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一种新型仔猪先天性震颤及其病原的初步研究 被引量:9
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作者 张文波 吴松松 +4 位作者 邓舜洲 周荷田 张志庆 杨丹凤 曹亮亮 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第7期2147-2154,共8页
为了解国内猪群是否存在新型仔猪先天性震颤及其病原,本试验对临床疑似仔猪先天性震颤病例进行剖检,观察组织脏器的病理变化;根据GenBank上登录的瘟病毒基因组序列设计2对引物,以典型震颤仔猪的病料RNA为模板,进行RT-PCR,并对阳性产物... 为了解国内猪群是否存在新型仔猪先天性震颤及其病原,本试验对临床疑似仔猪先天性震颤病例进行剖检,观察组织脏器的病理变化;根据GenBank上登录的瘟病毒基因组序列设计2对引物,以典型震颤仔猪的病料RNA为模板,进行RT-PCR,并对阳性产物进行测序;用DNAStar和Mega 7.0软件对所测序列进行分析,绘制系统进化树。结果表明,疑似仔猪先天性震颤病猪的组织脏器病理变化与猪瘟的病理变化相似,但无明显的脾脏梗死和淋巴结周边出血;从采集的病料中均扩增到与预期大小基本一致的条带;所测序列经BLAST比对,均为仔猪先天性震颤瘟病毒(APPV)的相应基因序列片段;系统进化树结果显示,哺乳动物瘟病毒可分为两大进化分支,APPV为单独一分支,其他瘟病毒为另一分支,两分支的同源性低于70%;所测的NS2-3和NS5B基因序列与GenBank上登录的APPV相应序列同源性在76.9%~98.8%之间,表明本研究所测定的序列是APPV的基因组序列;测定的7条NS2-3基因序列之间的同源性在89.7%~94.8%之间,12条NS5B基因序列的同源性在82.2%~100.0%之间。本试验首次证实国内猪群中存在新型仔猪先天性震颤病及其病原(APPV)。 展开更多
关键词 仔猪先天性震颤 瘟病毒 仔猪先天性震颤瘟病毒(APPV) 序列分析
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仔猪先天性震颤瘟病毒RT-PCR检测方法的建立 被引量:1
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作者 吴松松 周荷田 +3 位作者 张文波 邓舜洲 张志庆 杨丹凤 《动物医学进展》 北大核心 2019年第4期28-31,共4页
旨在建立检测仔猪先天性震颤瘟病毒(APPV)的逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法。根据GenBank上登录的APPV基因组序列,设计1对引物,以临床上表现典型震颤仔猪的淋巴结为材料,提取RNA,建立了RT-PCR方法,并进行敏感性、重复性和特异性试验,... 旨在建立检测仔猪先天性震颤瘟病毒(APPV)的逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法。根据GenBank上登录的APPV基因组序列,设计1对引物,以临床上表现典型震颤仔猪的淋巴结为材料,提取RNA,建立了RT-PCR方法,并进行敏感性、重复性和特异性试验,对其扩增产物测序比对分析;利用该方法,对临床病料进行检测。结果显示,从典型震颤仔猪的淋巴结中均扩增到与预期大小有一致的片段,经测序比对,扩增片段序列与APPV相应片段的核苷酸同源性在89%以上;该方法只能扩增出APPV片段,而其他几种常见猪病毒均为阴性,3次重复检测结果基本一致,可检测最低cDNA浓度为184.11ng/μL;对临床病料检测,典型病例的检出率达100%。试验结果表明,建立的RT-PCR方法具有良好的特异性、重复性、敏感性等优点,可用于临床APPV引起的仔猪先天性震颤早期检测、病毒鉴定和分子流行病学调查。 展开更多
关键词 仔猪先天性震颤 瘟病毒 逆转录-聚合酶链反应
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2013~2017年江西省猪圆环病毒2型分子流行病学调查 被引量:15
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作者 蒋新华 周荷田 +4 位作者 罗锋 杨丹凤 张志庆 陈松昌 邓舜洲 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第4期1143-1150,共8页
为掌握江西地区猪圆环病毒2型(PCV2)的分子流行病学及其遗传变异情况,本研究运用实验室已建立的PCR方法对2013~2017年采集自江西省南昌市、宜春市、新余市、赣州市、吉安市、九江市、上饶市、抚州市、景德镇市、鹰潭市等10个地区的1 08... 为掌握江西地区猪圆环病毒2型(PCV2)的分子流行病学及其遗传变异情况,本研究运用实验室已建立的PCR方法对2013~2017年采集自江西省南昌市、宜春市、新余市、赣州市、吉安市、九江市、上饶市、抚州市、景德镇市、鹰潭市等10个地区的1 082份疑似PCV2感染猪病料组织进行病原学检测,并通过PCR扩增、克隆和基因测序对PCV2的全基因组序列进行分析。研究表明,1 082份病料中有610份为PCV2阳性,总阳性率为56.4%,其中2013~2017年阳性率分别为52.7%、48.8%、58.5%、71.0%和67.4%。共获得89株PCV2全基因组序列,其中有83株为PCV2b基因型,其中53株归类于PCV2b-1C基因亚群,30株归为PCV2b-1A/1B基因亚群;6株为PCV2a型。测序毒株与参考毒株ORF2基因核苷酸、氨基酸序列同源性分别为88.9%~100.0%和86.0%~100.0%;氨基酸序列分析表明,Cap蛋白存在20个氨基酸突变位点。本研究表明,江西地区猪群中PCV2的主导基因型为PCV2b,其中又以PCV2b-1C基因亚群占据主导地位,同时也存在少量PCV2a基因型。 展开更多
关键词 江西省 猪圆环病毒2型(PCV2) 全基因组 分子流行病学调查
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2013~2018年江西省猪伪狂犬病病毒流行株gE和gB基因遗传变异分析 被引量:10
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作者 高映雪 蒋新华 +4 位作者 周荷田 罗锋 杨丹凤 万文忠 邓舜洲 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第1期164-173,共10页
为掌握江西省猪伪狂犬病病毒(PRV)的分子流行病学及遗传变异情况,本研究运用实验室已建立的PCR方法对2013~2018年采集自江西南昌、宜春、赣州、吉安、九江、上饶、抚州、新余8个地区的PRV阳性猪病料进行gE和gB基因扩增,并对PCR产物进行... 为掌握江西省猪伪狂犬病病毒(PRV)的分子流行病学及遗传变异情况,本研究运用实验室已建立的PCR方法对2013~2018年采集自江西南昌、宜春、赣州、吉安、九江、上饶、抚州、新余8个地区的PRV阳性猪病料进行gE和gB基因扩增,并对PCR产物进行测序和序列分析。结果显示,共获得64株PRV的gE基因序列和12株PRV的gB基因序列;gE基因遗传进化树表明,64株PRV同属一个大分支,与亚洲毒株及近年来国内分离株亲缘关系较近,全部为GⅠ型,而与GⅡ型的欧美经典毒株亲缘关系较远;江西毒株gE基因与19株参考毒株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.2%~100%和94.6%~100%;gB基因与11株参考毒株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为98.2%~100%和96.5%~100%;相较于Bartha-K61疫苗株,江西流行毒株的gB基因存在碱基缺失、插入和位点突变现象。本研究从分子流行病学角度证实了江西省PRV的流行与变异情况,为江西省科学防控PRV提供理论依据。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病病毒(PRV) 分子流行病学 GE基因 GB基因 遗传变异
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2017年江西部分地区PEDV分子流行病学调查 被引量:4
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作者 蒋新华 周荷田 +4 位作者 罗锋 杨丹凤 张志庆 陈松昌 邓舜洲 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第5期1474-1482,共9页
为了解江西地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行和变异情况,本研究利用RT-PCR方法对2017年采自江西省部分地区规模化猪场182份腹泻仔猪小肠组织和粪便样品进行检测,并设计了2对引物对37份阳性病料的S基因进行扩增、克隆及序列测定,以及与G... 为了解江西地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行和变异情况,本研究利用RT-PCR方法对2017年采自江西省部分地区规模化猪场182份腹泻仔猪小肠组织和粪便样品进行检测,并设计了2对引物对37份阳性病料的S基因进行扩增、克隆及序列测定,以及与GenBank中登录的22株PEDV S基因参考序列进行遗传进化分析。结果显示,37株PEDV江西流行株的S基因序列长为4 158或4 161 bp,编码1 385或1 386个氨基酸,全部为Group 1型,与美国流行毒株较为接近,而与欧洲毒株(Br1/87)及疫苗株(CV777)亲缘关系较远;37株PEDV中有36株为G1-1亚群,1株为G1-2亚群;37株PEDV江西毒株间的S基因核苷酸序列同源性为96.9%~100.0%,氨基酸序列同源性为96.1%~100.0%,与22株参考毒株的核苷酸、氨基酸序列同源性分别为92.7%~100.0%和91.5%~100.0%;相较于CV777疫苗株,PEDV江西流行毒株的S基因存在碱基缺失、插入和位点突变现象。本研究从分子流行病学角度证实了2017年江西部分地区PEDV的流行与变异情况,为指导江西省PEDV的科学防控提供了参考依据。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒(PEDV) 分子流行病学 S基因 遗传变异
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工程微生物合成苯丙酸类化合物及其衍生物的研究进展 被引量:3
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作者 牛福星 杜云平 +2 位作者 黄远斌 周荷田 刘建忠 《合成生物学》 2020年第3期337-357,共21页
苯丙酸类化合物是一类重要的苯丙素类化合物,是指含C6-C3单元的天然有机酸,包括苯丙烯酸类和苯乳酸类化合物。许多苯丙酸类化合物具有抗氧化、抑菌、增强免疫力、抗癌、抗病毒、抗炎、降血脂、治疗心血管疾病等生物学活性,广泛应用于食... 苯丙酸类化合物是一类重要的苯丙素类化合物,是指含C6-C3单元的天然有机酸,包括苯丙烯酸类和苯乳酸类化合物。许多苯丙酸类化合物具有抗氧化、抑菌、增强免疫力、抗癌、抗病毒、抗炎、降血脂、治疗心血管疾病等生物学活性,广泛应用于食品、医药、香料、化妆品、农业等领域。苯丙酸类化合物是经由莽草酸合成途径合成的苯丙氨酸或酪氨酸衍生物。随着代谢工程和合成生物学的发展,成功构建了一些微生物以合成苯丙酸类化合物及其衍生物。为此,本文系统综述了工程微生物合成苯丙酸类化合物及其衍生物的进展,包括肉桂酸、苯乙烯、对香豆酸、对羟基苯乙烯、对香豆酸-莽草酸、咖啡酸、绿原酸、3,4-二羟基苯乙烯、阿魏酸、姜黄素、左旋多巴、苯乳酸、对羟基苯乳酸、丹参素和迷迭香酸。其后,归纳了应用于微生物合成芳香化合物的主要合成生物学策略。最后,对合成苯丙酸类化合物及其衍生物的工程微生物的发展趋势进行了展望。本文旨在为合成苯丙酸类化合物及其衍生物的人工微生物的创制提供指导。 展开更多
关键词 工程微生物 苯丙酸类化合物及其衍生物 代谢工程 合成生物学 生物合成 菌种构建
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微生态制剂在畜禽养殖业中的发展方向研究
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作者 杜云平 余国莲 +4 位作者 刘伟 周庆丰 周荷田 曾娟娟 曹永长 《山西农经》 2019年第14期79-80,共2页
近年来,畜禽微生态制剂的研究与开发如火如荼,使用量逐年增加,已经成为畜禽养殖业发展的有效方式。我国相关部门也加快了养殖业抗生素使用规范的改进与推行,自2020年1月1日起,除中药外的所有促生长类药物饲料添加剂品种将退出市场,这更... 近年来,畜禽微生态制剂的研究与开发如火如荼,使用量逐年增加,已经成为畜禽养殖业发展的有效方式。我国相关部门也加快了养殖业抗生素使用规范的改进与推行,自2020年1月1日起,除中药外的所有促生长类药物饲料添加剂品种将退出市场,这更是畜禽微生态制剂的一个重要发展契机。不仅如此,微生态制剂在调整肠道微生态、疾病治疗、增强畜禽机体免疫力及提高畜禽健康状态等方面具有十分重要的临床意义。 展开更多
关键词 微生态制剂 畜禽业 技术研究
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