不同种植年限薰衣草根际土壤真菌群落结构的演变

土壤真菌群落结构和多样性对植物生长起着重要作用,了解种植年限对薰衣草根际土壤真菌群落结构的影响对薰衣草病害防治和增产的研究具有重要意义。探究不同种植年限薰衣草根际土壤真菌群落结构和多样性特征,及其随种植年限的演变规律。采集新疆伊犁霍城县种植年限1、3、5 a,以及未种植薰衣草土壤,对ITS序列进行Illumina高通量测序。对测序结果进行分析,比较各样品组真菌多样性和群落分布规律及与种植年限的关联。结果表明,Alpha多样性分析显示随着种植年限的增加Shannon指数逐渐降低,而Chao1指数先降低后增高。在种植薰衣草土壤中共检测到12个门,28个纲,72个目,146个科,236个属。在门水平上,子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、球囊菌门(Glomeromycota)为优势菌门。随着种植年限的增加,子囊菌门相对丰度逐渐降低,担子菌门逐渐增高,而球囊菌门先增加后降低。在属水平上优势菌属为Xylodon、锐孔菌属(Oxyporus)、镰刀菌属(Fusarium)、枝孢属(Cladosporium),均属于植物致病菌。随着种植年限的增加,Xylodon相对丰度增加,而锐孔菌属、镰刀菌属、枝孢属先增加后降低。丛枝菌根菌(AMF)中第一优势属球囊霉属(Glomus)OTU数量随种植年限的增加逐渐减少。薰衣草连作种植造成根际土壤真菌群落结构和多样性改变,致病菌增加,AMF降低。本研究为薰衣草病虫害防治和增产提供理论依据,为薰衣草土壤科学管理提供参考。

健康与致病菌感染双峰驼肠道细菌和真菌群落的比较分析

文章利用高通量测序技术,分析4只新疆巴里坤县成年双峰驼粪便样本的细菌及真菌菌群多样性和结构组成,反映致病菌感染双峰驼肠道菌群特点及肠道菌群失衡与双峰驼健康的关系,并在细菌和真菌水平进行基因功能预测。结果表明,CG.101、CG.103和CG.104三个样本的微生物群落结构特征没有显著差异(P>0.05),例如细菌群落门、科、属水平上最大的分类类群均为:厚壁菌门、瘤胃球菌科、拟杆菌属;真菌优势门均为子囊菌门和担子菌门。与以上三个样本相比,CG.102样本微生物多样性和有益菌相对丰度均较低,条件致病菌、致病菌相对丰度较高。在细菌门水平上CG.102样本中厚壁菌门和拟杆菌门相对丰度较低,而变形菌门和放线菌门相对丰度较高;在细菌科水平上,阿克曼菌科、瘤胃球菌科、克里斯腾森菌科、理研菌科等相对丰度非常低;在细菌属水平上,阿克曼菌属、拟杆菌属、瘤胃球菌属、芽孢杆菌属相对丰度低于其他三个样本;在种水平上,该样本中检测出占比很高的绿脓杆菌和洛菲不动杆菌。CG.102样本真菌群落以单一的子囊菌门,囊菌科,丝胞菌属,多育赛多孢子菌为主。基因功能的预测说明CG.102骆驼免疫力下降并感染疾病。

天山雪莲内生菌抗菌活性物质分析

目的分析天山雪莲内生菌中的抗菌活性物质。方法采用传统平板培养法从雪莲叶片、花、茎等部位分离内生真菌,用乙酸乙酯萃取和浓缩其PDB培养基,将得到的发酵萃取物用于抑菌测试。结果 N4菌株能够生产对4种主要指示菌株,即大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、枯草芽孢杆菌和白色念珠菌均有抑制作用的活性物质。ITS序列和形态特征分析显示N4和N7菌株分别为Eurotium tonophilum和Talaromyces stollii。结论 N4和N7菌株能产抗菌活性物质,N4菌株抗性活性物质抑菌谱较广,其次级代谢产物值得进行深入研究。

基于高通量测序技术马肠道菌群研究进展

马肠道非常发达,其中定居着丰富又复杂的微生物菌群,这些微生物在宿主的生理、代谢、营养和免疫功能等方面有着重要作用。基于高通量测序的宏基因组学技术和分析手段的改进,对复杂环境中微生物的研究更加方便、透彻。本文就基于高通量测序的宏基因组技术在马肠道核心菌群、不同肠道段菌群结构、不同因素对肠道菌群结构的影响,以及马肠道微生物与疾病的关系等几个方面的研究进行了梳理和综述,以期了解马肠道微生物的结构和组成模式,为今后马肠道微生物相关研究提供参考。

昭苏县野生羊肚菌根际土壤细菌多样性研究

采集昭苏县野生羊肚菌(Morchella esculenta)根际水平直径10 cm、深度0~30 cm范围内的3层各10 cm土壤样品,利用Illumina miseq 2×300 bp高通量测序技术和生物信息学分析方法检测细菌类群的多样性。结果显示,细菌群落Chao和Shannon指数在0~30 cm土层中的平均值分别为152和3.68,且两种指数在10~20 cm土层均最高;细菌群落在各分类水平上的类群(最大类群丰度)分别为变形菌门(Proteobacteria,36.3%)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)等13门;黄杆菌科(Flavobacteriaceae,8.4%)、芽胞杆菌科(Bacillaceae)和葡萄球菌科(Staphylococcaceae)等43科;葡萄球菌属(Staphylococcus,7.1%)、杆状菌属(Bacillus)和Cloacibacterium等52属;不能培养的α-变形杆菌(unculturedα-proteobacterium,2.0%)、不能培养的嗜甲基菌科1种(uncultured Methylophilaceae bacterium)和路西法芽胞杆菌(Bacillus luciferensis)等44种。检测到固氮菌32属,包括15属自生固氮菌、9属共生固氮菌和8属联合固氮菌。结果表明,羊肚菌土壤根际微生物样品中细菌类群具有多样性,10~20 cm土层根际微生物多样性较高,但很多种类丰度较低;该土样含有丰富的固氮菌,这对栽培羊肚菌如何选地或覆土具有一定的指导意义。

不同年龄成年伊犁马粪便真菌群落结构的分析

为探究伊犁马肠道真菌菌群结构,本研究采用高通量测序分析不同年龄成年马新鲜粪便中真菌的多样性。结果表明:真菌群落Chao1指数和Shannon指数平均值在6岁马粪便最高,分别为137.50和2.62,而在12岁马粪便中最低,分别为94.20和1.05。四组样品中真菌群落主要属于4个门,分别为Ascomycota、Basidiomycota、Neocallimastigomycota、Mucoromycota;47个科,包括Cryptococcaceae、Pichiaceae、Neocallimastigaceae、Sporormiaceae、Aspergillaceae等优势菌;56个属,包括Cryptococcus、Pichia、Neocallimastix等优势菌。随着成年伊犁马年龄的增长,其粪便中真菌菌群的数量和优势菌相对丰度均发生变化,比如,优势菌门Ascomycota相对丰度随年龄的增加显著降低;Basidiomycota相对丰度在6岁马粪便中最高,并开始随年龄增加逐渐减少;4岁马粪便中的Neocallimastigomycota明显高于其他年龄马,说明成年伊犁马肠道真菌群落结构受不同生长发育阶段的影响,发生相应的变化。

创新能力培养视域下的微生物学实验教学研究

实验课程是微生物学课程教学的重要构成部分,是培养学生实验能力,提升学生的从事科研工作的素养的重要途径。本文从创新能力培养的视角出发,以促进消化吸收理论知识、缩短知识与实践之间的距离、提升学生的科学素养、培养学生创新能力等为目的,对高校大学生微生物学实验教学的具体路径进行探索。

新疆伊犁野生阿魏菇菌株的分离鉴定与培养特性

对采自新疆伊犁的两种具有不同形态特征的野生阿魏菇(Pleurotus ferulae)子实体分离的菌株进行鉴定和系统发育分析,并探讨优良菌株的培养特性。结合子实体形态和生境特征,利用rDNA-ITS序列,对伊犁野生阿魏菇菌株YL-A1和YL-A2进行分子鉴定及系统发育分析。对阿魏菇菌株YL-A1生长温度、pH、碳源、氮源和无机盐进行单因素试验,分析各因素对菌丝生长的影响,通过L_(9)(3^(4))正交试验,筛选各因子之间的最优组合。结果表明,野生阿魏菇菌株YL-A1(ITS序列GenBank登录号:MN460317)和YL-A2(ITS序列GenBank登录号:MN809132),不仅子实体形态特征有差异,且菌株YL-A1菌丝生长速度和长势优于YL-A2,并相互拮抗。结合生境和形态特征及rDNA ITS序列分析,将二者鉴定为阿魏菇(Pleurotus eryngii var.ferulae)。系统发育分析发现,菌株YL-A1和YL-A2单独聚为一组,与其他阿魏菇菌株有一定的遗传距离。经单因素和正交试验,确定了菌株YL-A1在含葡萄糖20 g/L、蛋白胨4 g/L、KH_(2)PO_(4)1 g/L,pH 7.5的培养基中,25℃培养,菌丝生长状态最佳,确定了优良菌株YL-A1菌丝生长最佳培养条件。为进一步保护利用伊犁野生阿魏菇菌种资源提供参考。

依托科研课题提高生物科学专业本科毕业论文质量的研究

毕业论文是培养高校学生专业综合素质的重要实践教学环节。通过分析本科生毕业设计中存在的主要问题,对其改革进行了初步研究,并提出了以完善毕业论文教学大纲、明确教学目标、加强毕业论文过程管理、建立完善的毕业论文质量控制体系和合理的激励约束机制为内容的改革模式,为提高高校毕业设计质量提供一定的改革思路和依据。

地方特色资源融入微生物学研究型实验教学改革

在新疆伊犁河谷,具有应用价值的地方特色微生物资源非常丰富,本文借此开展了微生物学研究型实验教学的改革实践,具体措施为:开发利用了地方特色实验材料、实验教学内容及相应的教学策略等,教学效果问卷调查显示这些举措有利于培养学生的创新能力和科研能力。

新疆伊犁野生阿魏菇的生长发育规律及生境分析

为了更好地保护和利用伊犁野生阿魏菇资源,于2017-2019年采用踏查及实地样方取样和实验室数据测定相结合的方法,对伊犁野生阿魏菇资源的生长发育规律和生境特征进行了研究。结果表明:伊犁野生阿魏菇是一种分布在伊宁县新疆阿魏原生境保护区内的中低温型食、药兼用菌。生长最适温度为15℃-20℃。发生区土壤偏碱性,且含水率只有1.56%-9.87%,有机质含量在0.9%-1.76%,速效氮含量在32.53-42.60mg/kg,速效磷的含量在3.84-4.28mg/kg,均比较缺乏,速效钾含量比较丰富,在158.67-162.92mg/kg之间。土壤中所含的细菌数量为10^(6)个/g,放线菌为10^(5)个/g,真菌为10^(3)个/g。这种恶劣的生存环境加之人为破坏,致使阿魏菇分布面积急剧缩小,需采取积极措施进行保护。