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拟南芥NBS1互作蛋白的筛选和鉴定
1
作者
吴钒漳
孙旭东
徐慧妮
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2023年第4期558-565,共8页
【目的】筛选拟南芥中NBS1的互作蛋白,探究NBS1蛋白的新功能,为后续研究奠定基础。【方法】利用酵母双杂交技术筛选拟南芥c DNA文库,对得到的序列进行BLAST比对、亚细胞定位分析和基因本体注释。【结果】共有221个阳性克隆,测序后通过BL...
【目的】筛选拟南芥中NBS1的互作蛋白,探究NBS1蛋白的新功能,为后续研究奠定基础。【方法】利用酵母双杂交技术筛选拟南芥c DNA文库,对得到的序列进行BLAST比对、亚细胞定位分析和基因本体注释。【结果】共有221个阳性克隆,测序后通过BLAST比对得到97个与NBS1互作的蛋白,包括膜蛋白、转运蛋白和折叠蛋白等,它们主要定位于细胞质、细胞核和叶绿体等,主要富集于4个分子功能、5个细胞组分和13个生物过程。【结论】拟南芥中与NBS1互作的蛋白在刺激响应、信号转导和细胞代谢等方面发挥着重要作用,也证明NBS1是一种多功能蛋白,但其功能及分子机制还需进一步研究。
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关键词
拟南芥
NBS1
蛋白互作
酵母双杂交
基因本体注释
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职称材料
题名
拟南芥NBS1互作蛋白的筛选和鉴定
1
作者
吴钒漳
孙旭东
徐慧妮
机构
昆明理工大学生命科学与技术学院
中国科学院昆明植物研究所
出处
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2023年第4期558-565,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31760582)。
文摘
【目的】筛选拟南芥中NBS1的互作蛋白,探究NBS1蛋白的新功能,为后续研究奠定基础。【方法】利用酵母双杂交技术筛选拟南芥c DNA文库,对得到的序列进行BLAST比对、亚细胞定位分析和基因本体注释。【结果】共有221个阳性克隆,测序后通过BLAST比对得到97个与NBS1互作的蛋白,包括膜蛋白、转运蛋白和折叠蛋白等,它们主要定位于细胞质、细胞核和叶绿体等,主要富集于4个分子功能、5个细胞组分和13个生物过程。【结论】拟南芥中与NBS1互作的蛋白在刺激响应、信号转导和细胞代谢等方面发挥着重要作用,也证明NBS1是一种多功能蛋白,但其功能及分子机制还需进一步研究。
关键词
拟南芥
NBS1
蛋白互作
酵母双杂交
基因本体注释
Keywords
Arabidopsis thaliana
NBS1
protein interaction
yeast two-hybrid
gene ontology
分类号
Q949.748.306 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
拟南芥NBS1互作蛋白的筛选和鉴定
吴钒漳
孙旭东
徐慧妮
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2023
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