汉中地区产ESBLs大肠埃希菌尿路感染危险因素及耐药性分析

目的探讨由产超广谱β类酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌致尿路感染的危险因素及其耐药特性,为临床合理治疗尿路感染提供依据。方法回顾性分析该院2015年1月至2016年12月收治的尿路大肠埃希菌感染患者的临床资料,根据尿液标本分离的大肠埃希菌是否产ESBLs分为产ESBLs组和对照组,使用χ2检验进行单因素分析,在有统计学意义的基础上采用多因素回归分析产ESBLs大肠埃希菌尿路感染的危险性因素,并耐药特性进行分析。结果共分离出大肠埃希菌217株,其中产ESBLs菌株127株(58.53%),非产ESBLs菌株90株(41.47%)。尿路梗阻≥3种疾病(P=0.044,OR=8.680,95%CI:1.058~71.189),留置双J管(P=0.030,OR=10.052,95%CI:1.247~81.020),留置导尿管(P=0.026,OR=2.532,95%CI:1.120~5.727)是产ESBLs大肠埃希菌泌尿系统感染的独立危险因素。产ESBLs大肠埃希菌对青霉素类、喹诺酮类、头孢菌素类具有较高的耐药性,其中对氨苄西林、环丙沙星、哌拉西林、头孢吡肟、头孢噻肟、头孢唑林、左氧氟沙星的耐药率均超过75%,与对照组比较差异具有统计学意义(P<0.05)。结论产ESBLs大肠埃希菌在尿路感染患者中检出率高,患有尿路梗阻性疾病、留置导尿管、留置双J管的尿路感染患者易分离出产ESBLs大肠埃希菌,该菌耐药严重,临床医生应根据药敏结果合理选用抗菌药物。

2010-2019年某三级甲等医院非发酵革兰氏阴性杆菌的分布及耐药性分析

目的:为临床经验性治疗非发酵革兰氏阴性杆菌(NFGNB)感染提供参考依据。方法:收集陕西汉中市某三级甲等医院2010年1月-2019年12月临床送检的各类标本,回顾性分析NFGNB的分布及耐药情况。结果:2010-2019年,该院共检出病原菌26386株,其中NFGNB 4077株(占15.45%),主要来源于年龄≥60岁的患者(1836株,占45.05%)。10年间,NFGNB的检出率由2010年的20.14%降至2019年的15.36%(P<0.001)。检出菌种以鲍曼不动杆菌(1359株)、铜绿假单胞菌(1269株)、嗜麦芽窄食单胞菌(447株)、洋葱伯克霍尔德菌(351株)等为主。检出的NFGNB主要来源于住院患者(4001株),且多见于重症监护病区(占17.05%)、神经外科(占14.52%)、呼吸科(占12.41%)等科室以及呼吸道(占66.69%)、分泌物(占7.80%)等标本。其中,鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌在肿瘤科的检出率以及在血液和尿液标本中的检出率均总体呈上升趋势,而在该院重症监护病区的检出率总体呈下降趋势(P<0.05);铜绿假单胞菌在神经外科的检出率呈上升趋势(P<0.05),鲍曼不动杆菌在呼吸科的检出率呈上升趋势(P<0.05)。鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类抗菌药物的耐药率由2010年的10%左右升至2019年的75%左右,对头孢菌素类药物的耐药率超过了78%;铜绿假单胞菌对亚胺培南和美罗培南的耐药率分别低于35%和30%,且耐药趋势变化不大(P>0.05),而对哌拉西林、氨曲南等12种临床常用抗菌药物的耐药率均低于40%;嗜麦芽窄食单胞菌对复方磺胺甲噁唑的耐药率逐渐呈现下降趋势(P<0.001),对头孢他啶的耐药率较高(54.70%~74.10%);洋葱伯克霍尔德菌对复方磺胺甲噁唑、美罗培南、头孢他啶的耐药率均呈现下降趋势(P<0.01),且在2014年之后均低于15%。结论:该院NFGNB的检出率虽有下降趋势,但鲍曼不动杆菌多重耐药和泛耐药情况较为严重,且对碳青霉烯类抗生素的耐药率有所上升;临床应根据药敏试验结果合理选用头孢哌酮/舒巴坦、阿米卡星、左氧氟沙星、头孢他啶等敏感药物治疗NFGNB感染。

2019—2020年汉中市食源性食品中ST198型肯塔基沙门菌的耐药性研究

目的研究食源性食品中ST198型肯塔基沙门菌的分子流行病学及耐药特性。方法对2019年7月至2020年5月从陕西省汉中市7家不同超市采集的冷冻整鸡和猪肉馅进行肯塔基沙门菌分离鉴定、血清型分型、药物敏感试验及全基因组测序。结果158份冷冻整鸡和163份猪肉馅中共分离鉴定出129株沙门菌,其中从6家超市共分离到14株ST198型肯塔基沙门菌。药物敏感试验显示,14株ST198型肯塔基沙门菌均为多重耐药菌,所有菌株同时对5类及以上抗菌药物耐药;对左氧氟沙星、多西环素、卡那霉素、链霉素、四环素、环丙沙星耐药率均达到100%;对头孢唑啉、氨苄西林、头孢噻肟、庆大霉素、氨曲南、头孢吡肟耐药率也达到92.86%;这些菌株仅仅对头孢西丁、亚胺培南、美罗培南、多粘菌素完全敏感。其中产超广谱户内酰胺酶(extended spectrumβ-lactamases,ESBLs)阳性菌株检出率为92.86%。耐药基因检测显示,14株ST198型肯塔基沙门菌同时发生染色体上喹诺酮耐药决定区(quinolone resistance determining region,QRDR)gyrA和parC双突变,突变类型有Asp87Asn(85.71%)、Asp87Gly(14.29%)、Ser83Phe(100%)、Thr57Ser(100%)、Ser80Ile(100%)。ESBLs基因以blaCTX-M-55和blaTEM-141为主,78.57%的菌株同时携带这2种基因,14.29%的菌株携带blaCTX-M-14b。此外78.57%的菌株携带大环内酯类耐药基因mph(A)。系统发育树结果显示,ST198型肯塔基沙门菌在汉中市6家不同的超市间存在相同克隆分子菌株。结论陕西省汉中市ST198型肯塔基沙门菌主要从冷冻整鸡中分离,对喹诺酮类和三代头孢菌素及替代药物阿奇霉素耐药严重,ESBLs阳性率和喹诺酮耐药决定区发生突变率高。此菌在汉中市不同超市间有一定传播关系,可能存在交叉污染和上一级污染来源的传播。

冷冻整鸡样本中单株猪红斑丹毒丝菌的鉴定及生物学特性

目的探讨来源于冷冻整鸡样本的单株猪红斑丹毒丝菌致病性、耐药性及生物学特征,为该菌防治提供科学依据。方法通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)和全基因组测序技术进行菌株鉴定和分子生物学研究,采用纸片扩散法(K-B法)检测其耐药表型,通过体外生物被膜形成实验检测其生物被膜形成能力,通过ParSNP构建亲缘关系图。结果MALDI-TOF MS可以准确鉴定猪红斑丹毒丝菌,该菌染色体大小为1791362 bp,鸟嘌呤(G)+胞嘧啶(C)含量为36.5%,含有1730个蛋白质编码序列,53个tRNA和2个rRNA,基因组分析暂未发现质粒;携带四环素类耐药基因tet(M),抗菌药物敏感性实验结果显示仅对四环素耐药,耐药基因和耐药表型一致;携带7个与黏附和荚膜形成相关的毒力基因;体外生物被膜形成能力适中(2+);与韩国分离株KC-Sb-R1亲缘关系较相近。结论本研究阐明了冷冻整鸡样本中猪红斑丹毒丝菌分离株的生物学特性,为该菌科学有效防控提供理论依据。

碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌感染和死亡的相关因素分析

分析患者碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)感染和死亡的相关因素。采用病例对照研究方法,以三二〇一医院2019年1月至2021年12月CRKP感染患者作为病例组,按1∶1的比例选取同一时间段内碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌(CSKP)感染患者作为对照组。对研究对象随访30 d,根据是否死亡分别将2组患者分为存活组和死亡组,比较CRKP病例组和CSKP对照组的30 d病死率。采用logistic回归模型分析感染CRKP以及CRKP感染后死亡的相关因素。本研究共纳入CRKP病例组和CSKP对照组各59例。CRKP感染和CSKP感染患者30 d病死率分别为30.5%(18/59)和5.1%(3/59),差异具有统计学意义( χ^(2)=13.034, P<0.001)。感染KP前3个月内手术( OR=17.285, P=0.001),感染KP前3个月内使用碳青霉烯类药物( OR=11.235, P=0.002),抗菌药物使用种类>3种( OR=7.993, P=0.016),以及感染KP前患者白蛋白<30 g/L( OR=10.463, P=0.002),性别( OR=0.078, P<0.001)及糖尿病( OR=0.076, P=0.011)为CRKP感染的相关因素。患者年龄校正Charlson合并症指数评分较高( OR=1.522, P=0.024)和感染KP前3个月内患者使用碳青霉烯类药物( OR=4.902, P=0.029)为CRKP感染患者死亡的相关因素。综上,医务人员应谨慎实施侵入性手术,严格把控抗生素的使用,尽早对高危患者予以针对性防护和治疗。

陕西省汉中市食品动物源性大肠埃希菌mcr-1携带菌株流行特征和分子传播机制

目的了解陕西省汉中市食品动物源性大肠埃希菌多黏菌素耐药基因mcr-1的流行特征和分子传播机制,掌握汉中市mcr-1阳性大肠埃希菌的流行现状,为防控大肠埃希菌多黏菌素耐药基因mcr-1在社区和医院的传播提供科学依据。方法2019年11月-2020年5月于陕西省汉中市7家不同大型超市随机采集冷冻整鸡和猪肉馅,对其进行大肠埃希菌分离鉴定。通过聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)筛查mcr-1基因,对mcr-1阳性菌株通过微量肉汤稀释法进行药敏试验,基于全基因组测序、S1-脉冲电场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)和Southern blot对mcr-1进行定位。结果7家不同大型超市共随机采集到159份样本,检出77株大肠埃希菌,检出11株携带mcr-1的菌株,阳性率为14.29%。11株mcr-1阳性菌均为多重耐药菌,对多黏菌素类的最低抑菌浓度(minimal inhibit concentration,MIC)≥2 mg/L(11/11),对氨苄西林、链霉素、四环素和氯霉素耐药率为100.00%(11/11),且均为产超广谱β-内酰胺酶(extended-spectrum beta-lactamases,ESBLs)菌株;对碳青霉烯类和头孢西丁均敏感,对喹诺酮类药物环丙沙星和左氧氟沙星的耐药率均为90.91%。在10株mcr-1阳性菌质粒上杂交到了mcr-1,质粒大小分布约为60 kb和220 kb。11株mcr-1阳性大肠埃希菌属于9个ST型,含1个新的ST型。所有菌株除携带多黏菌素耐药基因mcr-1外,至少还携带1个ESBLs基因,以bla_(CTX-M-55)为主(8/11,72.73%)。携带mcr-1的质粒分型为IncI2(5/11,45.45%)和IncHI2(5/11,45.45%),1株菌mcr-1位于染色体。结论本研究检出的mcr-1阳性大肠埃希菌均为多重耐药菌且产ESBLs,以bla_(CTX-M-55)为主,mcr-1可通过质粒和染色体传播。

产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌所致社区获得性血流感染特征分析

目的 比较社区获得性与医院获得性产超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）大肠埃希菌血流感染危险因子和耐药性特征,为更好地制定针对社区获得性耐药大肠埃希菌感染的防控策略提供依据.方法 收集2008年11月至2013年9月西安交通大学医学院附属三二○一医院51例产ESBLs大肠埃希菌血流感染病例和菌株;采用K-B纸片法进行19种抗菌药物的药敏、ESBLs确认试验;脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行菌株同源性分析;PCR扩增测序筛选ESBLs基因型;核酸酶S1酶切包埋菌株再进行PFGE的方法评估大肠埃希菌携带质粒的数量和大小.结果 51例病例社区获得性为27例,医院获得性24例;社区获得性感染患者呈逐年增多的趋势;尿路感染和肿瘤在社区和医院获得性患者之间差异有统计学意义,尿路感染的病例以社区获得性感染患者为主（OR=18.40,95％ CI：2.161 ～ 156.7）;而肿瘤患者以医院获得性感染患者为主（OR=0.147 7,95％ CI：0.034 85 ～0.62630）;菌株PFGE同源性分析显示,无论是社区获得性菌株还是医院获得性菌株,均呈散发克隆的分布;51株菌株中,TEM基因型26株,社区菌株包括12株,SHV基因型12株,社区菌株5株,CTX-M-1基因型21株,社区菌株10株,CTX-M-9基因型25株,社区菌株13株,所有ESBLs耐药基因型分布在两组中差异均无统计学意义.结论 尿路感染是社区获得性大肠埃希菌所致血流感染的相对危险因子;社区获得性血流感染产ESBLs大肠埃希菌耐药性与医院获得性菌株耐药程度接近,控制社区获得性产ESBLs大肠埃希菌感染与传播非常有必要.