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基于GEO和TCGA联合分析SULF1对胃癌总体生存率的影响
被引量:
3
1
作者
王佳敏
初冬美
+4 位作者
张家铜
员瑜
赵滢
孙威
张天彪
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期865-869,共5页
目的应用基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库联合分析硫酸酯酶1(SULF1)在胃癌组织中的表达情况及其对胃癌总体生存率(OS)的影响,探索SULF1表达与胃癌患者OS的相关性。方法从GEO数据库选取胃癌数据集进行差异表达基因(DEG...
目的应用基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库联合分析硫酸酯酶1(SULF1)在胃癌组织中的表达情况及其对胃癌总体生存率(OS)的影响,探索SULF1表达与胃癌患者OS的相关性。方法从GEO数据库选取胃癌数据集进行差异表达基因(DEG)分析,使用数据集TCGA-STAD验证SULF1在胃癌组织中表达情况,cBioPortal数据库分析胃癌中SULF1基因的突变情况。单因素和多因素Cox回归分析SULF1与胃癌OS的关系。列线图验证SULF1对胃癌预后的影响。受试者操作特征曲线(ROC)分析SULF1表达对胃癌诊断的价值。结果GEO和TCGA数据集分析发现SULF1在胃癌组织中表达上调(P<0.001),胃癌中存在SULF1基因突变的情况。胃癌的发病、发展与年龄、肿瘤分期、SULF1基因表达有关,SULF1基因高表达与不良预后相关。SULF1基因表达是胃癌患者OS的一个独立预后标志物,SULF1高表达的胃癌患者OS相对较差(P<0.05)。SULF1表达对胃癌有较好的诊断价值。结论SULF1在胃癌中呈高表达,且与不良预后相关,可作为胃癌诊断和治疗的潜在靶点。
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关键词
基因表达数据库
癌症基因组图谱
硫酸酯酶1
胃癌
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职称材料
基于纳米压痕技术研究药物对胃肠道间质瘤细胞机械特性的影响
2
作者
王文思
员瑜
+4 位作者
王佳敏
施佳林
蹇林格
赵滢
张天彪
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期1057-1062,共6页
目的研究伊马替尼和舒尼替尼对原代培养胃肠道间质瘤(GIST)细胞的增殖抑制作用,分析二者单独和联合用药对GIST细胞机械性能的影响。方法取人GIST组织进行体外原代培养,采用CCK-8实验检测不同浓度伊马替尼和舒尼替尼干预对GIST细胞的作...
目的研究伊马替尼和舒尼替尼对原代培养胃肠道间质瘤(GIST)细胞的增殖抑制作用,分析二者单独和联合用药对GIST细胞机械性能的影响。方法取人GIST组织进行体外原代培养,采用CCK-8实验检测不同浓度伊马替尼和舒尼替尼干预对GIST细胞的作用。应用原子力显微镜检测药物对原代培养的GIST细胞杨氏模量的影响。结果从获取的瘤组织成功培养了c-kit基因11号外显子V559D点突变的GIST细胞。CCK-8实验显示,伊马替尼和舒尼替尼对GIST细胞有增殖抑制作用,作用呈时间与剂量依赖性,联合用药时表现为协同作用。伊马替尼和舒尼替尼均降低了GIST细胞的杨氏模量,联合用药时机械性能改变更明显。结论伊马替尼和舒尼替尼可以有效抑制原代培养的GIST细胞增殖,并改变细胞机械特性。
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关键词
胃肠道间质瘤
原子力显微镜
伊马替尼
舒尼替尼
杨氏模量
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职称材料
题名
基于GEO和TCGA联合分析SULF1对胃癌总体生存率的影响
被引量:
3
1
作者
王佳敏
初冬美
张家铜
员瑜
赵滢
孙威
张天彪
机构
中国医科大学生命科学学院生物化学与分子生物学教研室
中国医科大学临床一系
中国医科大学附属盛京医院普通外科
出处
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期865-869,共5页
基金
国家自然科学基金(61973316)
辽宁省自然科学基金(20170540986)。
文摘
目的应用基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库联合分析硫酸酯酶1(SULF1)在胃癌组织中的表达情况及其对胃癌总体生存率(OS)的影响,探索SULF1表达与胃癌患者OS的相关性。方法从GEO数据库选取胃癌数据集进行差异表达基因(DEG)分析,使用数据集TCGA-STAD验证SULF1在胃癌组织中表达情况,cBioPortal数据库分析胃癌中SULF1基因的突变情况。单因素和多因素Cox回归分析SULF1与胃癌OS的关系。列线图验证SULF1对胃癌预后的影响。受试者操作特征曲线(ROC)分析SULF1表达对胃癌诊断的价值。结果GEO和TCGA数据集分析发现SULF1在胃癌组织中表达上调(P<0.001),胃癌中存在SULF1基因突变的情况。胃癌的发病、发展与年龄、肿瘤分期、SULF1基因表达有关,SULF1基因高表达与不良预后相关。SULF1基因表达是胃癌患者OS的一个独立预后标志物,SULF1高表达的胃癌患者OS相对较差(P<0.05)。SULF1表达对胃癌有较好的诊断价值。结论SULF1在胃癌中呈高表达,且与不良预后相关,可作为胃癌诊断和治疗的潜在靶点。
关键词
基因表达数据库
癌症基因组图谱
硫酸酯酶1
胃癌
Keywords
Gene Expression Omnibus
The Cancer Genome Atlas
sulfatase 1
gastric cancer
分类号
R730 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
基于纳米压痕技术研究药物对胃肠道间质瘤细胞机械特性的影响
2
作者
王文思
员瑜
王佳敏
施佳林
蹇林格
赵滢
张天彪
机构
中国医科大学生命科学学院生物化学与分子生物学教研室
中国科学院沈阳自动化研究所机器人研究室
四川大学华西临床医学院
中国医科大学附属盛京医院胃肠营养外科
出处
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期1057-1062,共6页
基金
国家自然科学基金(61973316)。
文摘
目的研究伊马替尼和舒尼替尼对原代培养胃肠道间质瘤(GIST)细胞的增殖抑制作用,分析二者单独和联合用药对GIST细胞机械性能的影响。方法取人GIST组织进行体外原代培养,采用CCK-8实验检测不同浓度伊马替尼和舒尼替尼干预对GIST细胞的作用。应用原子力显微镜检测药物对原代培养的GIST细胞杨氏模量的影响。结果从获取的瘤组织成功培养了c-kit基因11号外显子V559D点突变的GIST细胞。CCK-8实验显示,伊马替尼和舒尼替尼对GIST细胞有增殖抑制作用,作用呈时间与剂量依赖性,联合用药时表现为协同作用。伊马替尼和舒尼替尼均降低了GIST细胞的杨氏模量,联合用药时机械性能改变更明显。结论伊马替尼和舒尼替尼可以有效抑制原代培养的GIST细胞增殖,并改变细胞机械特性。
关键词
胃肠道间质瘤
原子力显微镜
伊马替尼
舒尼替尼
杨氏模量
Keywords
gastrointestinal stromal tumor
atomic force microsscope
imatinib
sunitinib
Young’s modulus
分类号
R735 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于GEO和TCGA联合分析SULF1对胃癌总体生存率的影响
王佳敏
初冬美
张家铜
员瑜
赵滢
孙威
张天彪
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
下载PDF
职称材料
2
基于纳米压痕技术研究药物对胃肠道间质瘤细胞机械特性的影响
王文思
员瑜
王佳敏
施佳林
蹇林格
赵滢
张天彪
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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职称材料
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