金针菇基因组SSR位点分析及标记开发

以金针菇(Flammulina velutipes)基因组序列为基础,对其SSR位点进行分析,设计16对引物对其中16个SSR位点进行标记设计,并对6个商业化的金针菇品种进行筛选。统计结果表明,金针菇基因组有1279个位点,SSR位点密度为35.53/Mb,并以三核苷酸基序为主,重复数≥10的SSR(即高频)基序数目总计246个,占所有SSR位点的19.23%。设计的16对SSR标记均能扩增条带,多态率仅为18.75%。

肺形侧耳变温结实相关基因Ppcsl-1的克隆及功能预测

CSL(CBF1/RBP-Jκ/suppressor of hairless/LAG-1)转录因子家族在真菌发育和细胞分化过程中扮演重要角色。前期研究已构建了肺形侧耳变温结实相关消减杂交文库,并从中筛选到一个代表csl基因部分序列的EST。通过TAIL PCR(thermal asymmetric interlaced PCR)技术克隆了该基因(Pleurotus pulmonarius csl-1,简写为Ppcsl-1),并利用RACE(rapid-amplification of c DNA ends)技术获得该基因的c DNA全长。Ppcsl-1 c DNA全长2 991bp,编码一个996个氨基酸组成的蛋白(命名为Pp CSL-1)。进化分析显示在担子菌CSL中,Pp CSL-1与糙皮侧耳Pleurotus ostreatus CSL(PoC SL)亲缘关系最近。荧光定量检测结果表明Ppcsl-1在菌丝经过5℃12h冷处理之后的表达量最高,表明其有可能被冷刺激诱导表达并在开启子实体形成的过程中起重要作用。