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题名小立碗藓泛素连接酶U-box家族的鉴定及表达分析
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作者
吴小嫒
姜山
陈波
闫慧清
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机构
贵州师范大学生命科学学院
贵州省土壤肥料研究所
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出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期1678-1688,共11页
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基金
国家自然科学基金(32060587)
贵州省自然科学基金重点项目(ZK [2023]ZD026)。
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文摘
U-box家族编码E3泛素连接酶能够特异性识别底物,从而调控蛋白的修饰和降解过程。为鉴定小立碗藓U-box家族成员,分析其生物学特征及基因表达规律,该研究基于小立碗藓的全基因组测序数据,通过生物信息学技术对泛素连接酶U-box家族成员的理化性质、进化关系、顺式作用元件、组织表达模式、胁迫响应等进行了分析。结果表明:(1)在小立碗藓全基因组中共鉴定得到31个U-box家族成员,并且不均匀地分布于14条染色体上;其分子量大小在37.75~117.49 kDa之间,等电点介于5.32~8.55之间。(2)进化树显示,小立碗藓的U-box家族成员分布在I-IX亚家族中,其中亚家族VII含有小立碗藓成员最多,共11个(约占36.67%),说明小立碗藓在历史进化过程中具有高度保守性且功能多样化。(3)经启动子分析发现,小立碗藓U-box家族成员具有结合GA和ABA等多个激素的元件。(4)组织表达分析发现小立碗藓U-box家族成员主要在绿丝体、轴丝体和孢子体S3时期大量表达。(5)通过ABA、甘露醇和饱和LiCl处理后发现,配子体的拟茎均发生黄化且PpPUB21的表达量均被显著诱导。推测小立碗藓U-box家族成员在生长发育和响应逆境胁迫中发挥着重要作用,这为后续深入研究小立碗藓U-box家族成员的基因功能研究奠定了理论基础,也为其相关研究提供了参考。
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关键词
小立碗藓
U-box家族
基因表达
功能分析
全基因组鉴定
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Keywords
Physcomitrium patens
U-box family
gene expression
functional analysis
genome-wide identification
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
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题名侗族山区民族植物资源调查及其传统知识
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作者
吴小嫒
兰世超
覃韩琳
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机构
贵州师范学院
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出处
《河南农业》
2019年第32期63-64,共2页
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基金
贵州省高校人文社科研究基地项目“侗族山区传统生物知识及其传承利用调查研究”,项目编号:JD2014145
贵州师范学院一流大学建设项目,项目编号:贵师院发[2018]100号化学实验教学中心
+1 种基金
贵州师范学院大学生科研项目“侗族山区传统植物调查与生态理念研究”,项目编号:2019DXS198
贵州师范学院2018年校级“贵州师范学院数字化植物标本库的建设研究”课题研究成果,项目编号:2018YB002
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文摘
对贵州省锦屏县瑶白村的植物资源及其传统知识进行较系统的调查、收集和整理。结果表明,瑶白村的植物资源共有73科155属180种,包括食用植物、药用植物、信仰植物和染色植物4类。其中,传统食用植物有32属60属72种,占39%;药用植物有58科103属112种,占62%;信仰植物17科21属21种,占12%;传统染料植物9科9属9种,占5%。瑶白村属于侗族山区,有非常明显的地方民族特色,在食用植物、药用植物、宗教植物和染料植物资源利用中形成了自己独特的传统知识。
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关键词
植物资源
侗族山区
瑶白村
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分类号
R28
[医药卫生—中药学]
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