卵巢癌肿瘤标记物及早期诊断的研究进展

卵巢癌是严重威胁女性生命健康的恶性肿瘤之一,在女性生殖系统肿瘤中,其致死率居首位,卵巢癌患者早期症状不明显,确诊时常属晚期,而早期发现仍然是降低肿瘤病死率的最有效方法,对于临床上卵巢癌患者的诊断有着极大的考验。近年来,与卵巢癌相关的肿瘤标记物不断被发现,标志物之间进行联合检测,其检测的敏感度及特异度显著提高,一些诊断技术不断完善为卵巢癌的早期发现提供了帮助。文章侧重介绍与糖蛋白有关的卵巢癌生物标记物、miRNA在卵巢癌早期筛查中的应用,为临床卵巢癌早期诊断提供帮助。

外泌体miRNA在卵巢癌诊断中的研究进展

卵巢癌是严重威胁妇女群体生命质量的恶性肿瘤之一,未能发现早期卵巢癌,而晚期缺乏有效的治疗方法是其低生存率的主要原因。MicroRNA (miRNA)在诊断早期卵巢癌方面显示出极大优势,而存在于血液循环中的外泌体miRNA也显示出了巨大潜力,外泌体miRNA的异常表达有助于包括卵巢癌在内的人类肿瘤的发生和发展,越来越多的证据表明其可作为新兴的卵巢癌的早期诊断的标志物。

基于TCGA、GEO数据库联合挖掘胰腺癌诊断和预后生物标志物的研究

我们应用TCGA肿瘤转录组数据库联合GEO基因芯片数据库,通过生物信息学手段挖掘影响胰腺癌诊断和预后的关键基因。方法 通过limma包对TCGA肿瘤转录组数据库中胰腺癌数据进行差异分析得到差异表达基因(DEGs),从GEO数据库获取胰腺癌相关基因芯片数据(GSE15471),利用GEO2R在线工具寻找差异表达基因,将二者取交集后得到共同DEGs。对这些共同DEGs使用string在线数据库进行了蛋白——蛋白相互作用网络分析(PPI),通过GEPIA在线数据库对共同DEGs进行生存分析获得了与生存时间相关的基因(P<0.05)。结果 我们从TCGA胰腺癌相关转录组测序数据和GSE15471基因芯片数据中得到74个共同DEGs,包括52个上调基因和22个下调基因。其中DMBT1,MUC5B,AGR2上调倍数多达38倍;此外我们还发现其中MMP1,ANLN,AREG,ECT2,EREG这5个基因与生存时间存在显著相关性。我们通过蛋白质相互作用网络分析发现,这些共同DEGs之间存在相互作用,其中DMBT1,MUC5B,AGR2,MMP1,ANLN,AREG,ECT2,EREG处于网络的核心位置,且MMP1,ANLN,AREG,ECT2,EREG在生存分析中P<0.05。结论 我们推测DMBT1,MUC5B,AGR2可以作为胰腺癌诊断的marker基因,MMP1,ANLN,AREG,ECT2,EREG可作为预后marker基因。