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扶桑绵粉蚧转录组分析 被引量:16
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作者 胡俊杰 孟翔 +3 位作者 周佳滨 杨陆兴 刘善海 李润钊 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期9-17,共9页
【目的】建立扶桑绵粉蚧Phenacoccus solenopsis Tinsley的转录组数据库,揭示扶桑绵粉蚧转录组的整体表达特征。【方法】采用Illumina Hi SeqTM40`00测序平台开展对扶桑绵粉蚧雌成虫转录组测定,对原始数据进行过滤和组装。【结果】共获... 【目的】建立扶桑绵粉蚧Phenacoccus solenopsis Tinsley的转录组数据库,揭示扶桑绵粉蚧转录组的整体表达特征。【方法】采用Illumina Hi SeqTM40`00测序平台开展对扶桑绵粉蚧雌成虫转录组测定,对原始数据进行过滤和组装。【结果】共获得58 322 258条序列读取片段(reads),共9.48 Gb(Gen Bank登录号:SAMN06130426)57 422 032条有效转录组数据。进一步组装拼接后,共获得94 475个单基因簇(unigene),平均长度为700 bp。将unigene与数据库中的序列进行BLASTX比对,成功注释20 949个unigenes,其中,Nr注释的unigenes与豌豆蚜Acyrthosiphon pisum unigenes同源性最高,达18.69%。扶桑绵粉蚧转录组unigenes根据GO功能注释大致可分为细胞组分、分子功能和生物过程三大类55个分支,与结合活性、催化活性、细胞进程和代谢进程相关的unigenes较多。此外,本研究还筛选到20条与脂类代谢相关的途径和与性信息素代谢相关的序列。并通过与Nr和Swiss-prot蛋白质数据库比对,获得了15 037条编码序列(CDS)片段。【结论】本研究初步阐明扶桑绵粉蚧雌成虫转录组的整体表达模式,为进一步研究扶桑绵粉蚧的基因功能及性信息素的代谢途径奠定了基础。 展开更多
关键词 扶桑绵粉蚧 转录组 基因注释 GO数据库 编码序列 性信息素
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广东云开山国家级自然保护区鸟兽红外相机调查初报 被引量:6
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作者 李林妙 池辉云 +12 位作者 万雅琼 周佳滨 张礼标 何向阳 黄文忠 张伯军 徐湛荣 刘昌传 赖任燕 朱秀芳 李友余 李佳琦 陈金平 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1154-1159,共6页
2017年1月至2019年9月,我们在广东云开山国家级自然保护区3个观测样区布设61台红外相机,对兽类和鸟类多样性进行调查。共记录到野生兽类4目7科9种,鸟类6目14科34种,其中广东省新记录1种,为蓝绿鹊(Cissa chinensis),记录国家II级重点保... 2017年1月至2019年9月,我们在广东云开山国家级自然保护区3个观测样区布设61台红外相机,对兽类和鸟类多样性进行调查。共记录到野生兽类4目7科9种,鸟类6目14科34种,其中广东省新记录1种,为蓝绿鹊(Cissa chinensis),记录国家II级重点保护动物3种,为原鸡(Gallus gallus)、白鹇(Lophura nycthemera)和蓝绿鹊。相对多度较高的5种兽类依次为赤腹松鼠(Callosciurus erythraeus)、赤麂(Muntiacus vaginalis)、鼬獾(Melogale moschata)、野猪(Sus scrofa)和果子狸(Paguma larvata),相对多度较高的3种鸟类分别是紫啸鸫(Myiophoneus caeruleus)、虎斑地鸫(Zoothera dauma)和红嘴相思鸟(Leiothrix lutea)。通过对相对多度指数前三的鸟兽日活动节律观察分析,共发现4种典型昼行性动物(赤腹松鼠、紫啸鸫、虎斑地鸫和红嘴相思鸟)和1种典型夜行性动物(鼬獾)。赤麂日活动呈现两个高峰时段,分别为12:00–14:00和18:00–20:00。本研究评估了广东云开山国家级自然保护区部分兽类和鸟类资源现状,为保护区野生动物保护与管理提供了数据支持。 展开更多
关键词 兽类 鸟类 物种多样性 红外相机监测 云开山国家级自然保护区
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