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普通大蓟马MuRhodopsin基因的全长克隆及生物信息学分析
1
作者
金海峰
王朝政
+3 位作者
侯清芳
咸利民
张华剑
吴少英
《热带生物学报》
2023年第6期651-659,共9页
为了解蓟马害虫视蛋白分子结构及特征,根据普通大蓟马(Megalurothrips usitatus)转录组信息克隆获得了视紫红质MuRhodopsin的基因cDNA全长,并利用DNAMan 9.0和SWISSMODEL等软件对视紫红质MuRhodopsin的基因进行序列同源性比对并构建基...
为了解蓟马害虫视蛋白分子结构及特征,根据普通大蓟马(Megalurothrips usitatus)转录组信息克隆获得了视紫红质MuRhodopsin的基因cDNA全长,并利用DNAMan 9.0和SWISSMODEL等软件对视紫红质MuRhodopsin的基因进行序列同源性比对并构建基因系统进化树,分析理化性质及结合域特点,并对该蛋白进行结构预测。结果表明:该基因全长1140 bp,共编码380个氨基酸,相对分子质量为42.73 kDa,理论等电点为8.47。序列比对以及同源性分析结果表明,MuRhodopsin为横纹视紫红质(rhabdomeric opsins,r-opsins)与西花蓟马(Frankliniella occidentalis)及棕榈蓟马(Thrips palmi)具有高度同源性。结构域分析表明该蛋白具有7个跨膜结构域,包含了1个G蛋白偶联受体家族区域,隶属于G蛋白偶联受体家族;具有6个N-豆蔻酰化位点,3个N-糖基化位点,3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,4个蛋白激酶C磷酸化位点;其第322位氨基酸—赖氨酸(K)为与发色团(视黄醛)的重要结合位点,具有典型的视蛋白能够激活IP3/Ca2+信号通路引起光依赖的去极化反应。
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关键词
普通大蓟马
Rhodopsin基因
视蛋白
序列分析
结构预测
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职称材料
题名
普通大蓟马MuRhodopsin基因的全长克隆及生物信息学分析
1
作者
金海峰
王朝政
侯清芳
咸利民
张华剑
吴少英
机构
海南大学三亚南繁研究院
海南大学植物保护学院
海口海关技术中心
出处
《热带生物学报》
2023年第6期651-659,共9页
基金
三亚崖州湾科技城管理局资助项目(SYND-2021-21,HNF202202)
海南省重大科技计划项目(ZDKJ2021007)。
文摘
为了解蓟马害虫视蛋白分子结构及特征,根据普通大蓟马(Megalurothrips usitatus)转录组信息克隆获得了视紫红质MuRhodopsin的基因cDNA全长,并利用DNAMan 9.0和SWISSMODEL等软件对视紫红质MuRhodopsin的基因进行序列同源性比对并构建基因系统进化树,分析理化性质及结合域特点,并对该蛋白进行结构预测。结果表明:该基因全长1140 bp,共编码380个氨基酸,相对分子质量为42.73 kDa,理论等电点为8.47。序列比对以及同源性分析结果表明,MuRhodopsin为横纹视紫红质(rhabdomeric opsins,r-opsins)与西花蓟马(Frankliniella occidentalis)及棕榈蓟马(Thrips palmi)具有高度同源性。结构域分析表明该蛋白具有7个跨膜结构域,包含了1个G蛋白偶联受体家族区域,隶属于G蛋白偶联受体家族;具有6个N-豆蔻酰化位点,3个N-糖基化位点,3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,4个蛋白激酶C磷酸化位点;其第322位氨基酸—赖氨酸(K)为与发色团(视黄醛)的重要结合位点,具有典型的视蛋白能够激活IP3/Ca2+信号通路引起光依赖的去极化反应。
关键词
普通大蓟马
Rhodopsin基因
视蛋白
序列分析
结构预测
Keywords
Megalurothrips usitatus
Rhodopsin gene
opsin
sequence analysis
prediction of structure
分类号
S433.89 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
普通大蓟马MuRhodopsin基因的全长克隆及生物信息学分析
金海峰
王朝政
侯清芳
咸利民
张华剑
吴少英
《热带生物学报》
2023
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