不同养殖模式下凡纳滨对虾肠道及环境微生物群落结构分析与比较

为探究河北省唐山市不同养殖模式下凡纳滨对虾肠道及养殖环境微生物群落结构及差异,采用16S rRNA高通量测序技术和生物信息学方法,分析了淡水精养(Freshwater intensive culture,FI)和混养(Freshwater mixed culture,FM)2种养殖模式不同时期对虾肠道、水体及底泥微生物的多样性、物种组成及差异。结果表明,FI模式所有样品共聚类为6077个可操作分类单元(OTU),FM模式所有样品共聚类为7961个OTU。2种模式的底泥微生物多样性均显著高于水体和对虾肠道,且FM模式底泥的多样性更高。在门水平上,变形菌门(Proteobacteria)是所有样品中相对丰度均较高的物种,其次为拟杆菌门(Bacteroidetes);在属水平上,不同养殖模式下不同样品的优势菌属及相对丰度各不相同。相较于对虾肠道和水体,底泥中微生物的数量和丰富度均为最高;底泥与对虾肠道微生物种类及组成较为相似。研究表明,唐山市2种凡纳滨对虾淡水养殖模式下对虾肠道与环境微生物物种数量随养殖时间的变化基本不变,但物种群落丰富度及多样性均有一定提高;相较于FI模式,FM模式各类型样品微生物群落物种数量更多,且养殖末期时物种相对丰度的变化更加显著,特别是对虾肠道中弧菌属细菌相对丰度显著提高。