高血压脑出血血管病变关键基因初步筛选

目的筛选出高血压脑出血(hypertensive intracerebral hemorrhage,HICH)血管病变的关键基因,为干预HICH提供新的候选靶点。方法从小鼠基因组信息数据库(Mouse Genome Informatics,MGI)中筛选得到149个有脑出血表型的基因,建立基因集MGI-149;构建HICH动物模型并对脑血管进行转录组测序分析,建立HICH脑血管差异表达基因集HICH-DEG。通过基因本体(gene ontology,GO)富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,构建GO/PPI评分系统。结合基因重要性分析,在上述两个基因集的交集基因以及HICH-DEG基因集中筛选HICH血管病变关键基因,并用GeneMANIA对初筛基因进行分析和预测,以了解初筛基因参与HICH血管病变的潜在生物学功能和通路。结果通过GeneMANIA预测及基于预测进行的富集分析,结合文献调研,舍弃缺少预测结果和文献支持的基因Zfp697、Gm11738,最终获得Ctnnb1、Kdr、Syk、Tnf和Abca1五个基因作为初筛关键基因。结论本研究初步筛选出基因Ctnnb1、Kdr、Syk、Tnf、Abca1,它们可能在HICH血管病变中发挥关键作用,并有可能成为HICH临床前干预的重要靶标。