基于网络药理学探讨西黄丸治疗肝癌的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨西黄丸治疗肝癌的潜在作用机制。方法 利用TCMSP、化学专业数据库及SwissTargetPrediction数据库获取西黄丸的活性成分及靶点;从GeneCards、NCBI、DisGeNET及CTD数据库收集肝癌相关靶点,并与活性成分靶点取交集;采用STRING平台和Cytoscape软件构建靶点相互作用网络,并借助DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析;利用CB-Dock分子对接工具将活性成分与关键靶点进行分子对接。结果 共筛选出205个活性成分和324个与肝癌治疗相关的潜在靶点,其中包括AR、CYP19A1、ESR1等61个关键靶点;GO和KEGG富集分析发现关键靶点参与凋亡过程的负调控、蛋白质磷酸化、细胞增殖的正调控等生物过程,调控HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路等114条信号通路。分子对接结果显示没药甾醇I、洋椿苦素、白藜芦醇等活性成分与关键靶点之间均有较强的结合力。结论 西黄丸通过多成分、多靶点、多通路调控肝癌细胞的增殖、侵袭、迁移与凋亡,从而抑制肝癌的发生和发展。

基于网络药理学和生物信息学探究西黄丸治疗肝癌作用机制

目的 通过网络药理学和生物信息学方法探究西黄丸治疗肝癌的潜在作用机制。方法 利用TCMSP、化学专业数据库和SwissADME数据库筛选西黄丸活性成分,通过SwissTargetPrediction数据库预测活性成分对应靶点,GEPIA数据库分析靶点基因在肝癌组织与正常组织的表达差异,通过DAVID数据库对差异表达基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,借助STRING和Cytoscape3.9.0软件构建靶点蛋白相互作用网络,并筛选核心靶点;采用Kaplan-Meier Plotter数据库分析核心基因与肝癌患者预后的相关性,运用CB-Dock工具进行分子对接验证。结果 共筛选得到194个活性成分,147个差异表达靶点基因(上调靶点基因89个、下调靶点基因58个)。GO功能分析得到生物过程19个、细胞组分13个、分子功能16个。KEGG通路富集得到9条信号通路,主要涉及调控细胞周期、孕酮介导的卵母细胞成熟、细胞色素P450对外源性药物代谢、视黄醇代谢等。靶点蛋白相互作用网络及生存分析得到MAPK3、CDK1、PLK1等8个与肝癌患者预后密切相关的核心靶点基因。分子对接结果显示,洋椿苦素、桑色素、辛酸丁酯等活性成分与8个预后相关核心靶点具有较强的结合力。结论 西黄丸中的活性成分可通过作用于MAPK3、CDK1、PLK1等肝癌预后相关靶点调节多条信号通路,发挥治疗肝癌及延长肝癌患者生存期的作用。