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一株Ⅲ型WU多瘤病毒的分离培养和全基因组进化分析
1
作者
黄益曼
陈爱珺
+6 位作者
王超
魏田力
呼壮
丛珊珊
谭精晶
姚立红
郑丽舒
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期182-190,共9页
目的分离培养WU多瘤病毒(WU polyomavirus,WUPyV)并分析全基因组系统进化、同源性及种群动态特征。方法采用实时荧光定量PCR检测2020—2022年间北京友谊医院呼吸道感染住院患儿鼻咽抽吸物样本,利用气液两相的原代人呼吸道上皮细胞模型对...
目的分离培养WU多瘤病毒(WU polyomavirus,WUPyV)并分析全基因组系统进化、同源性及种群动态特征。方法采用实时荧光定量PCR检测2020—2022年间北京友谊医院呼吸道感染住院患儿鼻咽抽吸物样本,利用气液两相的原代人呼吸道上皮细胞模型对WUPyV阳性样本进行病毒分离培养,Sanger测序获得全基因组,结合GenBank数据库中已公布的全基因组信息进行系统发育和进化动力学研究。结果WUPyV在2020—2022年的检出率为4.7%(31/659),并成功分离1株Ⅲc型WUPyV临床病毒株BJ0593。WUPyV全基因组及各基因片段同源性较高,VP2基因的平均进化速率约为每年1.256×10^(-4)个氨基酸替换/位点,种群动态在近十年内趋于平缓。结论本研究首次成功分离Ⅲ型WUPyV临床病毒株,为WUPyV的分子进化及致病性研究提供基础。
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关键词
WU多瘤病毒
分离培养
原代人呼吸道上皮细胞
全基因组分析
原文传递
题名
一株Ⅲ型WU多瘤病毒的分离培养和全基因组进化分析
1
作者
黄益曼
陈爱珺
王超
魏田力
呼壮
丛珊珊
谭精晶
姚立红
郑丽舒
机构
中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
首都医科大学附属北京友谊医院儿科
中国医科大学公共卫生学院卫生毒理学教研室
出处
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期182-190,共9页
基金
国家重点研发计划(2022YFC2602202)。
文摘
目的分离培养WU多瘤病毒(WU polyomavirus,WUPyV)并分析全基因组系统进化、同源性及种群动态特征。方法采用实时荧光定量PCR检测2020—2022年间北京友谊医院呼吸道感染住院患儿鼻咽抽吸物样本,利用气液两相的原代人呼吸道上皮细胞模型对WUPyV阳性样本进行病毒分离培养,Sanger测序获得全基因组,结合GenBank数据库中已公布的全基因组信息进行系统发育和进化动力学研究。结果WUPyV在2020—2022年的检出率为4.7%(31/659),并成功分离1株Ⅲc型WUPyV临床病毒株BJ0593。WUPyV全基因组及各基因片段同源性较高,VP2基因的平均进化速率约为每年1.256×10^(-4)个氨基酸替换/位点,种群动态在近十年内趋于平缓。结论本研究首次成功分离Ⅲ型WUPyV临床病毒株,为WUPyV的分子进化及致病性研究提供基础。
关键词
WU多瘤病毒
分离培养
原代人呼吸道上皮细胞
全基因组分析
Keywords
WU polyomavirus
Virus isolation
Human airway epithelial cell
Whole-wide analysis
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一株Ⅲ型WU多瘤病毒的分离培养和全基因组进化分析
黄益曼
陈爱珺
王超
魏田力
呼壮
丛珊珊
谭精晶
姚立红
郑丽舒
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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