事件(Public Health Emergency of International Concern,PHEIC)”,这是WHO的最高级别预警。猴痘病例数量以及发生猴痘疫情的国家数量正在迅速上升,对全球健康提出了新的挑战。为应对猴痘疫情的扩散,加快对MPXV的研究,研发出安全有效的猴痘疫苗迫在眉睫。本文对MPXV及其疫苗的研究现状作一综述。
文摘目的描述一株新鉴定的流行重组型HIV-1 CRF103_01B在北京的检出情况,并分析其近全长基因组(near full-length genome,NFLG)遗传特征。方法对2017—2020年北京新诊断或初始抗病毒治疗病例进行HIV-1基因型耐药监测,发现5例疑似感染CRF103_01B毒株。通过逆转录、近末端稀释法,分两段巢式PCR扩增HIV-1 NFLG。获得的序列与分型参考序列进行基因比对,使用MEGA11软件构建邻接法(neighbor-joining,NJ)系统进化树。用SimPlot 3.5软件分析确定基因重组断点,绘制基因组结构图。基于亲本毒株同源NFLG序列比对,挑选较长的重组片段构建NJ进化树,判断可能的亲本毒株来源。用斯坦福大学HIV耐药数据库解析基因型耐药特征。结果共获得5条CRF103_01B NFLG序列,其中4例经男男性行为(men who have sex with men,MSM)感染,1例为女性。与从河北检出的4条CRF103_01B NFLG序列合并分析其重组特征:在CRF01_AE骨架上,gag、pol和nef-3'-LTR基因片段被B亚型重组替换[HXB2 nt 1111±19-1539±16,2531-4478±16(片段Ⅴ),9008±23-9615]。亲本来源分析显示,CRF103_01B的片段Ⅳ与Ⅴ分别与北京B亚型(BJMP3294B)和g5簇CRF01_AE序列(JX112804)聚集成大单系进化簇(bootstrap值分别为97%和100%)。9个CRF103_01B病例均携带非核苷类逆转录酶抑制剂类V106I突变。结论CRF103_01B毒株最可能起源于北京MSM人群,并在北京和河北等地的MSM人群中低水平持续流行,并经异性性途径向一般人群播散。需加强该毒株分子流行病学和耐药监测,关注疾病进展。