目的运用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)技术,分析吉林地区2014~2018年食源性疾病患者粪便样本中分离的肠炎沙门菌(Salmonella enteritidis)的同源性及分子流行病学特征,为鉴定溯源及防控预警提供数据支持。方...目的运用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)技术,分析吉林地区2014~2018年食源性疾病患者粪便样本中分离的肠炎沙门菌(Salmonella enteritidis)的同源性及分子流行病学特征,为鉴定溯源及防控预警提供数据支持。方法对吉林地区2014~2018年食源性疾病患者1 000份粪便样本中分离的肠炎沙门菌进行鉴定,确定血清型及PFGE分子分型,采用Bio Numerics version 6. 6软件对PFGE图谱进行数据分析,绘制聚类树状图。结果分离出符合O(1,9,12):H(g,m)的肠炎沙门菌51株,检出率为5. 1%;经聚类分析,带型相似度为51. 3%~100%,共获得12种带型,其中,PS3与PS4型菌株带型相似度为93. 7%,为近年主要流行菌株,且菌株同源性较高。结论吉林地区肠炎沙门菌PFGE型别具有多样性和复杂性,具有优势克隆系。展开更多
目的分析引起吉林省2009年手足口病(Hand,Footand Mouth Disease,HFMD)流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus Group A Type16,CVA16)VP1编码区的基因特征。方法 对2009年分离于吉林省部分HFMD来源的15株CVA16分离株的VP1编码区基因...目的分析引起吉林省2009年手足口病(Hand,Footand Mouth Disease,HFMD)流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus Group A Type16,CVA16)VP1编码区的基因特征。方法 对2009年分离于吉林省部分HFMD来源的15株CVA16分离株的VP1编码区基因,进行逆转录-聚合酶链反应扩增,并对扩增产物进行序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件对VP1编码区基因进行基因遗传进化及同源性分析。结果吉林省2009年15株CVA16分离株有86.7%(13/15)属于B1a基因亚型,13.3%(2/15)属于B1b基因亚型,并且15株分离株分属于3个相对独立的传播链(Clade1~3),分别由11株、2株、2株组成。3个传播链各自的组内核苷酸和氨基酸同源性均较高,其中较大优势传播链(Clade1)的核苷酸和氨基酸同源性均高达98.2%~100.0%,两个较小传播链均高达100%。结论吉林省2009年监测到至少有2个基因亚型、3个传播链的CVA16引起的HFMD流行,并且呈现以1个B1a基因亚型的优势传播链为主,其他2个小传播链为辅的传播模式。无论是优势传播链还是小传播链,均各自呈现密切的亲缘关系。展开更多
文摘目的运用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)技术,分析吉林地区2014~2018年食源性疾病患者粪便样本中分离的肠炎沙门菌(Salmonella enteritidis)的同源性及分子流行病学特征,为鉴定溯源及防控预警提供数据支持。方法对吉林地区2014~2018年食源性疾病患者1 000份粪便样本中分离的肠炎沙门菌进行鉴定,确定血清型及PFGE分子分型,采用Bio Numerics version 6. 6软件对PFGE图谱进行数据分析,绘制聚类树状图。结果分离出符合O(1,9,12):H(g,m)的肠炎沙门菌51株,检出率为5. 1%;经聚类分析,带型相似度为51. 3%~100%,共获得12种带型,其中,PS3与PS4型菌株带型相似度为93. 7%,为近年主要流行菌株,且菌株同源性较高。结论吉林地区肠炎沙门菌PFGE型别具有多样性和复杂性,具有优势克隆系。
文摘目的分析引起吉林省2009年手足口病(Hand,Footand Mouth Disease,HFMD)流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus Group A Type16,CVA16)VP1编码区的基因特征。方法 对2009年分离于吉林省部分HFMD来源的15株CVA16分离株的VP1编码区基因,进行逆转录-聚合酶链反应扩增,并对扩增产物进行序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件对VP1编码区基因进行基因遗传进化及同源性分析。结果吉林省2009年15株CVA16分离株有86.7%(13/15)属于B1a基因亚型,13.3%(2/15)属于B1b基因亚型,并且15株分离株分属于3个相对独立的传播链(Clade1~3),分别由11株、2株、2株组成。3个传播链各自的组内核苷酸和氨基酸同源性均较高,其中较大优势传播链(Clade1)的核苷酸和氨基酸同源性均高达98.2%~100.0%,两个较小传播链均高达100%。结论吉林省2009年监测到至少有2个基因亚型、3个传播链的CVA16引起的HFMD流行,并且呈现以1个B1a基因亚型的优势传播链为主,其他2个小传播链为辅的传播模式。无论是优势传播链还是小传播链,均各自呈现密切的亲缘关系。