人工养殖对尼罗罗非鱼肠道菌群的影响

试验旨在研究人工养殖对尼罗罗非鱼肠道菌群的影响。研究采用16S rDNA测序方法对野生(YS)和人工养殖(YZ)尼罗罗非鱼的肠道内容物进行测序,分析比较两者肠道菌群生物丰富度及多样性差异。结果表明,在野生环境下,尼罗罗非鱼肠道中Actinobacteriota、Proteobacteria和Firmicutes为主要优势菌群;在人工养殖环境下,Actinobacteriota、Proteobacteria和Cyanobacteria为主要优势菌群。肠道菌群多样性的分析表明,YZ组群落多样性指数低于YS组(P<0.05)。门水平上,YZ组的Proteobacteria、Acidobacteriota、Bacteroidota和NB1-j菌门低于YS组(P<0.01或P<0.05),Cyanobacteria、Dependentiae高于YS组(P<0.01或P<0.05)。属水平上,YZ组的norank_f_norank_o_Chloroplast、 Mycobacterium、 Paeniclostridium、 IMCC26207、 Methylocystis和Conexibacter菌属高于YS组(P<0.01),Exiguobacterium、norank_f_Steroidobacteraceae、norank_f_SC-I-84菌属低于YS组(P<0.01)。Spearman相关分析结果表明,在门分类水平上,环境因子对不同分组样本中物种数据分布的影响排序为pH值>NH_(4)-N>NO_(2)-N>O>PO_(4)-P。在属分类水平上,环境因子对不同分组样本中物种数据分布的影响程度排序为NO_(2)-N>NH_(4)-N>pH值>O>PO_(4)-P。研究表明,人工养殖会改变尼罗罗非鱼的肠道菌群,有助于解释肠道菌群对养殖和野生环境下尼罗罗非鱼健康和生长的影响。

基于比较转录组测序分析雨生红球藻对克氏原螯虾肝胰腺基因表达的影响

为明确饲料中添加雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)肝胰腺基因表达的影响,以克氏原螯虾商业饲料作为基础饲料添加雨生红球藻,配置含有3‰雨生红球藻的试验饲料对克氏原螯虾进行为期45 d的喂养。基于RNA-seq技术对其肝胰腺的转录组数据进行分析,测序共获得44.61 Gb干净数据,Q30碱基百分比在92.46%以上。在FDR≤0.05且|log2FC|≥3的筛选条件下转录组测序分析共鉴定出895个差异表达基因。GO功能富集分析结果显示,差异表达基因主要在能量代谢过程上显著富集。KEGG通路富集分析结果显示,差异基因主要在能量代谢、免疫和神经传递相关通路中被显著富集。综上所述,饲料中添加3‰的雨生红球藻可能有助于克氏原螯虾提高抵抗病原体和外界环境变化的能力。