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Phylogenetic inference of the genus Bupleurum (Apiaceae) in Hengduan Mountains based on chromosome counts and nuclear ribosomal DNA ITS sequences
被引量:
17
1
作者
王奇志
何兴金
+3 位作者
周颂东
吴耘珂
余岩
逄云莉
《植物分类学报》
CSCD
北大核心
2008年第2期142-154,共13页
横断山区是中国柴胡属Bupleurum植物的分布中心。本文对横断山区6个种2变种进行了染色体记数报道,其中4个种2变种是首次报道。对横断山区的10个种4个变种、中国北方(河北和黑龙江)的3个种的nrDNA ITS进行测序,同时从GenBank里面下载同...
横断山区是中国柴胡属Bupleurum植物的分布中心。本文对横断山区6个种2变种进行了染色体记数报道,其中4个种2变种是首次报道。对横断山区的10个种4个变种、中国北方(河北和黑龙江)的3个种的nrDNA ITS进行测序,同时从GenBank里面下载同属的来自非洲和地中海西部的16个nrDNA ITS序列数据,结合染色体数目变化结果,初步探讨了横断山区柴胡属植物的系统发育。结果表明横断山区可能是现代柴胡属植物的频度中心和多样分布中心之一。它们的祖先种可能是非洲北部的木本柴胡属植物B.fruticosum,或者是地中海西部的柴胡属植物,推测是通过中东和高加索扩散而形成的,其中与非洲南部特有种B.mundtii的亲缘关系也较近;染色体基数演化趋势是:8是较原始基数,6和7是次生基数,其染色体异基数变异和多倍化可能是物种形成、进化以及向外扩散的主要方式;在ITS系统发育树中,中国柴胡属植物染色体基数为8的种类聚为一支,染色体基数为6和7的种类聚为了一支,不支持舒璞等(1998)关于中国柴胡属的属下分类系统。结合已有的形态学、细胞学、孢粉学证据和ITS系统发育树,建议窄竹叶柴胡B.marginatum var.stenophyllum独立成种。
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关键词
柴胡属
染色体
横断山区
ITS序列
系统发育
分类
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职称材料
基于核rDNA ITS序列的繁缕族疑似种分子鉴定
被引量:
7
2
作者
刘瑾
吴耘珂
+1 位作者
马子驭
何兴金
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期1101-1110,共10页
在中国植物志二十六卷中,花柱数目是划分繁缕族(Alsineae)的鹅肠菜属(Myoso-ton)、卷耳属(Cerastium)、繁缕属(Stellaria)等8属的重要检索项.作者在成都附近采集了6号繁缕族疑似种标本,其花柱数目等形态特征混淆,无法鉴定属种.采用核rDN...
在中国植物志二十六卷中,花柱数目是划分繁缕族(Alsineae)的鹅肠菜属(Myoso-ton)、卷耳属(Cerastium)、繁缕属(Stellaria)等8属的重要检索项.作者在成都附近采集了6号繁缕族疑似种标本,其花柱数目等形态特征混淆,无法鉴定属种.采用核rDNA中的ITS序列对石竹科(Caryophyllacaea)特别是繁缕族进行分子系统分析并据此对疑似种进行分子鉴定.最大简约法和邻接法分析结果均显示,繁缕族疑似种与鹅肠菜(Myosoton aquaticum)聚合成一支.在与无花菜属植物Arenaria racemosa的ITS序列进化速率比较后表明,疑似种均为鹅肠菜,其形态差异应属于种下变化范围,且居群之间存在花柱数目由5向3减少的演化趋势.
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关键词
系统发育
分子鉴定
疑似种
繁缕族
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职称材料
DNA条形码试剂盒检测技术在大小蠹属种类鉴定中的应用
被引量:
2
3
作者
安榆林
杨晓军
+3 位作者
叶兼菱
钱路
徐梅
吴耘珂
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期888-895,共8页
【目的】DNA条形码技术已成为生物分类鉴定的有力工具。DNA条形码技术的相关问题,如物种种内和种间的遗传距离出现重叠区域,将直接影响到物种鉴定的准确性。我们应用DNA条形码试剂盒检测技术来快速、准确地鉴定口岸截获的检疫性大小蠹...
【目的】DNA条形码技术已成为生物分类鉴定的有力工具。DNA条形码技术的相关问题,如物种种内和种间的遗传距离出现重叠区域,将直接影响到物种鉴定的准确性。我们应用DNA条形码试剂盒检测技术来快速、准确地鉴定口岸截获的检疫性大小蠹属种类。【方法】针对大小蠹昆虫设计引物以提高PCR扩增效率。运用自主研发的基因条码分析软件找出基因片段上区分每个物种的多态位点规律,作为该物种的鉴定特征并建立数据库,应用于物种鉴定。【结果】使用针对大小蠹属昆虫设计的引物成功扩增出325 bp的COI基因片段。将大小蠹属12种昆虫的COI基因片段上的核苷酸诊断位点的组合作为物种的鉴定特征,可以准确地区分近似种。通过比对植物检疫鉴定系统数据库里的鉴定特征,将6个大小蠹属的未知样品成功鉴定到种(核苷酸序列一致性为100%),与形态鉴定结果一致。【结论】结果表明DNA条形码试剂盒检测技术可以准确鉴定大小蠹属的种类。该检测技术可以应用于其他经济重要性有害生物的检测鉴定。
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关键词
树皮小蠹
入侵物种
DNA条形码
COI
鉴定特征
GBAS
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职称材料
“螈”在此山中
4
作者
吴耘珂
王聿凡(图)
《知识就是力量》
2022年第5期14-15,共2页
提起蝾螈,很多人并不熟悉,甚至从偏旁推断,会不会是某种昆虫?其实它们和娃娃鱼(大鲵)是亲戚,属于两栖动物。让我们跟着作者踏上蜿蜒的山间小路,去深入了解中国的蝾蠊吧。山间寻“螈”蝾螈体长大多在10~20厘米之间,属于两栖纲有尾目。
关键词
两栖纲
有尾目
两栖动物
蝾螈
昆虫
体长
原文传递
题名
Phylogenetic inference of the genus Bupleurum (Apiaceae) in Hengduan Mountains based on chromosome counts and nuclear ribosomal DNA ITS sequences
被引量:
17
1
作者
王奇志
何兴金
周颂东
吴耘珂
余岩
逄云莉
机构
四川大学生命科学学院
出处
《植物分类学报》
CSCD
北大核心
2008年第2期142-154,共13页
基金
supported by the National Natural Science Foundation of China,Grant No.30670146
the National Infrastructure of Natural Resources for Science and Technology,Grant No.2005DKA21403.
文摘
横断山区是中国柴胡属Bupleurum植物的分布中心。本文对横断山区6个种2变种进行了染色体记数报道,其中4个种2变种是首次报道。对横断山区的10个种4个变种、中国北方(河北和黑龙江)的3个种的nrDNA ITS进行测序,同时从GenBank里面下载同属的来自非洲和地中海西部的16个nrDNA ITS序列数据,结合染色体数目变化结果,初步探讨了横断山区柴胡属植物的系统发育。结果表明横断山区可能是现代柴胡属植物的频度中心和多样分布中心之一。它们的祖先种可能是非洲北部的木本柴胡属植物B.fruticosum,或者是地中海西部的柴胡属植物,推测是通过中东和高加索扩散而形成的,其中与非洲南部特有种B.mundtii的亲缘关系也较近;染色体基数演化趋势是:8是较原始基数,6和7是次生基数,其染色体异基数变异和多倍化可能是物种形成、进化以及向外扩散的主要方式;在ITS系统发育树中,中国柴胡属植物染色体基数为8的种类聚为一支,染色体基数为6和7的种类聚为了一支,不支持舒璞等(1998)关于中国柴胡属的属下分类系统。结合已有的形态学、细胞学、孢粉学证据和ITS系统发育树,建议窄竹叶柴胡B.marginatum var.stenophyllum独立成种。
关键词
柴胡属
染色体
横断山区
ITS序列
系统发育
分类
Keywords
Bupleurum, chromosome, Hengduan Mountains, ITS, phylogeny, taxonomy.
分类号
Q943 [生物学—植物学]
S666.103 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
基于核rDNA ITS序列的繁缕族疑似种分子鉴定
被引量:
7
2
作者
刘瑾
吴耘珂
马子驭
何兴金
机构
四川大学生命科学学院
出处
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期1101-1110,共10页
基金
国家自然科学基金(30670146)
科技部自然科技资源平台项目(2005DKA21403)
文摘
在中国植物志二十六卷中,花柱数目是划分繁缕族(Alsineae)的鹅肠菜属(Myoso-ton)、卷耳属(Cerastium)、繁缕属(Stellaria)等8属的重要检索项.作者在成都附近采集了6号繁缕族疑似种标本,其花柱数目等形态特征混淆,无法鉴定属种.采用核rDNA中的ITS序列对石竹科(Caryophyllacaea)特别是繁缕族进行分子系统分析并据此对疑似种进行分子鉴定.最大简约法和邻接法分析结果均显示,繁缕族疑似种与鹅肠菜(Myosoton aquaticum)聚合成一支.在与无花菜属植物Arenaria racemosa的ITS序列进化速率比较后表明,疑似种均为鹅肠菜,其形态差异应属于种下变化范围,且居群之间存在花柱数目由5向3减少的演化趋势.
关键词
系统发育
分子鉴定
疑似种
繁缕族
Keywords
phylogeny, molecular identification, suspected species, Alsineae
分类号
Q949 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
DNA条形码试剂盒检测技术在大小蠹属种类鉴定中的应用
被引量:
2
3
作者
安榆林
杨晓军
叶兼菱
钱路
徐梅
吴耘珂
机构
江苏出入境检验检疫局动植物与食品检测中心
Department of Ecology and Evolutionary Biology
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期888-895,共8页
基金
“十二五”国家科技支撑计划项目(2012BAK11B03)
文摘
【目的】DNA条形码技术已成为生物分类鉴定的有力工具。DNA条形码技术的相关问题,如物种种内和种间的遗传距离出现重叠区域,将直接影响到物种鉴定的准确性。我们应用DNA条形码试剂盒检测技术来快速、准确地鉴定口岸截获的检疫性大小蠹属种类。【方法】针对大小蠹昆虫设计引物以提高PCR扩增效率。运用自主研发的基因条码分析软件找出基因片段上区分每个物种的多态位点规律,作为该物种的鉴定特征并建立数据库,应用于物种鉴定。【结果】使用针对大小蠹属昆虫设计的引物成功扩增出325 bp的COI基因片段。将大小蠹属12种昆虫的COI基因片段上的核苷酸诊断位点的组合作为物种的鉴定特征,可以准确地区分近似种。通过比对植物检疫鉴定系统数据库里的鉴定特征,将6个大小蠹属的未知样品成功鉴定到种(核苷酸序列一致性为100%),与形态鉴定结果一致。【结论】结果表明DNA条形码试剂盒检测技术可以准确鉴定大小蠹属的种类。该检测技术可以应用于其他经济重要性有害生物的检测鉴定。
关键词
树皮小蠹
入侵物种
DNA条形码
COI
鉴定特征
GBAS
Keywords
Bark beetle
invasive species
DNA barcoding
COI
identification characteristics
GBAS
分类号
Q966 [生物学—昆虫学]
下载PDF
职称材料
题名
“螈”在此山中
4
作者
吴耘珂
王聿凡(图)
机构
美国康奈尔大学
不详
出处
《知识就是力量》
2022年第5期14-15,共2页
文摘
提起蝾螈,很多人并不熟悉,甚至从偏旁推断,会不会是某种昆虫?其实它们和娃娃鱼(大鲵)是亲戚,属于两栖动物。让我们跟着作者踏上蜿蜒的山间小路,去深入了解中国的蝾蠊吧。山间寻“螈”蝾螈体长大多在10~20厘米之间,属于两栖纲有尾目。
关键词
两栖纲
有尾目
两栖动物
蝾螈
昆虫
体长
分类号
Q958 [生物学—动物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Phylogenetic inference of the genus Bupleurum (Apiaceae) in Hengduan Mountains based on chromosome counts and nuclear ribosomal DNA ITS sequences
王奇志
何兴金
周颂东
吴耘珂
余岩
逄云莉
《植物分类学报》
CSCD
北大核心
2008
17
下载PDF
职称材料
2
基于核rDNA ITS序列的繁缕族疑似种分子鉴定
刘瑾
吴耘珂
马子驭
何兴金
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007
7
下载PDF
职称材料
3
DNA条形码试剂盒检测技术在大小蠹属种类鉴定中的应用
安榆林
杨晓军
叶兼菱
钱路
徐梅
吴耘珂
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
下载PDF
职称材料
4
“螈”在此山中
吴耘珂
王聿凡(图)
《知识就是力量》
2022
0
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