ATP2A1影响结直肠癌增殖、迁移及免疫浸润的机制研究

目的:探究内质网Ca2+转运ATP酶亚型1(ATP2A1)参与影响结直肠癌(CRC)生物学行为和免疫浸润的机制。方法:采用转录组及免疫组化(IHC)分析ATP2A1在结直肠癌肿瘤细中表达与结直肠癌患者预后的关系,采用GO和KEGG分析ATP2A1表达水平可能参与的细胞功能及信号通路。ESTIMATE算法分析ATP2A1表达对肿瘤微环境及肿瘤突变负荷的影响。CCK8增殖实验及流式细胞周期实验检测ATP2A1参与结直肠癌增殖的机制,采用划痕伤口愈合实验、Transwell实验和Western blot实验分析ATP2A1参与结直肠癌迁移的机制。结果:依据ATP2A1表达的中位值将结直肠癌患者分为高、低表达两组,Kaplan-Meier曲线及Cox回归分析表明ATP2A1高表达是结直肠癌患者的预后风险因素,ESTIMATE算法结果表明ATP2A1表达降低免疫细胞浸润丰度,增加肿瘤突变负荷(TMB)和肿瘤细胞干性。CCK8增殖实验及细胞周期检测实验结果表明敲低ATP2A1表达引起直肠癌细胞S期阻滞进而抑制细胞增殖。划痕伤口愈合实验、Transwell和Western blot实验结果表明ATP2A1可以通过促进结直肠癌细胞上皮间充质转化增强结直肠癌细胞的迁移能力。结论:ATP2A1在结直肠癌中高表达,促进结直肠癌细胞的增殖及迁移,影响结直肠癌患者的预后和免疫治疗效果。

萝卜硫素的体外抗氧化和抑菌活性

目的观察萝卜硫素(SFN)体外抗氧化和抑菌活性。方法试剂盒检测SFN总抗氧化能力(TAC)、抑制超氧阴离子(O2-)活力;水杨酸比色法和邻苯三酚自氧化法检测羟自由基(OH-)与超氧阴离子(O2-)清除能力;滤纸片法检测SFN的抑菌作用,连续二倍稀释法测定其最低抑菌浓度(MIC)、最低杀菌浓度(MBC)和对大肠杆菌和金色葡球菌生长的抑制。结果 SFN在体外模拟系统中总抗氧化活性和抑制抑制O2-生成活力较高,但对OH-和O2-的直接清除率较低,低于30%。抑菌结果表明SFN对大肠杆菌、金色葡萄球菌、绿脓杆菌、枯草杆菌、表皮葡萄球菌5种受试菌均有较强的抑制作用,MIC为0.78～6.25μg/ml之间。结论 SFN具有较好的抗氧化活性和较强的抑菌效果。

《细胞遗传学》课程无纸化考试的实践研究

在高校课程中推行无纸化考试的考务模式,既高效实测了大学生学习的成效,又做到了考试的公平公正,同时减少了人口的流动,利于高校教学质量的提升和节约型社会的构建。相较于传统化的纸质考试,高校《细胞遗传学》课程无纸化考核的应用,未显著影响大学生的考试成绩,具有一定的优越性,为教学改革提供了高效服务,值得在数字化校园建设中广泛推广。

关于医学遗传学实验教学改革与创新的思考

医学遗传学的快速发展对实验教学提出了更高的要求,对医学遗传学实验教学改革与创新的必要性进行了讨论,并对实验教学改革与创新的内容、形式方法等诸多问题进行了分析和思考,以期进一步推动医学遗传学实验教学质量的提高。

短尾猴样品中常见哺乳动物及人源污染的特异性研究

为检测在野外通过非损伤取样法采集到的短尾猴样品,是否受到其它常见哺乳动物及人源的污染,收集包括短尾猴(Macaca thibetana)、人以及7种常见哺乳动物的毛发、血液、粪便、精液或肌肉组织样品,用14对微卫星引物扩增不同物种的STR位点。结果表明,FGA位点在常见动物猪、羊、牛、狗、兔、小白鼠及豚鼠都未见扩增产物:TH01等14对引物在人和短尾猴中均能扩增,扩增产物长度未见明显差异;F13A01产物长度在人和短尾猴之间差异显著。因此,通过FGA、F13A01特异性座位的扩增可以排除短尾猴样品是否受到人及常见哺乳动物的污染。此方法简单、稳定性高、可重复性好,在短尾猴的分子遗传学研究中有较大的应用价值。

安徽蚌埠地区汉族人群亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性

目的:探讨蚌埠地区汉族人群亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性C677T、A1298C的分布特征,并与其它地区人群进行比较。方法:采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对78例健康者进行了基因分型,并结合文献与其它地区、民族的基因型和等位基因频率分布进行比较。结果:蚌埠汉族人MTHFRC677T的三种基因型CC、TC和TT频率分别为48.7%、39.8%和11.5%,T等位基因频率是31.4%;A1298C的三种基因型AA、AC和CC频率分别为59.0%、38.5%和2.5%,C等位基因频率是21.8%。结论:蚌埠汉族人与其它地区人群MTHFR基因多态性的分布有差异。

短尾猴样品常见污染的检测方法

为检测在野外通过非损伤取样法采集到的短尾猴样品是否受到其它常见哺乳动物及人源的污染,收集包括短尾猴(Macaca thibetana)、人以及7种常见哺乳动物的毛发、血液、粪便、精液或肌肉组织样品,提取并纯化基因组DNA,利用14对微卫星引物扩增不同物种的STR位点,以确定其在短尾猴样品检测中的应用价值。扩增结果表明,TH01等13对引物在人和短尾猴中均能扩增且扩增产物长度未见明显差异,F13A01产物长度在人和短尾猴之间相差240bp碱基,只有FGA位点在常见动物猪、羊、牛、狗、兔、小白鼠及豚鼠都未见扩增产物;因此,FGA、F13A01座位较高的分辨能力,可以排除短尾猴样品是否受到人及常见哺乳动物的污染,通过特异性STR引物结合PCR方法,检测短尾猴野外非损伤取样获得的样品是否受到哺乳动物及人源DNA污染,此方法简单、稳定性高、可重复性好,在短尾猴的遗传多样性分析及亲缘关系鉴定中有较大的应价值。

Tag SNPs在鉴定肿瘤易感性基因研究中的应用

以标签单核苷酸多态性(Tag SNP)为基础的关联研究是鉴定肿瘤易感基因的重要策略,有效地获取和利用Tag SNPs成为肿瘤易感基因领域研究的热点之一。作者对Tag SNPs的获取、检测及其在肿瘤易感性研究中的应用作一综述。

开设《探索性实验》课程探索医学院校生物科学专业创新型人才培养模式

蚌埠医学院生物科学专业自设立以来教学改革成效显著,其改革的亮点之一是把《探索性实验》作为一门专业必修课程,让学生经历一次科研创新全过程的实践,从而培养学生创新精神和创新能力。本文就此课程的开设和具体实践汇报如下。

医学遗传学实验课程改革探索与实践

《医学遗传学》是一门实践性和操作性较强的学科,培养学生分析问题和解决问题能力、创新能力和科研意识是提高《医学遗传学》实验教学质量的关键。本文从实验内容选择、实习基地建设、建立第二课堂等方面对《医学遗传学》实验课进行了有益探索,取得了较好的教学效果。

精准医疗思维在医学遗传学教学中的实践探索

精准医疗的到来对医学教育提出了更高的要求,如何提高学生精准医疗思维成为一个新的挑战。医学遗传学是与精准医疗理念联系最为密切的学科之一,本研究意图将精准医疗的思维应用于医学遗传学的教学实践中,从教学内容的更新、案例设计、科研实践等多方面进行改革,引导学生树立精准医疗的理念,旨在摸索出融入精准医疗理念的新的医学遗传学教学模式,培养更加适应新时期医学发展需求的新型精准医疗人才。

自然流产夫妇的染色体畸变及其分析

目的探讨中国人群染色体畸变与自然流产的关系。方法检索2001~2010间CNKI、万方、pubmed数据库中收录的文献,并结合研究的68对自然流产夫妇,分析不同类型染色体畸变对自然流产的影响。结果累计病例30 544例,其中染色体异常计2 384例,占流产总数的7.81%。其中,染色体结构异常有1131例,多态性796例,数目异常406例,嵌合体51例分别占检测总人数的3.70%、2.61%、1.33%和0.17%。结论对自然流产患者进行核型分析中应注意加强7号染色体易位、9号染色体倒位及其Y染色体多态性的检出。

发现式教学法在男患者留置导尿术教学中的应用

目的:观察发现式教学法在男患者留置导尿术中的应用效果。方法:将2008级临床医学本科专业116名男学生随机分为观察组和对照组,在男患者留置导尿术的教学中对照组(58名)采用传统教学法,观察组(58名)采用发现式教学法,比较2种教学方法的教学效果。结果:观察组操作考核成绩和违反无菌操作的发生率与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.01);学生对发现式教学总体评价满意度为87.93%,其中认为发现式教学开发了潜能,拓展了知识和提高了能力,提高了理论与实际的结合者分别占86.21%、89.66%和91.38%。结论:技能教学中适当采用发现式教学模式能激发学生的学习兴趣,提高学生理论联系实践的能力。

敲低长链非编码RNA AC007392.4对结直肠癌细胞增殖、周期及凋亡的影响及其机制

目的通过敲低长链非编码RNA AC007392.4的表达,探讨其对结直肠癌细胞增殖、凋亡及周期的影响及潜在分子机制。方法通过癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)分析AC007392.4在结直肠组织的表达情况;通过皮尔森相关系数构建AC007392.4基因共表达网络,并对共表达基因进行富集分析;通过脂质体转染法敲低结直肠癌细胞系SW480中AC007392.4的表达,CCK-8法检测AC007392.4对结直肠癌细胞增殖的影响;流式细胞仪检测AC007392.4对细胞凋亡及细胞周期的影响;Real-time PCR方法检测敲低AC007392.4对下游通路关键分子mRNA的影响。结果 AC007392.4在结直肠癌中表达上调(P=0.041),且与病理分期有关(P=0.044);共有2354个蛋白编码基因与AC007392.4表达具有高度相关性,且这些蛋白编码基因显著地富集在DNA损伤修复与细胞周期相关的通路中;敲低AC007392.4抑制结直肠癌细胞增殖、促进其凋亡;敲低AC007392.4后可使细胞周期G2/M期发生阻滞;敲低AC007392.4后,CDK1的mRNA表达水平明显降低(P<0.05)。结论 AC007392.4在结直肠癌中表达量上调,敲低后抑制结直肠癌细胞的增殖并促进凋亡;AC007392.4可能通过调控细胞周期参与了结直肠癌的发生发展。

基因AL360181.1调节结直肠癌进展及预后的生物信息学分析

目的通过生物信息学方法分析基因AL360181.1在结直肠癌进展及预后中的作用,并进一步预测可能的分子机制。方法从TCGA数据库下载结直肠癌基因表达数据及临床数据,应用Perl及R软件对数据整理后筛选出差异表达的基因,进一步对差异基因批量化行生存、独立预后及临床病理相关性分析,选取相关性最强的差异基因作为目的基因;分析目的基因的表达与结直肠癌不同临床病理特征的相关性及对患者预后的影响;采用R软件对不同的临床病理特征行独立预后分析;分析目的基因以及不同临床病理与患者生存预后的关系;应用GSEA对目的基因行KEGG通路富集分析并利用R软件分析目的基因与潜在靶基因的相关性,预测目的基因调控结直肠癌进展及预后可能的机制。结果基因AL360181.1在结直肠癌组织中显著高表达(P<0.01);AL360181.1与结直肠癌的分级、TNM分期具有相关性(P<0.05);基因AL360181.1、年龄、肿瘤分级、TNM分期与患者预后相关(P<0.05),且基因AL360181.1及年龄可作为评价患者预后的独立风险因子;基因AL360181.1的表达水平、患者年龄、分级及TNM分期与患者的生存状态相关(P<0.05);GSEA富集分析显示基因AL360181.1在mTOR信号通路中被富集;基因AL360181.1与潜在靶基因的相关性分析显示,AL360181.1与mTOR、AKT、KLKB1、RICTOR、TSC1、TSC2具有相关性(|R|>0.1、P<0.05)。结论基因AL360181.1可通过AKT/mTOR信号通路调节结直肠癌的进展。

胃癌中EXD3基因的表达及功能的生物信息学分析

目的通过生物信息学分析研究胃癌与正常胃粘膜间具有差异性表达的基因,找出参与胃癌发生发展及预后的关键基因,并对其所涉及的功能进行分析预测。方法从GEO表达谱数据库中下载表达谱基因芯片数据GSE100935(包括18例胃癌样本及正常胃粘膜组织),利用Morpheus在线软件分析基因芯片GSE100935的数据,获得在胃癌与正常胃粘膜组织中存在差异表达的基因,并构建聚类分析热图;利用软件UALCAN在线分析差异表达基因在胃癌与正常胃粘膜组织中表达水平;利用Kaplan-Meier绘图软件对差异表达基因在胃癌患者中的表达高低进行生存分析;最后采用Fun Rich软件进行GO功能富集分析,网站STRING构建目的基因蛋白互作网络。结果通过分析基因芯片GSE100935获得45119个差异表达的基因;在线分析软件UALCAN显示EXD3基因在胃癌组织中高表达;同时生存分析提示当EXD3基因高表达时,胃癌患者的预后相对较差;GO功能富集分析发现,差异表达基因主要与胃癌细胞核苷酸的新陈代谢调节以及转录因子的活动有关。结论 EXD3可能是胃癌中潜在的癌基因,可能与DNA损伤修复有关,其表达上调在胃癌的发生发展及预后过程发挥重要作用,并有望成为判断胃癌患者预后的重要的生物学指标。

长链非编码RNA MIR4713HG调节结直肠癌进展及预后的生物信息学分析

目的:通过生物信息学方法,分析长链非编码RNA(long no-codding RNA,lncRNA)MIR4713HG对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)进展及预后的作用,并进一步预测可能的分子机制。方法:从肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载CRC基因表达数据及临床数据,应用Perl及R软件对数据进行整理后筛选出差异表达的基因;进一步对差异基因行生存、独立预后及临床病理相关性分析,选取相关性最强的差异基因作为目的基因;分析目的基因的表达与CRC不同临床病理特征的相关性及对患者预后的影响;利用R软件对不同的临床病理特征行独立预后分析;最后,对目的基因行基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA),并利用R软件分析目的基因与潜在靶基因的相关性,预测目的基因调控CRC进展及预后可能的机制。结果:通过对基因表达数据进行分析获得7866个差异表达基因;对差异基因行生存、独立预后及临床病理特征相关性分析发现,MIR4713HG与CRC的生存预后及临床病理特征均显著相关。选取MIR4713HG作为目的基因,通过TCGA数据库发现MIR4713HG在CRC组织中显著高表达(P<0.001);MIR4713HG与CRC的分级、TNM分期具有相关性(P<0.05),而与患者的年龄无相关性(P=0.999);独立预后分析提示患者预后与MIR4713HG、年龄、肿瘤分级、TNM分期相关(P<0.05),MIR4713HG及年龄可作为评价患者预后的独立风险因子。GSEA显示,MIR4713HG在P53信号通路中被富集;MIR4713HG与潜在靶基因的相关性分析显示,MIR4713HG与BAK1、FAS具有相关性(|r|>0.25,P<0.001)。结论:lncRNA MIR4713HG可作为评价CRC进展及预后的靶标,其可能通过P53/BAK1/FAS信号通路发挥作用。

lncRNA靶向miRNA调控Wnt信号通路在结直肠癌中的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA,而微小RNA(miRNA)是一类长度约为22nt的内生小RNA;越来越多的研究证据表明,lncRNA通过靶向miRNA调控Wnt信号通路并在肿瘤的发生发展中发挥重要作用。结直肠癌是外科常见的恶性肿瘤,诊断及预后均不理想。随着研究的进一步深入,lncRNA、miRNA以及Wnt信号通路在结直肠癌发生发展中的调控机制逐渐明确。本文将对lncRNA靶向miRNA调控Wnt信号通路在结直肠癌中的研究进展进行综述。

m6A甲基转移酶METTL3在结直肠癌中的研究进展

越来越多的证据表明RNA甲基化作为mRNA最常见的修饰方式在肿瘤发生、发展中发挥重要的作用。结直肠癌是消化系统常见恶性肿瘤,严重危害中老年人健康。尽管关于结直肠癌的发生和发展的生物学机制已有许多研究,但对结直肠癌的诊断和预后作用仍存在较大的不足。随着对RNA甲基化研究的深入,发现m6A甲基转移酶METTL3与结直肠癌的发生、发展及预后显著相关;但是,其在结直肠癌中的作用尚存在争议。本文将对m6A甲基转移酶METTL3在结直肠癌发生、发展及预后中的作用进行综述。

胃癌中IBSP基因表达及预后的生物信息学分析

目的:通过生物信息学分析筛选出胃癌和正常胃黏膜间差异表达基因,分析并预测其在胃癌发生发展及预后中的价值。方法:从癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载胃癌患者RNA-seq数据,使用软件R-Studio筛选差异表达基因,运用DAVID进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析,研究PI3K-Akt通路中表达差异最明显的基因,通过网站UALCAN对其进行表达量及临床病理特征分析,利用在线网站STRING构建蛋白互作网络,同时利用Kaplan-Meier Plotter在线分析其与胃癌患者预后的相关性。结果:共获得5 704个差异表达基因,包括1 225个上调和1 479个下调的蛋白编码基因;KEGG通路分析确定骨涎蛋白(integrin binding sialoprotein,IBSP)为目的基因;IBSP基因在胃癌组织中明显高表达(P<0.001);且与胃癌患者的临床病理特征及不良预后明显相关(P<0.05)。结论:IBSP基因作为胃癌中潜在的癌基因,可能通过PI3K-Akt信号通路调控胃癌的早期进展,进而导致胃癌患者预后不良,有望成为胃癌新的临床诊断和预后标志物。