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组织蛋白酶D有助于SRBSDV在白背飞虱体内复制
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作者 付亚亭 郭冬阳 吴清发 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期20-23,共4页
在白背飞虱(Sogatella furcifera)获毒过程中,南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black streaked dwarf virus,SRBSDV)与细胞膜上受体结合,借助网格蛋白依赖型内吞作用进入宿主细胞。组织蛋白酶D(Cathepsin D,CathD)是一种天冬氨酸蛋... 在白背飞虱(Sogatella furcifera)获毒过程中,南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black streaked dwarf virus,SRBSDV)与细胞膜上受体结合,借助网格蛋白依赖型内吞作用进入宿主细胞。组织蛋白酶D(Cathepsin D,CathD)是一种天冬氨酸蛋白酶,参与细胞内体/溶酶体内蛋白降解和病毒释放进入细胞质过程,但CathD在SRBSDV侵染其介体白背飞虱时是否发挥作用目前尚不明确。通过RNA干扰(RNA interference,RNAi)沉默白背飞虱体内CathD基因的表达,发现沉默表达CathD基因的白背飞虱在饲喂SRBSDV后的存活率与对照组白背飞虱相比无明显差异,但会降低白背飞虱的带毒比率和带毒量;在果蝇细胞中敲低CathD同源基因的表达并感染果蝇C病毒(Drosophila C virus,DCV),细胞内DCV的复制水平与对照组相比也有明显下调。研究结果提示CathD可能通过一种保守的机制协助病毒在昆虫细胞内增殖,可以作为防控SRBSDV病害的潜在靶标分子。 展开更多
关键词 白背飞虱 RNA干扰 内吞作用 南方水稻黑条矮缩病毒 组织蛋白酶D
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药物基因组学研究进展 被引量:13
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作者 吴清发 纪佳 董伟 《生物技术》 CAS CSCD 2002年第2期39-41,共3页
关键词 药物基因组学 单核苷酸多态性SNP 代谢酶 受体蛋白 转运蛋白 研究进展
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汕头海湾大桥悬索桥主缆施工技术 被引量:2
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作者 吴清发 石国彬 +1 位作者 张文忠 胡利平 《华南理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 1999年第11期75-82,共8页
汕头海湾大桥是我国第一座现代悬索桥.主桥结构体系为三跨154m+452m+154m双铰预应力钢筋混凝土加劲箱梁的悬索桥.主缆是悬索桥的主要承重悬索结构.主缆系统的施工主要包括猫道架设、索股架设、索夹吊索安装和防腐等项目.
关键词 悬索桥 主缆 钢丝束 索夹 吊索 施工
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基因组学研究中一些常用软件的概述 被引量:5
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作者 吴清发 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期708-712,共5页
基因组学是以一个物种的全部遗传信息为研究对象,在整体上研究遗传信息的分子组成、组织结构、表达调控和进化等内在机制的基础性学科。基因组学研究中海量数据的存储、管理和检索,以及对这些数据进行挖掘等过程,必须借助于生物信息学... 基因组学是以一个物种的全部遗传信息为研究对象,在整体上研究遗传信息的分子组成、组织结构、表达调控和进化等内在机制的基础性学科。基因组学研究中海量数据的存储、管理和检索,以及对这些数据进行挖掘等过程,必须借助于生物信息学的方法。目前,大量成熟的软件广泛地应用在基因组学研究中,它们大都可通过互联网免费访问或索取。本文拟对人类基因组计划中常用的一些软件如序列比对、序列组装、重复序列鉴定和基因预测等软件的原理作一介绍,并结合典型软件加以说明。 展开更多
关键词 基因组学 比对 组装 重复序列 软件
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空气和空调器样本中SARS冠状病毒的检测 被引量:13
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作者 杜宗敏 王效义 +9 位作者 戴二黑 刘海洪 韩延平 庞昕 翟俊辉 杨瑞馥 吴清发 李京湘 杨玲 汪建 《中国消毒学杂志》 CAS 北大核心 2005年第2期156-158,共3页
为研究SARS的传播途径,给医务人员防护提供依据。采用8级安德森空气微生物采样器对SARS病房中空气进行采样、收集空调器冷凝水和空调器滤网尘土标本,应用常规反转录套式PCR检测样本中SARS冠状病毒。结果,共检测40份样,检出阳性标本18份... 为研究SARS的传播途径,给医务人员防护提供依据。采用8级安德森空气微生物采样器对SARS病房中空气进行采样、收集空调器冷凝水和空调器滤网尘土标本,应用常规反转录套式PCR检测样本中SARS冠状病毒。结果,共检测40份样,检出阳性标本18份,阳性率为45%;其中空气标本36份,阳性15份,2份空调滤网尘土标本均为阳性,2份空调冷凝水标本检出1份阳性。随机挑选PCR阳性标本2份进行病毒分离试验,2份均为阳性。结果显示,检测SARS病房空气标本以及空调器冷凝水和空调器滤网尘土标本,均获得较高的SARS冠状病毒阳性率并分离到存活病毒。表明环境空气中存在活的SARS冠状病毒,推测SARS确有可能通过空气飞沫传播,本结果可供SARS病房的医护人员采取防护措施参考。 展开更多
关键词 安德森采样器 反转录套式PCR 重症呼吸综合症 冠状病毒
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汕头海湾大桥悬索桥下部结构施工技术 被引量:6
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作者 石国彬 吴清发 +1 位作者 张文忠 胡利平 《华南理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 1999年第11期68-74,共7页
汕头海湾大桥是我国第一座现代悬索桥.下部结构主要包括索塔和锚啶.本文介绍了该桥下部结构施工的一些关键技术环节,包括主缆锚旋锚固系统的安装,大体积混凝土的温控防裂,主塔基础和承台的海上施工,塔柱滑模施工控制等.
关键词 悬索桥 索塔 锚碇 施工技术 下部结构
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葡萄球菌激酶(Sak)的基因克隆和高效表达工程菌的构建 被引量:4
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作者 桂向东 吴清发 +2 位作者 范清林 傅永标 宋礼华 《生物学杂志》 CAS CSCD 1998年第4期12-14,共3页
利用PCR技术,从金黄色葡萄球菌中扩增Sak基因并将其克隆到pUC19质粒上,确认其碱基序列正确后,再将其亚克隆到pJW2质粒并转化大肠杆菌DH5α获Sak高表达工程菌(DH5α/pJS)。试验结果表明,Sak可占菌... 利用PCR技术,从金黄色葡萄球菌中扩增Sak基因并将其克隆到pUC19质粒上,确认其碱基序列正确后,再将其亚克隆到pJW2质粒并转化大肠杆菌DH5α获Sak高表达工程菌(DH5α/pJS)。试验结果表明,Sak可占菌体总蛋白的50%。 展开更多
关键词 基因克隆 高效表达 工程菌 葡萄球菌激酶
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基因工程蛋白下游纯化技术研究进展 被引量:1
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作者 范清林 桂向东 +2 位作者 吴清发 魏跃武 宋礼华 《生物学杂志》 CAS CSCD 1998年第3期4-6,共3页
基因工程蛋白下游纯化技术研究进展范清林桂向东吴清发魏跃武宋礼华(安徽省生物研究所,合肥230031)自从1972年首次发现核酸内切酶,并在同年完成了世界上第一次成功的DNA体外重组实验以来,基因工程技术在二十多年的历... 基因工程蛋白下游纯化技术研究进展范清林桂向东吴清发魏跃武宋礼华(安徽省生物研究所,合肥230031)自从1972年首次发现核酸内切酶,并在同年完成了世界上第一次成功的DNA体外重组实验以来,基因工程技术在二十多年的历程中经历了飞速的发展。我国在八十年... 展开更多
关键词 蛋白质 下游纯化技术 基因工程
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逆转录套式PCR检测粪便样本中的SARS冠状病毒 被引量:2
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作者 戴二黑 李京湘 +15 位作者 杜宗敏 吴清发 王效义 杨玲 刘海洪 庞昕 韩延平 翟俊辉 江凌晓 陈泽良 邱茂锋 王津 王宏霞 郭兆彪 汪建 杨瑞馥 《微生物学免疫学进展》 2004年第4期22-25,共4页
为了观察SARS冠状病毒在SARS患者粪便中的存在规律,建立了检测SARS冠状病毒RNA的逆转录聚合酶链反应(RTPCR)方法,并应用该方法检测了241份SARS患者粪便样本。部分PCR产物应用测序技术进行验证。RTPCR的灵敏度为1010稀释度的病毒原液(原... 为了观察SARS冠状病毒在SARS患者粪便中的存在规律,建立了检测SARS冠状病毒RNA的逆转录聚合酶链反应(RTPCR)方法,并应用该方法检测了241份SARS患者粪便样本。部分PCR产物应用测序技术进行验证。RTPCR的灵敏度为1010稀释度的病毒原液(原液为108TCID50/ml)。241份粪便样本的总体检出率为24.1%(58/241),其中发病后的前10d和20d的检出率均为50.0%。随着发病时间的延长,阳性检出率呈下降趋势。应用RTPCR从粪便中检测SARS冠状病毒是可行的,在发病50d以后仍有17.0%左右的阳性检出率,提示SARS恢复期患者具有排毒的可能性,给后续的卫生防疫措施提供了一定的参考数据。 展开更多
关键词 逆转录-聚合酶链反应 SARS冠状病毒 检测 粪便
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应用套式RT-PCR检测SARS患者血液样品中SARS冠状病毒 被引量:1
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作者 王效义 戴二黑 +15 位作者 杜宗敏 刘海洪 韩延平 庞昕 翟俊辉 江凌晓 陈泽良 邱茂峰 王津 王宏霞 郭兆彪 杨瑞馥 吴清发 李京湘 杨玲 汪建 《生物技术通讯》 CAS 2004年第5期471-473,共3页
建立了套式RT-PCR方法检测SARS患者血液样品中SARS冠状病毒的方法,并检测血液样品257份。同时将RT-PCR与ELISA检测IgG、IgM的方法进行了比较。结果RT-PCR方法的总检出率为72%,IgG总检出率为68%,IgM总检出率为43%。
关键词 检出率 SARS冠状病毒 SARS患者 套式RT-PCR 血液样品 RT-PCR方法 ELISA检测 应用
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家蚕(Bombyx mori)全基因组框架图 被引量:1
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作者 夏庆友 周泽扬 +90 位作者 鲁成 程道军 代方银 李斌 赵萍 查幸福 程廷才 柴春利 潘国庆 许金山 刘春 林英 钱吉凤 侯勇 吴正理 李关荣 潘敏慧 李春峰 沈以红 蓝希钳 袁联伟 李田 徐汉福 杨光伟 万永继 朱勇 余茂德 沈卫德 吴大洋 向仲怀 于军 王俊 李瑞强 石剑萍 李恒 李光远 苏建宁 王晓玲 李国庆 张增金 吴清发 李俊 张庆鹏 韦宁 徐建哲 孙海波 董乐 刘东源 赵胜利 赵晓兰 孟庆顺 兰锋镝 黄显刚 李源哲 方林 李昌锋 李大为 孙永巧 张振鹏 杨峥 黄艳清 奚艳 亓秋辉 贺丹丹 黄海燕 张晓伟 王智强 李文杰 曹玉竹 余迎朴 俞鸿 李金宏 叶杰华 陈欢 周雁 刘斌 王晶 叶葭 纪海 李胜霆 倪培相 张建国 张勇 郑洪坤 毛炳宇 王文 叶辰 李松岗 汪建 Gane Ka-Shu Wong 杨焕明 《蚕学通讯》 2008年第4期1-16,共16页
我们在此报告了家蚕(Bombyx mori)的基因组序列框架图,它覆盖了所有已知家蚕基因的90.9%。我们估计的基因数是18510,超过黑腹果蝇报道的13379个基因。我们将家蚕基因组与果蝇、蚊子、蜘蛛和蝴蝶等进行了比较分析,揭示了它们在基因组成... 我们在此报告了家蚕(Bombyx mori)的基因组序列框架图,它覆盖了所有已知家蚕基因的90.9%。我们估计的基因数是18510,超过黑腹果蝇报道的13379个基因。我们将家蚕基因组与果蝇、蚊子、蜘蛛和蝴蝶等进行了比较分析,揭示了它们在基因组成上同时具有相似性和差异性。 展开更多
关键词 全基因组 框架图 家蚕 黑腹果蝇 基因组序列 基因组成 基因数 差异性
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人血小板生成素氨基端功能区cDNA的克隆及其定点突变
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作者 吴清发 桂向东 +2 位作者 范清林 魏跃武 宋礼华 《生物技术》 CAS CSCD 1998年第5期10-12,共3页
以Nested-PCR方法从人肝cDNA基因文库中扩增出编码人血小板生成素(hTPO)前153个氨基酸的氨基端功能区cDNA;在扩增中,采用非连续多核甘酸定点突变的方法.将翻译起始的七个氨基酸的原核中不常用的密码子同又突变成使用频率较高的密... 以Nested-PCR方法从人肝cDNA基因文库中扩增出编码人血小板生成素(hTPO)前153个氨基酸的氨基端功能区cDNA;在扩增中,采用非连续多核甘酸定点突变的方法.将翻译起始的七个氨基酸的原核中不常用的密码子同又突变成使用频率较高的密码子,以便于其在大肠杆菌中表达。序列测定证实了预期的结果。 展开更多
关键词 人血小板生成素 cNDA 定点突变 序列测定
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汕头海湾大桥悬索桥加劲梁施工技术
13
作者 石国彬 吴清发 +1 位作者 张文忠 胡利平 《华南理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 1999年第11期83-87,共5页
汕头海湾大桥是我国第一座现代悬索桥,主梁结构体系为三跨(154m+452m+154m)双铰预应力钢筋混凝土加劲箱梁,在同类型悬索桥中跨度居世界第一本文介绍加劲梁的施工方法,包括梁段的预制、安装和连接.
关键词 悬索桥 加劲梁 安装 连接 施工 主梁结构
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重组葡激酶中试工艺研究
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作者 范清林 桂向东 +6 位作者 吴清发 魏跃武 付永标 杨少民 何晓淮 姚建平 宋礼华 《生物学杂志》 CAS CSCD 1999年第3期14-16,共3页
采用大肠杆菌表达重组葡萄球菌激酶(Staphylokinase,Sak)表达产物占细菌菌体蛋白的50%左右,通过包涵体抽提、离子交换和凝胶过滤层析,每升发酵液可得到15g的纯品Sak,其理化性质和N末端15个氨基酸... 采用大肠杆菌表达重组葡萄球菌激酶(Staphylokinase,Sak)表达产物占细菌菌体蛋白的50%左右,通过包涵体抽提、离子交换和凝胶过滤层析,每升发酵液可得到15g的纯品Sak,其理化性质和N末端15个氨基酸序列与报道一致。我们成功地进行了连续三批中试产品的研究,三批中试结果相似,产品回收率在70%左右,纯度在97%以上。 展开更多
关键词 重组葡激酶 中试工艺 葡萄球菌激酶
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促血小板生成素的分子生物学研究进展
15
作者 桂向东 王兵 +4 位作者 范清林 吴清发 姚红谊 魏跃武 宋礼华 《生物学杂志》 CAS CSCD 1997年第1期1-4,共4页
促血小板生成素的分子生物学研究进展桂向东王兵范清林吴清发姚红谊魏跃武宋礼华(安徽省生物工程中心实验室,合肥230031)早在六七十年代就有人发现在血小板缺乏的动物和人的尿、血浆和血清中含有促巨核细胞增殖和血小板生成的... 促血小板生成素的分子生物学研究进展桂向东王兵范清林吴清发姚红谊魏跃武宋礼华(安徽省生物工程中心实验室,合肥230031)早在六七十年代就有人发现在血小板缺乏的动物和人的尿、血浆和血清中含有促巨核细胞增殖和血小板生成的因子,并把该因子叫做血小板生成素[... 展开更多
关键词 血小板生长素 细胞因子 分子生物学
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传染性非典型肺炎患者不同病程粪便标本中SARS-CoV的分离与鉴定
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作者 田薇 邓亚军 +8 位作者 吴清发 王绪敏 杨玲 张峰 刘晨辉 包其郁 汪建 杨焕明 刘明旭 《世界华人消化杂志》 CAS 2004年第5期1246-1248,共3页
目的:从粪便标本中分离并鉴定SARS-CoV. 方法:粪便浸出液接种Vero-E6细胞,盲传至出现明显的细胞病变效应(CPE),并能稳定传代.采用电镜法和RT- PCR技术鉴定细胞培养物中的SARS-CoV(本实验均在BSL-3实验室完成). 结果:大部分样本用Vero-E... 目的:从粪便标本中分离并鉴定SARS-CoV. 方法:粪便浸出液接种Vero-E6细胞,盲传至出现明显的细胞病变效应(CPE),并能稳定传代.采用电镜法和RT- PCR技术鉴定细胞培养物中的SARS-CoV(本实验均在BSL-3实验室完成). 结果:大部分样本用Vero-E6细胞盲传3代后发现明显的CPE,并能稳定传代.电镜负染检查,出现CPE的细胞可查见病毒颗粒;培养物上清RT-PCR扩增均为阳性.粪便样本直接用RT-PCR检测,阳性率仅为50%,细胞培养的检出率为73%. 结论:采用细胞培养结合RT-PCR技术检测粪便标本SARS- CoV比粪便标本直接RT-PCR的阳性率高. 展开更多
关键词 传染性非典型肺炎 粪便标本 SARS-COV 冠状病毒
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SARS患者病原学诊断及病毒传播规律研究
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作者 丁惠国 任翊 +11 位作者 王健 檀玉芬 汪巧娅 陈东 吴清发 陈唯军 闫惠苹 闵福援 杨玲 方健秋 赵春惠 汪健 《医学研究通讯》 2004年第1期45-47,共3页
目的探讨血清抗SARS-CoV特异性LgG、lgM;外周血单核细胞、漱口液以及粪便SARS-CoV特异性套式RT-PCR检测SARS-Cov RNA在SARS确诊中的意义,并通过研究其系列标本,进一步探讨SARS-Coy特异性IgG、IgM出现规律及病毒传播规律。方法临床诊断S... 目的探讨血清抗SARS-CoV特异性LgG、lgM;外周血单核细胞、漱口液以及粪便SARS-CoV特异性套式RT-PCR检测SARS-Cov RNA在SARS确诊中的意义,并通过研究其系列标本,进一步探讨SARS-Coy特异性IgG、IgM出现规律及病毒传播规律。方法临床诊断SARS患者28例。1周采集2次血清、大便及漱口液系列标本。ELISA测定血清抗SARS-CoV特异性lgG、lgM,套式RT-PCR检测外周血单核细胞、漱口液以及粪便SARS-CoV RNA。结果血清SARS-COV-lgM阳性率为50%(14/28);SARS-COv-lgG阳性率为78.6%(22/28)。早期(-10天)lgG可出现;4周阳性率最高;lgG出现晚(11天-)。2-3周阳性率最高;持续时间短(11天-),4周后大部分患者阴转。PBMC SARS-COVRNA阳性率为32.1%(9/28),病程10-14天阳性率最高;漱口液SARS-COVRNA阳性率为57.1%(16/28),大便SARS-COVRNA阳性率为60.7%(17/28);病程2-3周阳性率最高。85.7%(24/28)可确诊SARS;14.3%不能确诊SARS。结论 SARS诊断必须加入病原学诊断标准。而且必须结合特异性抗体、外周血单核细胞、漱口液以及大便SARS-CoV RNA检测,综合判断。由于SARS患者特异性抗体出现晚等特点。因此,SAPS特异性抗体不能作为早期诊断。SARS患者病程2-3周传染性可能最强,而早期(10天内)传染性可能弱。 展开更多
关键词 SARS 病原学 诊断 病毒传播 严重急性呼吸综合征 传染性非典型肺炎
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诉前船舶扣押与对物诉讼
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作者 吴清发 《中山大学研究生学刊(社会科学版)》 1996年第3期67-70,共4页
诉前船舶扣押是在英美法的"对物诉讼"的理论上发展起来的,并为后来的实践不断发展,进而有"玛瑞瓦禁令"。我国的船舶扣押由于《关于诉讼前扣押船舶的具体规定》的颁布,已走上法律化,但仍有待完善。
关键词 诉前船舶扣押 对物诉讼 玛瑞瓦禁令 对人诉讼 诉讼保全
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汕头海湾大桥主缆防腐
19
作者 胡利平 石国彬 +1 位作者 吴清发 张文忠 《广东公路交通》 1997年第1期1-6,共6页
本文主要介绍了悬索桥主缆防腐的常规方法及汕头海湾大桥主缆防腐的做法。
关键词 悬索桥 主缆 防腐 汕头海湾大桥 钢构件
全文增补中
RT-PCR对SARS患者粪便SARS冠状病毒RNA的连续测定及其临床意义 被引量:3
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作者 任翊 丁惠国 +6 位作者 吴清发 陈唯军 陈东 包志英 杨玲 赵春惠 汪健 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期368-371,共4页
目的采用RT-PCR方法,观察SARS冠状病毒(SARS-associatedcoronavirus,SARS-CoV)在SARS患者粪便中的排出状况。方法以2003年5月16日至23日在本院住院的46例临床确诊SARS患者为研究对象,连续留取粪便标本共103份,提取RNA后采用14对SARS-Co... 目的采用RT-PCR方法,观察SARS冠状病毒(SARS-associatedcoronavirus,SARS-CoV)在SARS患者粪便中的排出状况。方法以2003年5月16日至23日在本院住院的46例临床确诊SARS患者为研究对象,连续留取粪便标本共103份,提取RNA后采用14对SARS-CoV特异性引物,对每份标本同时进行7次套式RT-PCR扩增,只要有1次RT-PCR结果阳性即判定该标本为阳性。结果在46例患者中,有17例(37.0%)患者的粪便SARS-CoV套式RT-PCR扩增结果为阴性,29例(63.0%)为阳性。粪便SARS-CoVRT-PCR结果阳性时SARS患者的病程为(31.76±10.78)d(12~64d),其中最长1例为64d,系2次连续留取的粪便标本均为阳性、每次标本用2个不同引物RT-PCR扩增结果均为阳性。结论SARS-CoV在患者粪便中排出的时间可长达发病后64d,平均32d,对SARS患者恢复期的消毒隔离应该予以足够的重视。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征 SARS冠状病毒 套式RT-PCR
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