为了探讨云南中甸地区3个地方牛种(中甸牦牛、中甸犏牛、中甸黄牛)朊蛋白基因(PRNP)启动子区和第1内含子区2个位点(23 bp和12 bp)的插入/缺失突变与PRNP基因mRNA表达的相关性,采用聚合酶链式反应、琼脂糖电泳及测序等方法对3个牛种的PRN...为了探讨云南中甸地区3个地方牛种(中甸牦牛、中甸犏牛、中甸黄牛)朊蛋白基因(PRNP)启动子区和第1内含子区2个位点(23 bp和12 bp)的插入/缺失突变与PRNP基因mRNA表达的相关性,采用聚合酶链式反应、琼脂糖电泳及测序等方法对3个牛种的PRNP基因23 bp和12 bp位点进行基因分型,比较各组间2个位点的等位基因及基因型分布是否存在差异,并进一步采用荧光定量PCR检测延髓组织内PRNP基因表达水平,分析基因型与基因表达水平的关系。结果表明:中甸牦牛的23 bp InDel缺失纯合(-/-)基因型频率最高(0.838),插入等位基因频率极低(0.09),中甸犏牛(0.467)和中甸黄牛(0.399)的缺失纯合基因型频率也较高;而在12 bp InDel中,3种牛的插入纯合(+/+)基因型频率很高,缺失等位基因频率较低;中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23~-12~+为主,频率为0.794和0.444,而中甸黄牛主单倍型为23^(+)12^(-),频率为0.434。性别、年龄和毛色对3种牛延髓组织中PRNP基因的mRNA表达量无显著影响(P>0.05);3种牛23 bp和12 bp的不同基因型和单倍型之间的mRNA表达量差异均不显著(P>0.05),可能与不同基因型mRNA表达量测定时获得的样品量差异太大有关。研究揭示,23 bp InDel缺失等位基因频率和基因型频率在3种牛中都是最高的,而在12 bp InDel中,缺失等位基因频率和基因型频率均较低,对比以往认为的BSE抗病单倍型23^(+)12^(+),中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23^(-)12^(+)为主,中甸黄牛以23^(+)12^(-)为主,可通过育种改良筛选,培育对BSE有较高抗病性的群体。展开更多
为进一步探究兰坪乌骨绵羊乌质性状形成机理,该试验选取兰坪乌骨绵羊和来自兰坪的普通绵羊各50只作为样本,基于前期全基因组测序筛选的SLC17A8基因(solute carrier family 17 member 8)在兰坪乌骨绵羊具有12个高度连锁、高等位基因频率...为进一步探究兰坪乌骨绵羊乌质性状形成机理,该试验选取兰坪乌骨绵羊和来自兰坪的普通绵羊各50只作为样本,基于前期全基因组测序筛选的SLC17A8基因(solute carrier family 17 member 8)在兰坪乌骨绵羊具有12个高度连锁、高等位基因频率的SNP,故选择该基因作为候选基因,设计11对特异性引物对2个绵羊类群SLC17A8基因12个外显子及其侧翼区进行PCR扩增;通过紫外可见光谱法测定血液黑色素指标(TYR活力、血浆比色、脱黑色素、碱溶性黑色素、真黑色素/总黑色素);分析SLC17A8基因多态性与兰坪乌骨绵羊乌质性状的关联性。结果显示:除脱黑色素外,兰坪乌骨绵羊与普通绵羊其他各项黑色素指标差异显著(P<0.05),兰坪乌骨绵羊TYR活力、血浆比色、真黑色素/总黑色素显著高于普通绵羊;关联分析表明,EX1-G139A位点上CC型绵羊、EX2-C87A位点上AA型绵羊、EX4-C149T位点和EX4-T158C位点上CT型绵羊及EX7-C181T位点和EX7-T195C位点上TT型绵羊TYR活力均显著高于其它基因型绵羊(P<0.05),综上所述,CC、AA、CT和TT型为兰坪乌骨绵羊的优势基因型。展开更多
文摘为了探讨云南中甸地区3个地方牛种(中甸牦牛、中甸犏牛、中甸黄牛)朊蛋白基因(PRNP)启动子区和第1内含子区2个位点(23 bp和12 bp)的插入/缺失突变与PRNP基因mRNA表达的相关性,采用聚合酶链式反应、琼脂糖电泳及测序等方法对3个牛种的PRNP基因23 bp和12 bp位点进行基因分型,比较各组间2个位点的等位基因及基因型分布是否存在差异,并进一步采用荧光定量PCR检测延髓组织内PRNP基因表达水平,分析基因型与基因表达水平的关系。结果表明:中甸牦牛的23 bp InDel缺失纯合(-/-)基因型频率最高(0.838),插入等位基因频率极低(0.09),中甸犏牛(0.467)和中甸黄牛(0.399)的缺失纯合基因型频率也较高;而在12 bp InDel中,3种牛的插入纯合(+/+)基因型频率很高,缺失等位基因频率较低;中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23~-12~+为主,频率为0.794和0.444,而中甸黄牛主单倍型为23^(+)12^(-),频率为0.434。性别、年龄和毛色对3种牛延髓组织中PRNP基因的mRNA表达量无显著影响(P>0.05);3种牛23 bp和12 bp的不同基因型和单倍型之间的mRNA表达量差异均不显著(P>0.05),可能与不同基因型mRNA表达量测定时获得的样品量差异太大有关。研究揭示,23 bp InDel缺失等位基因频率和基因型频率在3种牛中都是最高的,而在12 bp InDel中,缺失等位基因频率和基因型频率均较低,对比以往认为的BSE抗病单倍型23^(+)12^(+),中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23^(-)12^(+)为主,中甸黄牛以23^(+)12^(-)为主,可通过育种改良筛选,培育对BSE有较高抗病性的群体。
文摘为进一步探究兰坪乌骨绵羊乌质性状形成机理,该试验选取兰坪乌骨绵羊和来自兰坪的普通绵羊各50只作为样本,基于前期全基因组测序筛选的SLC17A8基因(solute carrier family 17 member 8)在兰坪乌骨绵羊具有12个高度连锁、高等位基因频率的SNP,故选择该基因作为候选基因,设计11对特异性引物对2个绵羊类群SLC17A8基因12个外显子及其侧翼区进行PCR扩增;通过紫外可见光谱法测定血液黑色素指标(TYR活力、血浆比色、脱黑色素、碱溶性黑色素、真黑色素/总黑色素);分析SLC17A8基因多态性与兰坪乌骨绵羊乌质性状的关联性。结果显示:除脱黑色素外,兰坪乌骨绵羊与普通绵羊其他各项黑色素指标差异显著(P<0.05),兰坪乌骨绵羊TYR活力、血浆比色、真黑色素/总黑色素显著高于普通绵羊;关联分析表明,EX1-G139A位点上CC型绵羊、EX2-C87A位点上AA型绵羊、EX4-C149T位点和EX4-T158C位点上CT型绵羊及EX7-C181T位点和EX7-T195C位点上TT型绵羊TYR活力均显著高于其它基因型绵羊(P<0.05),综上所述,CC、AA、CT和TT型为兰坪乌骨绵羊的优势基因型。