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扶桑绵粉蚧转录组分析
被引量:
16
1
作者
胡俊杰
孟翔
+3 位作者
周佳滨
杨陆兴
刘善海
李润钊
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期9-17,共9页
【目的】建立扶桑绵粉蚧Phenacoccus solenopsis Tinsley的转录组数据库,揭示扶桑绵粉蚧转录组的整体表达特征。【方法】采用Illumina Hi SeqTM40`00测序平台开展对扶桑绵粉蚧雌成虫转录组测定,对原始数据进行过滤和组装。【结果】共获...
【目的】建立扶桑绵粉蚧Phenacoccus solenopsis Tinsley的转录组数据库,揭示扶桑绵粉蚧转录组的整体表达特征。【方法】采用Illumina Hi SeqTM40`00测序平台开展对扶桑绵粉蚧雌成虫转录组测定,对原始数据进行过滤和组装。【结果】共获得58 322 258条序列读取片段(reads),共9.48 Gb(Gen Bank登录号:SAMN06130426)57 422 032条有效转录组数据。进一步组装拼接后,共获得94 475个单基因簇(unigene),平均长度为700 bp。将unigene与数据库中的序列进行BLASTX比对,成功注释20 949个unigenes,其中,Nr注释的unigenes与豌豆蚜Acyrthosiphon pisum unigenes同源性最高,达18.69%。扶桑绵粉蚧转录组unigenes根据GO功能注释大致可分为细胞组分、分子功能和生物过程三大类55个分支,与结合活性、催化活性、细胞进程和代谢进程相关的unigenes较多。此外,本研究还筛选到20条与脂类代谢相关的途径和与性信息素代谢相关的序列。并通过与Nr和Swiss-prot蛋白质数据库比对,获得了15 037条编码序列(CDS)片段。【结论】本研究初步阐明扶桑绵粉蚧雌成虫转录组的整体表达模式,为进一步研究扶桑绵粉蚧的基因功能及性信息素的代谢途径奠定了基础。
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关键词
扶桑绵粉蚧
转录组
基因注释
GO数据库
编码序列
性信息素
下载PDF
职称材料
广东云开山国家级自然保护区鸟兽红外相机调查初报
被引量:
6
2
作者
李林妙
池辉云
+12 位作者
万雅琼
周佳滨
张礼标
何向阳
黄文忠
张伯军
徐湛荣
刘昌传
赖任燕
朱秀芳
李友余
李佳琦
陈金平
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期1154-1159,共6页
2017年1月至2019年9月,我们在广东云开山国家级自然保护区3个观测样区布设61台红外相机,对兽类和鸟类多样性进行调查。共记录到野生兽类4目7科9种,鸟类6目14科34种,其中广东省新记录1种,为蓝绿鹊(Cissa chinensis),记录国家II级重点保...
2017年1月至2019年9月,我们在广东云开山国家级自然保护区3个观测样区布设61台红外相机,对兽类和鸟类多样性进行调查。共记录到野生兽类4目7科9种,鸟类6目14科34种,其中广东省新记录1种,为蓝绿鹊(Cissa chinensis),记录国家II级重点保护动物3种,为原鸡(Gallus gallus)、白鹇(Lophura nycthemera)和蓝绿鹊。相对多度较高的5种兽类依次为赤腹松鼠(Callosciurus erythraeus)、赤麂(Muntiacus vaginalis)、鼬獾(Melogale moschata)、野猪(Sus scrofa)和果子狸(Paguma larvata),相对多度较高的3种鸟类分别是紫啸鸫(Myiophoneus caeruleus)、虎斑地鸫(Zoothera dauma)和红嘴相思鸟(Leiothrix lutea)。通过对相对多度指数前三的鸟兽日活动节律观察分析,共发现4种典型昼行性动物(赤腹松鼠、紫啸鸫、虎斑地鸫和红嘴相思鸟)和1种典型夜行性动物(鼬獾)。赤麂日活动呈现两个高峰时段,分别为12:00–14:00和18:00–20:00。本研究评估了广东云开山国家级自然保护区部分兽类和鸟类资源现状,为保护区野生动物保护与管理提供了数据支持。
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关键词
兽类
鸟类
物种多样性
红外相机监测
云开山国家级自然保护区
原文传递
题名
扶桑绵粉蚧转录组分析
被引量:
16
1
作者
胡俊杰
孟翔
周佳滨
杨陆兴
刘善海
李润钊
机构
广州大学生命科学学院
广东省生物资源与应用研究所
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期9-17,共9页
基金
广州市属高校科技计划项目(1201430778)
2016年度广州大学大学生创新训练项目(201611078064)
文摘
【目的】建立扶桑绵粉蚧Phenacoccus solenopsis Tinsley的转录组数据库,揭示扶桑绵粉蚧转录组的整体表达特征。【方法】采用Illumina Hi SeqTM40`00测序平台开展对扶桑绵粉蚧雌成虫转录组测定,对原始数据进行过滤和组装。【结果】共获得58 322 258条序列读取片段(reads),共9.48 Gb(Gen Bank登录号:SAMN06130426)57 422 032条有效转录组数据。进一步组装拼接后,共获得94 475个单基因簇(unigene),平均长度为700 bp。将unigene与数据库中的序列进行BLASTX比对,成功注释20 949个unigenes,其中,Nr注释的unigenes与豌豆蚜Acyrthosiphon pisum unigenes同源性最高,达18.69%。扶桑绵粉蚧转录组unigenes根据GO功能注释大致可分为细胞组分、分子功能和生物过程三大类55个分支,与结合活性、催化活性、细胞进程和代谢进程相关的unigenes较多。此外,本研究还筛选到20条与脂类代谢相关的途径和与性信息素代谢相关的序列。并通过与Nr和Swiss-prot蛋白质数据库比对,获得了15 037条编码序列(CDS)片段。【结论】本研究初步阐明扶桑绵粉蚧雌成虫转录组的整体表达模式,为进一步研究扶桑绵粉蚧的基因功能及性信息素的代谢途径奠定了基础。
关键词
扶桑绵粉蚧
转录组
基因注释
GO数据库
编码序列
性信息素
Keywords
Phenacoccus solenopsis
transcriptome
gene annotation
Gene Ontology(GO) database
coding sequence(CDS)
sex pheromone
分类号
Q966 [生物学—昆虫学]
下载PDF
职称材料
题名
广东云开山国家级自然保护区鸟兽红外相机调查初报
被引量:
6
2
作者
李林妙
池辉云
万雅琼
周佳滨
张礼标
何向阳
黄文忠
张伯军
徐湛荣
刘昌传
赖任燕
朱秀芳
李友余
李佳琦
陈金平
机构
广东省科学院动物研究所/广东省动物保护与资源利用重点实验室/广东省野生动物保护与利用公共实验室
广东云开山省级自然保护区管理处
生态环境部南京环境科学研究所
出处
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期1154-1159,共6页
基金
生态环境部生物多样性保护专项(2110404)
广东省科学院科技发展专项(2018GDASCX-0107)
文摘
2017年1月至2019年9月,我们在广东云开山国家级自然保护区3个观测样区布设61台红外相机,对兽类和鸟类多样性进行调查。共记录到野生兽类4目7科9种,鸟类6目14科34种,其中广东省新记录1种,为蓝绿鹊(Cissa chinensis),记录国家II级重点保护动物3种,为原鸡(Gallus gallus)、白鹇(Lophura nycthemera)和蓝绿鹊。相对多度较高的5种兽类依次为赤腹松鼠(Callosciurus erythraeus)、赤麂(Muntiacus vaginalis)、鼬獾(Melogale moschata)、野猪(Sus scrofa)和果子狸(Paguma larvata),相对多度较高的3种鸟类分别是紫啸鸫(Myiophoneus caeruleus)、虎斑地鸫(Zoothera dauma)和红嘴相思鸟(Leiothrix lutea)。通过对相对多度指数前三的鸟兽日活动节律观察分析,共发现4种典型昼行性动物(赤腹松鼠、紫啸鸫、虎斑地鸫和红嘴相思鸟)和1种典型夜行性动物(鼬獾)。赤麂日活动呈现两个高峰时段,分别为12:00–14:00和18:00–20:00。本研究评估了广东云开山国家级自然保护区部分兽类和鸟类资源现状,为保护区野生动物保护与管理提供了数据支持。
关键词
兽类
鸟类
物种多样性
红外相机监测
云开山国家级自然保护区
Keywords
mammals
birds
species diversity
camera-trapping
Yunkaishan National Nature Reserve
分类号
Q958.1 [生物学—动物学]
TN219 [电子电信—物理电子学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
扶桑绵粉蚧转录组分析
胡俊杰
孟翔
周佳滨
杨陆兴
刘善海
李润钊
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
16
下载PDF
职称材料
2
广东云开山国家级自然保护区鸟兽红外相机调查初报
李林妙
池辉云
万雅琼
周佳滨
张礼标
何向阳
黄文忠
张伯军
徐湛荣
刘昌传
赖任燕
朱秀芳
李友余
李佳琦
陈金平
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2020
6
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