两株广西地不容内生真菌的抑菌活性研究

从广西地不容块根分离出白壳菌Albonectria rigidiuscula DBR-3和黑孢霉属Nigrospora sp.DBR-5两株内生真菌,以15种动物病原菌和10种植物病原真菌为供试菌,对两株内生真菌的抑菌活性进行测定。结果表明,DBR-3对动物病原菌和植物病原真菌均有抑菌活性,其发酵产物的乙酸乙酯萃取物对12种动物病原菌的MIC为0.625～10 g/L,对10种植物病原真菌的EC50值为0.3437～7.7094 g/L。DBR-5对植物病原真菌的抑菌活性好,但对动物病原菌的抑菌活性差,DBR-5发酵产物的乙酸乙酯萃取物对10种植物病原真菌的EC50值为0.0124～0.6112 g/L,明显高于DBR-3对植物病原真菌的抑菌活性。

表观遗传DNA甲基化和组蛋白修饰与疾病关系的研究进展

近年来,表观遗传修饰在许多重大疾病中的致病机制和临床应用的研究受到广泛关注。在表观遗传修饰中,DNA甲基化和组蛋白修饰调节剂作为疾病发生、发展和临床诊断治疗的生物标志物,而DNA甲基化水平的高低和组蛋白修饰位点的不同均可能对疾病产生影响,DNA甲基化导致抑癌基因转录失活,组蛋白的异常修饰与肿瘤发生、发展相关。因此,探讨DNA甲基化和组蛋白修饰与疾病的关系,在疾病治疗过程中寻找靶向标志物,更深入地研究疾病的致病机制,可为疾病的预防、诊断和治疗提供新途径。

桂北地区恶性肿瘤患者外周血T淋巴细胞亚群和淋巴细胞亚群的相关性研究

目的探究桂北地区恶性肿瘤患者外周血T淋巴细胞亚群和淋巴细胞亚群的数值及其临床意义。方法选取184例肿瘤患者,分别设有鼻咽癌组94例,乳腺癌组32例,宫颈癌组36例,肺癌组22例,并选取了40例符合性别年龄区间的健康体检人员作为正常对照组,运用流式细胞仪检测肿瘤各组和正常组的T淋巴细胞亚群表面因子CD3^+、CD4^+、CD8^+细胞绝对计数和CD4^+/CD8^+比值,淋巴细胞亚群表面因子相对计数CD3^+%、CD56^+%、CD19^+%,并进行统计学分析,比较肿瘤组和正常组之间的差异。结果肿瘤组患者T淋巴细胞亚群细胞绝对计数CD3^+、CD4^+、CD8^+和正常组对比有显著差异(P=0.000),CD4^+/CD8^+比值,鼻咽癌有显著差异(P=0.000),乳腺癌(P=0.634)、宫颈癌(P=0.409)、肺癌(P=0.629)差异无统计学意义。淋巴细胞亚群相对计数与正常组对比,乳腺癌、肺癌差异无统计学意义,鼻咽癌CD3^+%(P=0.000)、CD56^+%(P=0.001)有显著差异,CD19^+%差异无统计学意义;宫颈癌CD3^+%(P=0.000)有显著差异,CD56^+%(P=0.094)差异无统计学意义,CD19^+%(P=0.235)差异无统计学意义。结论恶性肿瘤患者免疫功能异常,通过流式细胞仪检测T淋巴细胞亚群、淋巴细胞亚群项目,对患者病情评估、身体免疫情况实时监测、后期治疗指导用药具有一定的临床应用价值。

地中海贫血患者血浆环状RNA的筛查及结果分析

目的筛查地中海贫血患者外周血中差异表达的环状RNA(circRNA),并分析其生物学功能,为地中海贫血新诊断方法的建立提供新的信息。方法选取2018年1~12月在桂林第924医院入院治疗的地中海贫血患者及健康对照者外周血标本各10例,采用基因芯片法分析受试者血浆中circRNA的相对表达水平,并采用实时荧光定量PCR法验证基因芯片检测结果的准确性。结果基因芯片法共检测到circRNA 8312个,其中包括差异表达circRNA 84个(以2.0倍为标准阈值),47个环状RNA上调(>2.0倍),37个circRNA下调(<-2.0倍),并筛选了部分差异表达倍数排名前10的上、下调环状RNA配对的靶miRNA。此外,基于实时荧光定量PCR法验证了hsa_circRNA_100790(上调倍数11.10)和hsa_circRNA_001496(下调倍数-5.44)的相对表达水平,其表达水平趋势与基因芯片检测结果一致。结论地中海贫血患者外周血血浆中存在大量差异表达circRNA,可能作为地贫新的生物标志物和精准治疗靶点,为未来地贫的疗效评估、预后判断带来新的希望。

基于RNA-seq技术对13-三体综合征脐带血差异性表达环状RNA研究

目的本研究拟从circRNA为切入点,利用RNA-seq技术从13-三体综合征患者和产检正常的孕妇脐带血中筛选出差异表达的circRNA,为13-三体综合征患者的诊断和治疗提供基础性研究。方法选择在2017年1月1日至2018年1月1日期间深圳市人民医院确诊为13-三体综合征患者和一名产检结果正常的孕妇作为研究对象,使用RNA-seq技术检测出差异表达的circRNA,进行组间的差异分析,并对circRNA吸附相关的微小RNA(miRNA)进行预测和分析。结果通过与健康对照组分析可得到,共有8005个差异表达的circRNA具有统计学上的意义,其中表达上调的circRNA有4275个,表达下调的circRNA有3730个,hsa_circ_0002473是位于13号染色体上表达最上调的circRNA,与8种miRNA相互作用。结论 13-三体综合征患者脐带血与健康对照组的脐带血之间存在差异表达的circRNA,hsa_circ_0002473有可能成为13-三体综合征诊断和治疗的生物标志物。

细胞色素P450对器官移植的影响机制研究进展

肝、肾移植可用于终末期肝病患者和肾病患者的治疗,他克莫司广泛用于移植受者的免疫抑制药物,它治疗范围窄,个体间的药代动力学差异大,这种差异主要是细胞色素P450导致的,研究影响机制有利于制定个性化的用药方案,使患者获得更好的治疗效果。细胞色素P450对移植后并发症有重要影响,对影响机制的研究,可以及时发现并采取治疗措施,使患者有更好的预后。

胰腺癌组织中细胞分裂周期相关蛋白5的表达及其预后意义

目的:基于生物信息学方法分析胰腺癌组织中细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)的表达及其与预后的相关性。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载2021年1月至2021年12月168例胰腺癌样本RNA测序数据(HTSeq-FPKM)和相应的临床信息,从GEPIA2数据库中下载2021年1月至12月179例胰腺癌患者数据,同时整合TCGA和GTEx数据库中的171个正常胰腺组织样本。分析GEPIA2数据库中胰腺癌患者CDCA5 mRNA相对表达量及其与患者总生存(OS)和无病生存(DFS)的关系;结合患者临床资料,采用单因素和多因素Cox比例风险模型分析胰腺癌患者OS的影响因素;使用基因集富集分析(GSEA)探讨CDCA5在胰腺癌中可能参与的信号通路。结果:在GEPIA2数据库中,胰腺癌组织中CDCA5 mRNA相对表达量较正常胰腺组织升高,差异有统计学意义( P<0.05)。根据CDCA5 mRNA相对表达量的中位值将胰腺癌患者分为高表达组(89例)和低表达组(89例)(等于中位值者未分组),CDCA5 mRNA高表达的胰腺癌患者较低表达患者OS( P=0.024)和DFS差( P=0.025)。TCGA数据库中,N分期( HR=2.15,95% CI 1.24~3.72, P=0.006)和CDCA5( HR=1.71,95% CI 1.23~2.38, P=0.001)表达为胰腺癌患者OS的独立影响因素。GSEA富集分析结果表明,CDCA5 mRNA高表达主要富集在13个生物学通路[均 P<0.05,错误发现率(FDR)<0.005],其中包括细胞周期、DNA复制、同源重组、嘧啶代谢、错配修复、磷酸戊糖途径、糖酵解糖异生和p53等信号通路。CDCA5 mRNA的表达与HK2、PKM、PGK1、ALDOA、EN01和LDHA的表达均呈正相关(均 P<0.05)。 结论:CDCA5在胰腺癌组织中高表达,且与患者预后不良有关,可以作为胰腺癌的预后标志物。