COI基因DNA条形码技术在福建省蜱类鉴定中的应用

目的探讨基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因的DNA条形码技术应用于福建省蜱类鉴定的可行性。方法蜱标本经形态学鉴定后提取基因组DNA,PCR扩增COI基因片段,并进行测序和比对,用Kimura-2-parameter模型计算种内及种间遗传距离,以邻接法构建系统发育树。结果经形态学鉴定,97只蜱隶属于5属12种,遗传距离计算结果显示,种间遗传距离(14.65%~26.79%)显著大于种内遗传距离(0~7.14%);BLAST同源性比对发现GenBank数据库中尚无越原血蜱(Haemophysalis Yeni)与基刺硬蜱(Ixodes spinicoxalis)的COI基因序列,褐黄血蜱(H.flava)、台岛血蜱(H.formosensis)、豪猪血蜱(H.hystricis)、粒形硬蜱(I.granulatus)、微小扇头蜱(Rhipicephalus microplus)与血红扇头蜱(R.sanguineus)的形态学鉴定与DNA条形码鉴定结果一致,但是,龟形花蜱(Amblyomma testudinarium)、台湾革蜱(Dermacentor taiwanensis)、中华硬蜱(I.sinensis)的形态学鉴定与COI基因DNA条形码鉴定结果不一致;系统发育树显示,同一物种的不同个体均形成高支持率的单系,种间分支很明显。结论COI基因DNA条形码测定是一种快速准确的蜱类鉴定新兴技术,但现阶段,COI基因DNA条形码技术尚不能完全脱离传统的形态学鉴定而独立进行,两者应有机结合。

福建省部分地区野栖鼠体表寄生恙螨的物种多样性调查

目的调查福建省部分地区野栖鼠体表寄生恙螨的分布情况及物种多样性,为恙虫病防制提供参考依据。方法笼日法捕鼠,检获鼠体恙螨,对其鉴定、计数。用带螨率、带螨指数及优势种反映恙螨的种群构成及密度;采用丰富度、Shannon-Wiener多样性指数、Pielou均匀度指数及Simpson优势度指数分析恙螨的物种多样性。结果在野栖鼠体表共检获恙螨2亚科7属27种10832只。其中,鼠耳表面共检获2亚科6属23种9936只,带螨率为33.27%,带螨指数为17.68,恙螨的多样性指数为1.48,优势种为地理纤恙螨(59.60%);鼻腔内共检获1属4种896只,带螨率为15.11%,带螨指数为4.06,恙螨的多样性指数为1.12,优势种为中华珠恙螨(48.33%)。不同寄生部位、不同宿主、不同生境、不同季节、不同区划鼠体带螨率、带螨指数、恙螨的物种多样性及优势种均不同。恙螨物种多样性指数趋势依次为:耳>鼻腔;白腹巨鼠>针毛鼠>社鼠>黄毛鼠>黑线姬鼠>青毛鼠>板齿鼠(耳);青毛鼠>针毛鼠>黄毛鼠(鼻腔);山地>田地>果园;春季>秋季>夏季;东部丘陵平原亚区>闽广沿海亚区。结论福建省野栖鼠体表寄生恙螨种类丰富,其种群构成、密度及物种多样性受宿主、寄生部位、生境、气候等因素的影响。

福建省三都澳岛鼠体螨类调查

目的调查福建省三都澳岛鼠体外革螨及恙螨的分布情况。方法采用笼日法捕鼠,检获鼠体外革螨及恙螨。结果共检获革螨6769只,分属4科8属13种,恙螨31580只,分属1科2属6种。体外革螨密度最高的鼠种为针毛鼠,以土尔克厉螨、福建厉螨为优势种,黄毛鼠及针毛鼠染恙螨率及总恙螨指数均较高,但前者以小板纤恙螨为优势种,后者以苍白纤恙螨为优势种;灌木山地黄毛鼠革螨染螨率为86.67%,螨指数为9.99,两者均高于水稻田(染螨率为68.57%,螨指数为6.86);灌木山地黄毛鼠恙螨染螨率为93.14%,螨指数为128.30,两者亦高于水稻田(染螨率为36.90%,螨指数为29.03);毒厉螨、纳氏厉螨季节性不明显,全年均有出现,福建厉螨、土尔克厉螨、小板纤恙螨、苍白纤恙螨、广东珠恙螨及异毛纤恙螨均为冬春活动的螨,中华血厉螨仅出现于冬季,地里纤恙螨则出现于气温较高的夏秋季。结论福建省三都澳岛鼠体外革螨及恙螨的分布广泛,种群构成和密度受宿主、生境、季节等因素的影响。

人体蠕形螨生物学研究现状

有关人体蠕形螨生物学方面的研究越来越受到研究者的重视。本文就蠕形螨的检螨方法、成虫形态学、生活习性、体外存活与死亡等生物学方面的研究现状作一综述。

福建省蚤类畸形的观察与体会

本文报道了福建省蚤类畸形共 130例 ,具有如下特点 1、实验室饲养的缓慢细蚤 L eptopsyllussegnis畸形发生率很高 ;自然界适存病蚤 Nosopsyllusnicanus、喜山二刺蚤中华亚种 Peromyscopsylla himalaic畸形发生率较高 ;2、自然界畸形蚤中畸形发生部位频率最高的为头部 ;实验室饲养的蚤畸形发生部位频率最高的为受精囊 ;3。

美国《Emerging infectious diseases》2011年第5期有关人兽共患病论文摘译

P785西尼罗病毒新基因型在北美的演变//Allison R.Mc Mullen,Fiona J.May,Li Li等1999-2005年间对北美西尼罗病毒（MNV）分离株的研究表明此病毒在北美已达到遗传稳态。然而,在2002-2009年分离自德克萨斯州哈里斯县的MNV病毒株的基因序列显示并非如此。

美国《Emerging Infectious Diseases》2014年第1期有关人兽共患病论文摘译

P13 2010年巴基斯坦与洪水相关的O1群霍乱弧菌的基因组流行病学//Muhammad Ali Shah，Ankur Mutreja,Nicholas

福建省鼠类感染巴尔通体调查及序列分析

目的了解福建省鼠类中巴尔通体(Bartonellaspp.)的感染状况和基因特征。方法 2014-2016年采用笼日法在福建省闽东、闽西、闽南、闽北和闽中捕鼠,现场鉴定并记录捕获鼠类的釆集时间、地点、鼠种、性别、鼠龄等资料。采集鼠心脏血,PCR扩增巴尔通体的gltA和16S^23SrRNA基因,阳性PCR产物送测序并进行序列比对分析,构建系统进化树。感染率间的比较采用χ~2检验或Fisher精确检验法。结果调查共布放鼠笼5 917笼次,捕鼠381只,鼠密度为6.44%。巴尔通体感染率为12.34%。家鼠的巴尔通体感染率为10.61%,褐家鼠(Rattus norvebicus)和黄胸鼠(Rattus flavipectus)感染率分别为11.30%和10.00%;野鼠的感染率为13.86%,黄毛鼠(Rattus losea)和针毛鼠(Rattus fulvescens)感染率分别为22.86%和18.00%,野鼠的巴尔通体感染率高于家鼠的感染率,但无统计学意义。从地区分布看,闽西、闽北一带的感染率较高,分别为20.00%和25.33%。闽南一带感染率最低,为0。各地区感染率存在统计学意义(P<0.05)。不同性别、鼠龄的巴尔通体感染率差异无统计学意义,而不同的生境下的感染率存在统计学差异(P<0.05)。阳性样本测序分析显示,福建省鼠类感染的巴尔通体序列与B.tribocorum、B.elizabethae和B.grahamii序列最接近。结论福建省鼠类存在巴尔通体感染,存在对人群致病的风险。

福建省鼠感染钩端螺旋体调查和分离株基因种的鉴定

目的了解福建省鼠感染钩端螺旋体(钩体)现状及分离株基因种的特征,为钩体病防控提供科学依据。方法2015-2019年根据疫情选取14个调查点,采用笼夜法捕鼠并采集心血或肾脏标本进行钩体培养,测定血清抗体;对鼠中分离保存的23株钩体菌株提取DNA,PCR扩增16S rRNA基因、PCR产物纯化测序,与GenBank数据库收录的钩体17种基因型进行比对确定基因种,并用Mega 6.0软件构建系统进化树并进行序列分析。结果福建省鼠种以黄毛鼠为主要优势鼠种,占40.87%(499/1221)、其次依次是黄胸鼠19.57%(239/1221)、针毛鼠16.79%(205/1221)和褐家鼠8.85%(108/1221),钩体血清抗体阳性率为29.32%(207/706),以黄毛鼠最高,为42.16%(121/287),不同地区鼠种构成及鼠钩体感染率不同。23株菌株均扩增出16S rRNA基因的目标条带1484 bp,测序及序列分析属于致病性的基因种有13株,其中L.borgpetersenii(伯氏)占8株,L.interrogans(问号)占5株,属于非致病的基因种10株。钩体菌株分离自福建省的优势鼠种(黄毛鼠、黄胸鼠、针毛鼠)及不同地区(闽东、闽南、闽西和闽北)。结论福建省鼠类感染钩体普遍,以致病性基因种(L.borgpetersenii和L.interrogans)为主,也携带非致病性基因种,需加强钩体病传染源啮齿动物的监测工作。

福建省动物宿主感染巴贝虫调查研究

目的了解福建省动物宿主感染巴贝虫状况。方法 2014-2016年本中心在福建各地捕鼠,笼日法捕鼠,采集鼠心脏血,同时采集牛、羊和狗的血液样本,采用PCR扩增巴贝虫18SrRNA基因,感染率的比较采用χ2检验或Fisher’s确切概率法。结果调查共布放鼠笼5 917笼次,捕鼠381只,鼠密度为6.44%。全省鼠类巴贝虫的感染率7.61%。家栖鼠中仅3只感染巴贝虫,感染率为1.68%。野鼠中26只感染巴贝虫,感染率为12.87%。野鼠感染率远高于家鼠,差异存在统计学意义(P<0.05)。地区分布看,闽中地区感染率最高,其次为闽东,闽南地区感染率最低,差异存在统计学意义(P<0.05)。其他动物,牛的血样未检出巴贝虫,狗和羊的血样中各1只检出巴贝虫,感染率分别为1.79%和0.55%。鼠类的巴贝虫感染率高于其他动物的感染率,差异存在统计学意义(P<0.05)。序列分析显示鼠类感染的均为田鼠巴贝虫。而犬中检出的巴贝虫为犬巴贝虫。结论福建省巴贝虫宿主动物中鼠类尤其是野鼠,感染率最高,可能是我省巴贝虫最重要的宿主。

UDPE法检测鼠疫菌的应用研究

[目的 ]评价 UDPE(UDG- Duplex PCR- EIA)技术在鼠疫菌检测中的效果和应用价值。 [方法 ]用 UDPE方法对鼠疫菌和其它耶尔森菌等 17株细菌及对鼠疫菌不同的菌量梯度进行检测。以鼠疫菌接种动物 ,并取动物模型的不同脏器组织同时进行分离培养和 UDPE检测比较。 [结果 ]UDPE检测系统可以特异性地对鼠疫菌进行检测 ;在梯度稀释菌液提取的模板检测中 ,灵敏度可达 0 .0 5个菌 /μl;对于接种动物的肝、脾等脏器材料阳性检出率显著高于分离培养法。 [结论 ]UDPE技术是一套特异性强、灵敏度高的检测系统 ,可有效地应用于鼠疫菌的检测和鉴定。

鼠疫PCR中模板制备方法的比较研究

[目的 ]比较 3种模板制备方法对鼠疫 PCR的检测结果比较。 [方法 ]对鼠疫菌培养物及感染动物脏器组织标本分别用直接水浴煮沸、酚—氯仿提取和 Na I裂解—玻璃粉吸附等 3种方法制备模板 ,用 UDPE(UDG- Duplex PCR- EIA)法检测效果。 [结果 ]对细菌培养物 ,直接水浴煮沸和 Na I裂解—玻璃粉吸附法制备的模板均能检出 0 .0 5个菌 / μl;对脏器组织 ,Na I裂解—玻璃粉吸附法检出率高于酚—氯仿提取法 ,直接水浴煮沸法未能检出阳性。 [结论 ]Na I裂解—玻璃粉吸附法较其它方法操作简便。

福建省不同自然区划中家栖鼠形动物体外寄生蚤数量分布的观察

[目的 ]对福建省不同综合自然区划中家栖鼠形动物体外寄生蚤的数量分布进行分析。 [方法 ]利用近 10年来福建省鼠疫监测中所获得的鼠、蚤监测资料 ,按不同综合自然区划对相关的蚤类监测数据进行统计学处理与分析。[结果 ]得出了不同综合自然区划中的蚤类组成情况 ,表明染蚤率、印鼠客蚤指数在不同区划中有显著差异 ,显示了 10年间在 3种不同的综合自然区划中印鼠客蚤指数有变化。 [结论 ]在福建省 3类不同综合自然区划中 ,家栖鼠形动物体外寄生蚤的数量分布存在明显的差异。

洞居盲鼠蚤记述(蚤目:细蚤科)

本文记述了采自福建省武夷山市猪尾鼠体上的洞居盲鼠蚤 (TyphlomyopsylluscavaticusLietHuang ,1980 ) 。

福建省2012-2018年布鲁氏菌分离株的MLST分型

目的探讨2012-2018年福建省布鲁氏菌分离株种群结构及遗传进化关系。方法采用多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)对43株布鲁氏菌分离株的9个基因位点的序列进行测定,与标准序列比对后确定菌株ST型,通过Bionumerics 6.6软件对其进行聚类分析。结果 43株布鲁氏菌分离株中,38株为ST8型,5株为ST17型。结论福建省布鲁氏菌主要流行株为ST8型。MLST是研究布鲁氏菌遗传特征的重要方法。

福建省人兽共患病学科发展报告

回顾了福建省人兽共患病学科发展历程,重点介绍该学科在福建省重要人兽共患病监测与防控、突发重大传染病疫情处置、能力建设、科学研究等方面的工作现状与成就,并提出新形势下学科发展的挑战与展望。

职业紧张因素与冠心病关系的多因素研究

目的研究职业紧张与冠心病之间的关系以及引起冠心病发病的主要职业紧张因素。方法应用职业紧张因素测试表，对１００例冠心病患者１∶１配对病例对照进行多因素分析。结果在控制非职业紧张因素条件下，职业紧张暴露的危险度增高（ＯＲ＝１５５，９５％ＣＩ：１１５～２４６），并随着职业紧张程度的增加患冠心病的危险性增高；引起冠心病发病的主要职业紧张因素是管理角色（ＯＲ＝１６６，９５％ＣＩ：１０９～１９５）和组织结构及气氛（ＯＲ＝１４９，９５％ＣＩ：１１１～１７８）。结论职业紧张因素与冠心病之间有较确定的关系，但与心理因素的关系需进一步研究。

福建省2014―2020年恙虫病流行特征和时空聚集性

目的分析福建省2014―2020年恙虫病流行特征和时空聚集性,为制定防控策略提供依据。方法收集福建省2014―2020年通过中国疾病预防控制信息系统报告的恙虫病病例信息,采用WPS 2016、SPSS 20.0、ArcGIS 10.0、SaTScan 9.5等软件进行数据处理和统计分析,探索时空分布特征。结果2014―2020年福建省共报告恙虫病病例8595例,年均发病率为3.03/10万,病例主要集中在6―10月,病例集中于40~<70岁(73.10%),职业以农民为主(73.30%)。年均发病率最高的地区是南平市11.71/10万,发病率居前的县区为平和县(36.71/10万)、光泽县(31.28/10万)。时空扫描显示最大可能聚集区多达10个,以平和县为中心覆盖了6个县区。结论福建省恙虫病发病存在一定的时空聚集性,应加强对重点人群和重点地区的日常监测和病原检测工作,降低福建省恙虫病发病水平。

恙虫病东方体环介导等温扩增可视化快速检测方法的建立

目的利用环介导等温扩增(LAMP)可视化检测技术,建立一种灵敏、特异和简便的恙虫病检测方法。方法利用LAMP在线引物设计软件Primer Explorer V4,以恙虫病东方体热休克蛋白groEL基因作为靶序列,设计扩增引物,优化反应条件。利用恙虫病东方体标准株评估灵敏度和特异度;收集42份恙虫病血样,分别采用LAMP、普通PCR和实时荧光定量PCR方法进行验证。结果建立的LAMP方法可在61~65℃80 min内完成恙虫病东方体的快速检测,最低检测限为10拷贝/μL,高于普通PCR方法2个数量级,高于荧光定量PCR方法1个数量级;对8种常见的自然疫源性疾病病原体检测均为阴性,特异度为100%;对42份恙虫病血样采用3种方法检测,阳性率一致,均为21.4%(9/42)。结论本研究建立的恙虫病东方体LAMP可视化检测反应快速,操作简便,灵敏特异,可在基层医疗卫生机构运用推广。